RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-205ENST00000563559 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa17.72■□□□□ 0.43
RRN3-205ENST00000563559 HELZP42694 1942 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
RRN3-205ENST00000563559 OR2A25A4D2G3 310 aa17.72■□□□□ 0.43
RRN3-205ENST00000563559 NTRK1P04629 796 aa17.72■□□□□ 0.43
RRN3-205ENST00000563559 ADH1AP07327 375 aa17.72■□□□□ 0.43
RRN3-205ENST00000563559 PREPP48147 710 aa17.72■□□□□ 0.43
RRN3-205ENST00000563559 CCR3P51677 355 aa17.72■□□□□ 0.43
RRN3-205ENST00000563559 CRYBA2P53672 197 aa17.72■□□□□ 0.43
RRN3-205ENST00000563559 VBP1P61758 197 aa17.72■□□□□ 0.43
RRN3-205ENST00000563559 ZNF763Q0D2J5 394 aa17.72■□□□□ 0.43
RRN3-205ENST00000563559 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
RRN3-205ENST00000563559 GAB1Q13480 694 aa17.72■□□□□ 0.43
RRN3-205ENST00000563559 OXA1LQ15070 435 aa17.72■□□□□ 0.43
RRN3-205ENST00000563559 ARSIQ5FYB1 569 aa17.72■□□□□ 0.43
RRN3-205ENST00000563559 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP17.72■□□□□ 0.43
RRN3-205ENST00000563559 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa17.72■□□□□ 0.43
RRN3-205ENST00000563559 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa17.72■□□□□ 0.43
RRN3-205ENST00000563559 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
RRN3-205ENST00000563559 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
RRN3-205ENST00000563559 NAGSQ8N159 534 aa17.72■□□□□ 0.43
RRN3-205ENST00000563559 KREMEN2Q8NCW0 462 aa17.72■□□□□ 0.43
RRN3-205ENST00000563559 ITFG2Q969R8 447 aa17.72■□□□□ 0.43
RRN3-205ENST00000563559 LGALS12Q96DT0 336 aa17.72■□□□□ 0.43
RRN3-205ENST00000563559 DEFB118Q96PH6 123 aa17.72■□□□□ 0.43
RRN3-205ENST00000563559 EPHX3Q9H6B9 360 aa17.72■□□□□ 0.43
RRN3-205ENST00000563559 REEP4Q9H6H4 257 aa17.72■□□□□ 0.43
RRN3-205ENST00000563559 SELENONQ9NZV5 590 aa17.72■□□□□ 0.43
RRN3-205ENST00000563559 DKK3Q9UBP4 350 aa17.72■□□□□ 0.43
RRN3-205ENST00000563559 DAPK2Q9UIK4 370 aa17.72■□□□□ 0.43
RRN3-205ENST00000563559 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa17.72■□□□□ 0.43
RRN3-205ENST00000563559 TNFRSF11BO00300 401 aa17.71■□□□□ 0.43
RRN3-205ENST00000563559 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
RRN3-205ENST00000563559 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
RRN3-205ENST00000563559 NPC1O15118 1278 aa17.71■□□□□ 0.43
RRN3-205ENST00000563559 FGF19O95750 216 aa17.71■□□□□ 0.43
RRN3-205ENST00000563559 ANXA8P13928 327 aa17.71■□□□□ 0.43
RRN3-205ENST00000563559 ITGA2P17301 1181 aa17.71■□□□□ 0.43
RRN3-205ENST00000563559 BDKRB1P46663 353 aa17.71■□□□□ 0.43
RRN3-205ENST00000563559 CTSCP53634 463 aa17.71■□□□□ 0.43
RRN3-205ENST00000563559 RPS13P62277 151 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
RRN3-205ENST00000563559 FCHO2Q0JRZ9 810 aa17.71■□□□□ 0.43
RRN3-205ENST00000563559 SF1Q15637 639 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
RRN3-205ENST00000563559 PAGE2BQ5JRK9 111 aa17.71■□□□□ 0.43
RRN3-205ENST00000563559 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
RRN3-205ENST00000563559 AHSA2Q719I0 299 aa17.71■□□□□ 0.43
RRN3-205ENST00000563559 NRSN1Q8IZ57 195 aa17.71■□□□□ 0.43
RRN3-205ENST00000563559 GPR156Q8NFN8 814 aa17.71■□□□□ 0.43
RRN3-205ENST00000563559 SPPL2AQ8TCT8 520 aa17.71■□□□□ 0.43
RRN3-205ENST00000563559 MYDGFQ969H8 173 aa17.71■□□□□ 0.43
RRN3-205ENST00000563559 MAL2Q969L2 176 aa17.71■□□□□ 0.43
RRN3-205ENST00000563559 ALPK1Q96QP1 1244 aa17.71■□□□□ 0.43
RRN3-205ENST00000563559 MYOCQ99972 504 aa17.71■□□□□ 0.43
RRN3-205ENST00000563559 EFCAB11Q9BUY7 163 aa17.71■□□□□ 0.43
RRN3-205ENST00000563559 ITPAQ9BY32 194 aa17.71■□□□□ 0.43
RRN3-205ENST00000563559 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
RRN3-205ENST00000563559 SPHK2Q9NRA0 654 aa17.71■□□□□ 0.43
RRN3-205ENST00000563559 OGDHLQ9ULD0 1010 aa17.71■□□□□ 0.43
RRN3-205ENST00000563559 CD36P16671 472 aa17.71■□□□□ 0.42
RRN3-205ENST00000563559 GGT2P36268 569 aa17.71■□□□□ 0.42
RRN3-205ENST00000563559 CRATP43155 626 aa17.71■□□□□ 0.42
RRN3-205ENST00000563559 TUBA1BP68363 451 aa17.71■□□□□ 0.42
RRN3-205ENST00000563559 DEFB115Q30KQ5 88 aa17.71■□□□□ 0.42
RRN3-205ENST00000563559 CCSMST1Q4G0I0 132 aa17.71■□□□□ 0.42
RRN3-205ENST00000563559 ZNF805Q5CZA5 627 aa17.71■□□□□ 0.42
RRN3-205ENST00000563559 TUBA1AQ71U36 451 aa17.71■□□□□ 0.42
RRN3-205ENST00000563559 FAM124AQ86V42 546 aa17.71■□□□□ 0.42
RRN3-205ENST00000563559 PLD3Q8IV08 490 aa17.71■□□□□ 0.42
RRN3-205ENST00000563559 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa17.71■□□□□ 0.42
RRN3-205ENST00000563559 APH1BQ8WW43 257 aa17.71■□□□□ 0.42
RRN3-205ENST00000563559 NEIL2Q969S2 332 aa17.71■□□□□ 0.42
RRN3-205ENST00000563559 VWCEQ96DN2 955 aa17.71■□□□□ 0.42
RRN3-205ENST00000563559 WDR34Q96EX3 536 aa17.71■□□□□ 0.42
RRN3-205ENST00000563559 NDUFAF4Q9P032 175 aa17.71■□□□□ 0.42
RRN3-205ENST00000563559 TBC1D14Q9P2M4 693 aa17.71■□□□□ 0.42
RRN3-205ENST00000563559 IL36AQ9UHA7 158 aa17.71■□□□□ 0.42
RRN3-205ENST00000563559 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa17.71■□□□□ 0.42
RRN3-205ENST00000563559 A8MVJ9 347 aa17.7■□□□□ 0.42
RRN3-205ENST00000563559 H3BM21 787 aa17.7■□□□□ 0.42
RRN3-205ENST00000563559 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa17.7■□□□□ 0.42
RRN3-205ENST00000563559 TOR1BO14657 336 aa17.7■□□□□ 0.42
RRN3-205ENST00000563559 FGF18O76093 207 aa17.7■□□□□ 0.42
RRN3-205ENST00000563559 IFNA14P01570 189 aa17.7■□□□□ 0.42
RRN3-205ENST00000563559 ALOX5P09917 674 aa17.7■□□□□ 0.42
RRN3-205ENST00000563559 AQP1P29972 269 aa17.7■□□□□ 0.42
RRN3-205ENST00000563559 LSM3P62310 102 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
RRN3-205ENST00000563559 DEFB103AP81534 67 aa17.7■□□□□ 0.42
RRN3-205ENST00000563559 TEKQ02763 1124 aa17.7■□□□□ 0.42
RRN3-205ENST00000563559 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP17.7■□□□□ 0.42
RRN3-205ENST00000563559 IFI44LQ53G44 452 aa17.7■□□□□ 0.42
RRN3-205ENST00000563559 GCNT6Q5T4J0 391 aa17.7■□□□□ 0.42
RRN3-205ENST00000563559 ERAP2Q6P179 960 aa17.7■□□□□ 0.42
RRN3-205ENST00000563559 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa17.7■□□□□ 0.42
RRN3-205ENST00000563559 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP17.7■□□□□ 0.42
RRN3-205ENST00000563559 TMPRSS11BQ86T26 416 aa17.7■□□□□ 0.42
RRN3-205ENST00000563559 OR52N2Q8NGI0 321 aa17.7■□□□□ 0.42
RRN3-205ENST00000563559 SLC38A4Q969I6 547 aa17.7■□□□□ 0.42
RRN3-205ENST00000563559 AP2M1Q96CW1 435 aa17.7■□□□□ 0.42
RRN3-205ENST00000563559 ITPKCQ96DU7 683 aa17.7■□□□□ 0.42
RRN3-205ENST00000563559 COPS4Q9BT78 406 aa17.7■□□□□ 0.42
RRN3-205ENST00000563559 RNF6Q9Y252 685 aa17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms