RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588340.1

EFTUD2-210, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-210ENST00000588340 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 GALNT11Q8NCW6 608 aa6.52□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 ATL1Q8WXF7 558 aa6.52□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 COL26A1Q96A83 441 aa6.52□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 PNPLA2Q96AD5 504 aa6.52□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 TM4SF19Q96DZ7 209 aa6.52□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 CABS1Q96KC9 395 aa6.52□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 C10orf90Q96M02 699 aa6.52□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 OR2A5Q96R48 311 aa6.52□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 EHD1Q9H4M9 534 aa6.52□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 NMRAL1Q9HBL8 299 aa6.52□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 SLAMF7Q9NQ25 335 aa6.52□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 SEMA3GQ9NS98 782 aa6.52□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 ABCF3Q9NUQ8 709 aa6.52□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 LUZP4Q9P127 313 aa6.52□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 FBXL4Q9UKA2 621 aa6.52□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 VPS4AQ9UN37 437 aa6.52□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 CDC14AQ9UNH5 594 aa6.52□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 SH2B3Q9UQQ2 575 aa6.52□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa6.52□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa6.52□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 CCDC151A5D8V7 595 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 TRIM49D1C9J1S8 452 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 H7BY64 318 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 TXNDC9O14530 226 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 MAP2K7O14733 419 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 HAT1O14929 419 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 CDH16O75309 829 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 ALOX12BO75342 701 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 GSTA1P08263 222 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 ZGLP1P0C6A0 271 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 EZRP15311 586 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 TFEBP19484 476 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 FBLP22087 321 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 ITGA3P26006 1051 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 MSH2P43246 934 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 SLC12A2P55011 1212 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 CSNK1G2P78368 415 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 OCA2Q04671 838 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 KLC1Q07866 573 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 NAE1Q13564 534 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 CSHL1Q14406 222 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 SETDB1Q15047 1291 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 TBCCQ15814 346 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 RBBP7Q16576 425 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 HKDC1Q2TB90 917 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 TUBB8Q3ZCM7 444 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 VWA2Q5GFL6 755 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 GARNL3Q5VVW2 1013 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 SULT1C3Q6IMI6 304 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 TAOK1Q7L7X3 1001 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 ADCK2Q7Z695 626 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 LAPTM4BQ86VI4 370 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 PLD3Q8IV08 490 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 CYP4X1Q8N118 509 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 TCAIMQ8N3R3 496 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 FAM26EQ8N5C1 309 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 CSNK1A1LQ8N752 337 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 OR11G2Q8NGC1 345 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 STAG3L4Q8TBR4 150 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 STT3BQ8TCJ2 826 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 KCTD4Q8WVF5 259 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 MIEF2Q96C03 454 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 NXNL1Q96CM4 212 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 THAP11Q96EK4 314 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 MVB12AQ96EY5 273 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 SEC16BQ96JE7 1060 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 VPS50Q96JG6 964 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 PRAP1Q96NZ9 151 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 MESP1Q9BRJ9 268 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 HAUS8Q9BT25 410 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 CRB3Q9BUF7 120 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 NT5DC2Q9H857 520 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 TMEM184CQ9NVA4 438 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.1 ms