RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574217.1

PRPF8-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 8, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF8, Length 310 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8-210ENST00000574217 NPHS2Q9NP85 383 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF8-210ENST00000574217 DMRT3Q9NQL9 472 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF8-210ENST00000574217 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PRPF8-210ENST00000574217 OCIAD1Q9NX40 245 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF8-210ENST00000574217 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
PRPF8-210ENST00000574217 PLCL2Q9UPR0 1127 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF8-210ENST00000574217 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF8-210ENST00000574217 LOXL2Q9Y4K0 774 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF8-210ENST00000574217 USH1CQ9Y6N9 552 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF8-210ENST00000574217 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF8-210ENST00000574217 SPTBN2O15020 2390 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 SERTM1A2A2V5 107 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 EFCAB7A8K855 629 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 MAGEB17A8MXT2 336 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 H0YGG7 62 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 SLC28A1O00337 649 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 TXNDC9O14530 226 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 PLD2O14939 933 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 RGS14O43566 566 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 BRINP1O60477 761 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 DIAPH2O60879 1101 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 TGFB1P01137 390 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 JUNP05412 331 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 SERPINA6P08185 405 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 LINC00032P0C843 101 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 C1QTNF9P0C862 333 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 JMJD7P0C870 316 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 CCL4P13236 92 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 FOLR1P15328 257 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 GABRA4P48169 554 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 MAPK10P53779 464 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 AQP5P55064 265 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 RPS13P62277 151 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 FOXK2Q01167 660 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 ACY1Q03154 408 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 BTKQ06187 659 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 TUBB3Q13509 450 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 PWP1Q13610 501 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 RTP5Q14D33 572 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 GPR19Q15760 415 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 TCTE1Q5JU00 501 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 SPDYAQ5MJ70 313 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 WASHC2DQ5SRD0 308 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 FAM219BQ5XKK7 198 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 CYB5D1Q6P9G0 228 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 SCIMPQ6UWF3 145 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 CHSY3Q70JA7 882 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 TRIM46Q7Z4K8 759 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 VN1R5Q7Z5H4 357 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 VN1R4Q7Z5H5 301 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 GPR135Q8IZ08 494 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 OR4N4Q8N0Y3 316 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 RNF175Q8N4F7 328 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 CSNK1A1LQ8N752 337 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 CREB3L4Q8TEY5 395 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 NXPE2Q96DL1 559 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 CMTM7Q96FZ5 175 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 PPP1R36Q96LQ0 422 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 SERPINI1Q99574 410 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 CMKLR1Q99788 373 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 MS4A8Q9BY19 250 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 ACPTQ9BZG2 426 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 FAM107BQ9H098 131 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 EPN3Q9H201 632 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 TUBB1Q9H4B7 451 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 MEAF6Q9HAF1 191 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 FGF21Q9NSA1 209 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 RIC8BQ9NVN3 520 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 NMRK1Q9NWW6 199 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 IRAK4Q9NWZ3 460 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 PSD3Q9NYI0 1048 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 VPS29Q9UBQ0 182 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 PISDQ9UG56 409 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 DCTN4Q9UJW0 460 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 PPT2Q9UMR5 302 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 SLC12A4Q9UP95 1085 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 AK5Q9Y6K8 562 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 CACNA1AO00555 2505 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 AKAP13Q12802 2813 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 KNTC1P50748 2209 aa6.38□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 A0A0G2JND7 137 aa6.38□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa6.38□□□□□ -1.39
PRPF8-210ENST00000574217 LRIT2A6NDA9 550 aa6.38□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms