RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557654.5

GPHN-215, Transcript of gephyrin, human

TSL 4

Gene GPHN, Length 503 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPHN-215	ENST00000557654	CARD6	Q9BX69	1037 aa		4.18	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		4.18	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	PITPNM3	Q9BZ71	974 aa		4.18	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	GPR88	Q9GZN0	384 aa		4.18	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	TLE6	Q9H808	572 aa		4.18	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	ANKZF1	Q9H8Y5	726 aa		4.18	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	RPS10P5	Q9NQ39	176 aa		4.18	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	STK26	Q9P289	416 aa		4.18	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		4.18	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		4.18	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		4.18	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	DIP2A	Q14689	1571 aa		4.18	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	KDR	P35968	1356 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	MED23	Q9ULK4	1368 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	C3	P01024	1663 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	SNURFL	B1AK76	121 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654		H3BQF6	201 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	ARPC2	O15144	300 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	ERLIN1	O75477	346 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	PSMD10	O75832	226 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	LMAN1	P49257	510 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	CSNK2B	P67870	215 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	IDI1	Q13907	227 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	MTF1	Q14872	753 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	EXT1	Q16394	746 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	C2CD6	Q53TS8	623 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	BEND6	Q5SZJ8	279 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	WLS	Q5T9L3	541 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	PRR27	Q6MZM9	219 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	CFAP161	Q6P656	301 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	CCDC91	Q7Z6B0	441 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	VSTM4	Q8IW00	320 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	KLHDC1	Q8N7A1	406 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	TC2N	Q8N9U0	490 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	AVL9	Q8NBF6	648 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	TSPAN14	Q8NG11	270 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	OR10Q1	Q8NGQ4	319 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	COG3	Q96JB2	828 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	KRT12	Q99456	494 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	DCTN5	Q9BTE1	182 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	NOL11	Q9H8H0	719 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	VIPAS39	Q9H9C1	493 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	MED4	Q9NPJ6	270 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	NUDT4	Q9NZJ9	180 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	IFNK	Q9P0W0	207 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	THEG	Q9P2T0	379 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654		R4GN57	208 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	NEDD4	P46934	1319 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	CPS1	P31327	1500 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	CHD1	O14646	1710 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	TECPR2	O15040	1411 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	NCAPD2	Q15021	1401 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	STX10	O60499	249 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	PFKFB2	O60825	505 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	YEATS4	O95619	227 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	CCDC172	P0C7W6	258 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	TRIM49	P0CI25	452 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	TRIM49C	P0CI26	452 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	UGT1A4	P22310	534 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	CCR3	P51677	355 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	ZNF74	Q16587	644 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	VWC2	Q2TAL6	325 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	PAQR6	Q6TCH4	344 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	LRRC31	Q6UY01	552 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	CEP112	Q8N8E3	955 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	SLC4A11	Q8NBS3	891 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	OR4K1	Q8NGD4	311 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	OR6S1	Q8NH40	331 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	FAM71F1	Q96KD3	344 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	ZNF300	Q96RE9	604 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654		Q9H8V8	135 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	TRPV4	Q9HBA0	871 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	ANAPC2	Q9UJX6	822 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	AKAP12	Q02952	1782 aa		4.16	□□□□□ -1.74

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