RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580784.5

CSNK1D-215, Transcript of casein kinase 1 delta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSNK1D, Length 1,081 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1D-215ENST00000580784 B3GALT4O96024 378 aa20.09■□□□□ 0.81
CSNK1D-215ENST00000580784 SERPIND1P05546 499 aa20.09■□□□□ 0.81
CSNK1D-215ENST00000580784 TNFSF10P50591 281 aa20.09■□□□□ 0.81
CSNK1D-215ENST00000580784 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
CSNK1D-215ENST00000580784 ANKRD37Q7Z713 158 aa20.09■□□□□ 0.81
CSNK1D-215ENST00000580784 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
CSNK1D-215ENST00000580784 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa20.09■□□□□ 0.81
CSNK1D-215ENST00000580784 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa20.09■□□□□ 0.81
CSNK1D-215ENST00000580784 OR5T3Q8NGG3 340 aa20.09■□□□□ 0.81
CSNK1D-215ENST00000580784 ANKRD7Q92527 254 aa20.09■□□□□ 0.81
CSNK1D-215ENST00000580784 PEX11GQ96HA9 241 aa20.09■□□□□ 0.81
CSNK1D-215ENST00000580784 SLC22A14Q9Y267 594 aa20.09■□□□□ 0.81
CSNK1D-215ENST00000580784 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa20.09■□□□□ 0.81
CSNK1D-215ENST00000580784 CTAGE15A4D2H0 777 aa20.08■□□□□ 0.81
CSNK1D-215ENST00000580784 DDAH2O95865 285 aa20.08■□□□□ 0.81
CSNK1D-215ENST00000580784 WDPCPO95876 746 aa20.08■□□□□ 0.81
CSNK1D-215ENST00000580784 CYC1P08574 325 aa20.08■□□□□ 0.81
CSNK1D-215ENST00000580784 PWP1Q13610 501 aa20.08■□□□□ 0.81
CSNK1D-215ENST00000580784 HERC3Q15034 1050 aa20.08■□□□□ 0.81
CSNK1D-215ENST00000580784 CTAGE6Q86UF2 777 aa20.08■□□□□ 0.81
CSNK1D-215ENST00000580784 BBOF1Q8ND07 529 aa20.08■□□□□ 0.81
CSNK1D-215ENST00000580784 ERP44Q9BS26 406 aa20.08■□□□□ 0.81
CSNK1D-215ENST00000580784 MCMBPQ9BTE3 642 aa20.08■□□□□ 0.81
CSNK1D-215ENST00000580784 RBCK1Q9BYM8 510 aa20.08■□□□□ 0.81
CSNK1D-215ENST00000580784 RHOJQ9H4E5 214 aa20.08■□□□□ 0.81
CSNK1D-215ENST00000580784 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
CSNK1D-215ENST00000580784 ZFP69BQ9UJL9 534 aa20.08■□□□□ 0.81
CSNK1D-215ENST00000580784 DYRK1BQ9Y463 629 aa20.08■□□□□ 0.81
CSNK1D-215ENST00000580784 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
CSNK1D-215ENST00000580784 A1L4Q6 167 aa20.07■□□□□ 0.8
CSNK1D-215ENST00000580784 WIPF3A6NGB9 483 aa20.07■□□□□ 0.8
CSNK1D-215ENST00000580784 A8MUI8 341 aa20.07■□□□□ 0.8
CSNK1D-215ENST00000580784 E2F3O00716 465 aa20.07■□□□□ 0.8
CSNK1D-215ENST00000580784 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
CSNK1D-215ENST00000580784 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
CSNK1D-215ENST00000580784 SSTR1P30872 391 aa20.07■□□□□ 0.8
CSNK1D-215ENST00000580784 SCTRP47872 440 aa20.07■□□□□ 0.8
CSNK1D-215ENST00000580784 AP2B1P63010 937 aa20.07■□□□□ 0.8
CSNK1D-215ENST00000580784 CALCOCO2Q13137 446 aa20.07■□□□□ 0.8
CSNK1D-215ENST00000580784 TSNQ15631 228 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
CSNK1D-215ENST00000580784 BTBD16Q32M84 506 aa20.07■□□□□ 0.8
CSNK1D-215ENST00000580784 DEFB134Q4QY38 66 aa20.07■□□□□ 0.8
CSNK1D-215ENST00000580784 C4orf17Q53FE4 359 aa20.07■□□□□ 0.8
CSNK1D-215ENST00000580784 TBC1D19Q8N5T2 526 aa20.07■□□□□ 0.8
CSNK1D-215ENST00000580784 SPATA4Q8NEY3 305 aa20.07■□□□□ 0.8
CSNK1D-215ENST00000580784 NT5CQ8TCD5 201 aa20.07■□□□□ 0.8
CSNK1D-215ENST00000580784 PYROXD1Q8WU10 500 aa20.07■□□□□ 0.8
CSNK1D-215ENST00000580784 VPS39Q96JC1 886 aa20.07■□□□□ 0.8
CSNK1D-215ENST00000580784 EGFL8Q99944 293 aa20.07■□□□□ 0.8
CSNK1D-215ENST00000580784 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP20.07■□□□□ 0.8
CSNK1D-215ENST00000580784 GPAMQ9HCL2 828 aa20.07■□□□□ 0.8
CSNK1D-215ENST00000580784 SAYSD1Q9NPB0 183 aa20.07■□□□□ 0.8
CSNK1D-215ENST00000580784 LANCL2Q9NS86 450 aa20.07■□□□□ 0.8
CSNK1D-215ENST00000580784 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa20.07■□□□□ 0.8
CSNK1D-215ENST00000580784 STMN3Q9NZ72 180 aa20.07■□□□□ 0.8
CSNK1D-215ENST00000580784 WHRNQ9P202 907 aa20.07■□□□□ 0.8
CSNK1D-215ENST00000580784 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa20.07■□□□□ 0.8
CSNK1D-215ENST00000580784 SLC5A6Q9Y289 635 aa20.07■□□□□ 0.8
CSNK1D-215ENST00000580784 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
CSNK1D-215ENST00000580784 OARD1Q9Y530 152 aa20.07■□□□□ 0.8
CSNK1D-215ENST00000580784 TRAV17A0A0B4J275 112 aa20.06■□□□□ 0.8
CSNK1D-215ENST00000580784 FAM187AA6NFU0 413 aa20.06■□□□□ 0.8
CSNK1D-215ENST00000580784 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
CSNK1D-215ENST00000580784 NDC80O14777 642 aa20.06■□□□□ 0.8
CSNK1D-215ENST00000580784 RAD51CO43502 376 aa20.06■□□□□ 0.8
CSNK1D-215ENST00000580784 LDLRP01130 860 aa20.06■□□□□ 0.8
CSNK1D-215ENST00000580784 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
CSNK1D-215ENST00000580784 EDN3P14138 238 aa20.06■□□□□ 0.8
CSNK1D-215ENST00000580784 ALOX12P18054 663 aa20.06■□□□□ 0.8
CSNK1D-215ENST00000580784 AGTR2P50052 363 aa20.06■□□□□ 0.8
CSNK1D-215ENST00000580784 OLR1P78380 273 aa20.06■□□□□ 0.8
CSNK1D-215ENST00000580784 RHAGQ02094 409 aa20.06■□□□□ 0.8
CSNK1D-215ENST00000580784 ZNF33BQ06732 778 aa20.06■□□□□ 0.8
CSNK1D-215ENST00000580784 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
CSNK1D-215ENST00000580784 ABHD17BQ5VST6 288 aa20.06■□□□□ 0.8
CSNK1D-215ENST00000580784 PLAG1Q6DJT9 500 aa20.06■□□□□ 0.8
CSNK1D-215ENST00000580784 NXPE4Q6UWF7 544 aa20.06■□□□□ 0.8
CSNK1D-215ENST00000580784 FAM180AQ6UWF9 173 aa20.06■□□□□ 0.8
CSNK1D-215ENST00000580784 ANKRD53Q8N9V6 530 aa20.06■□□□□ 0.8
CSNK1D-215ENST00000580784 PLPP5Q8NEB5 264 aa20.06■□□□□ 0.8
CSNK1D-215ENST00000580784 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
CSNK1D-215ENST00000580784 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
CSNK1D-215ENST00000580784 PELI2Q9HAT8 420 aa20.06■□□□□ 0.8
CSNK1D-215ENST00000580784 KCNE2Q9Y6J6 123 aa20.06■□□□□ 0.8
CSNK1D-215ENST00000580784 CHST10O43529 356 aa20.05■□□□□ 0.8
CSNK1D-215ENST00000580784 IL10P22301 178 aa20.05■□□□□ 0.8
CSNK1D-215ENST00000580784 AHRP35869 848 aa20.05■□□□□ 0.8
CSNK1D-215ENST00000580784 HNF4AP41235 474 aa20.05■□□□□ 0.8
CSNK1D-215ENST00000580784 GDF5P43026 501 aa20.05■□□□□ 0.8
CSNK1D-215ENST00000580784 CDKL1Q00532 357 aa20.05■□□□□ 0.8
CSNK1D-215ENST00000580784 REEP5Q00765 189 aa20.05■□□□□ 0.8
CSNK1D-215ENST00000580784 RGS1Q08116 209 aa20.05■□□□□ 0.8
CSNK1D-215ENST00000580784 C2orf54Q08AI8 447 aa20.05■□□□□ 0.8
CSNK1D-215ENST00000580784 ABRAXAS2Q15018 415 aa20.05■□□□□ 0.8
CSNK1D-215ENST00000580784 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
CSNK1D-215ENST00000580784 NSDHLQ15738 373 aa20.05■□□□□ 0.8
CSNK1D-215ENST00000580784 SFT2D3Q587I9 215 aa20.05■□□□□ 0.8
CSNK1D-215ENST00000580784 FCRLBQ6BAA4 426 aa20.05■□□□□ 0.8
CSNK1D-215ENST00000580784 MAATS1Q7Z4T9 603 aa20.05■□□□□ 0.8
CSNK1D-215ENST00000580784 TMPRSS11BQ86T26 416 aa20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.3 ms