RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580654.5

SMARCE1-217, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 5

Gene SMARCE1, Length 554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-217ENST00000580654 LRRD1A4D1F6 860 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 HSPB2A8KAH6 182 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 H0YIG0 161 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 AQP7O14520 342 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 DVL2O14641 736 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 OR1I1O60431 355 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 PROSCO94903 275 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 SOX30O94993 753 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 NSA2O95478 260 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 CRTAMO95727 393 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 MAGEA5P43359 124 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 BDKRB1P46663 353 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 WNT3P56703 355 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 DYNLT1P63172 113 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 DMTNQ08495 405 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 HSPA14Q0VDF9 509 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 ABRAXAS2Q15018 415 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 NSDHLQ15738 373 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 HSPB2Q16082 182 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 ZNF425Q6IV72 752 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 PACS1Q6VY07 963 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 PID1Q7Z2X4 250 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 TMEM251Q8N6I4 163 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 TNIP2Q8NFZ5 429 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 OR2M7Q8NG81 312 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 PIGTQ969N2 578 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 CCDC138Q96M89 665 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 YIPF4Q9BSR8 244 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 C19orf24Q9BVV8 132 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 ACAT2Q9BWD1 397 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 RBCK1Q9BYM8 510 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 SPRR3Q9UBC9 169 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 RSPH14Q9UHP6 348 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 NFS1Q9Y697 457 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 OR51F1A6NGY5 319 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 IQCF5A8MTL0 148 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 MAGEB17A8MXT2 336 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 SGK494L7N484 410 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 QSOX1O00391 747 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 VPS26AO75436 327 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 C1orf105O95561 183 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 RPN2P04844 631 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 TPM2P07951 284 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 IL1RNP18510 177 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 CMPK1P30085 196 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 FOXN2P32314 431 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 BCL6P41182 706 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 AVPR1BP47901 424 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 PTH2RP49190 550 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 ZNF136P52737 540 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 OR4D2P58180 307 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 SORDQ00796 357 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 PLGLB1Q02325 96 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 KLHL30Q0D2K2 578 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 ITIH4Q14624 930 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 VSIG1Q86XK7 387 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 PDSS2Q86YH6 399 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 RFX6Q8HWS3 928 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 PLD3Q8IV08 490 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 PSD4Q8NDX1 1056 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 SMPDL3BQ92485 455 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 RAD51AP1Q96B01 352 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 CAPZA3Q96KX2 299 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 MACROD1Q9BQ69 325 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 GSX2Q9BZM3 304 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 ALKBH4Q9NXW9 302 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 KCMF1Q9P0J7 381 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 ACAD8Q9UKU7 415 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 DUSP10Q9Y6W6 482 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 SVEP1Q4LDE5 3571 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 LRRC10BA6NIK2 292 aa7.11□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 G3V3Y1 287 aa7.11□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 ACOT7O00154 380 aa7.11□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 FCHO1O14526 889 aa7.11□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 HAT1O14929 419 aa7.11□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 SUSD5O60279 629 aa7.11□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 PHF2O75151 1096 aa7.11□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 RDH16O75452 317 aa7.11□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 ITGA10O75578 1167 aa7.11□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 TUBB4AP04350 444 aa7.11□□□□□ -1.27
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