RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552210.1

ANKS1B-227, Transcript of ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1B, human

TSL 4

Gene ANKS1B, Length 542 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ANKS1B-227	ENST00000552210	VPS39	Q96JC1	886 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	GCNA	Q96QF7	691 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	TRIB3	Q96RU7	358 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	PRR25	Q96S07	402 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	KLF6	Q99612	283 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	PIP5K1A	Q99755	562 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	SEMA3C	Q99985	751 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	PAIP2	Q9BPZ3	127 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	CINP	Q9BW66	212 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	TSSK1B	Q9BXA7	367 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	UGT1A7	Q9HAW7	530 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	UGT1A10	Q9HAW8	530 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	UGT1A8	Q9HAW9	530 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	POPDC3	Q9HBV1	291 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	SNX15	Q9NRS6	342 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	THAP1	Q9NVV9	213 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	HACD3	Q9P035	362 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	BAG5	Q9UL15	447 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	SLC12A4	Q9UP95	1085 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	OR51B4	Q9Y5P0	310 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	SNX8	Q9Y5X2	465 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	TET1	Q8NFU7	2136 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210		A0A096LPK6	155 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210		A0A0D9SEW6	157 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	PABPN1L	A6NDY0	278 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	CFAP73	A6NFT4	308 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210		H7C0S8	307 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	GOLGA8R	I6L899	631 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	INSIG1	O15503	277 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	SPRY2	O43597	315 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	LDB2	O43679	373 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	TMPRSS11D	O60235	418 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	PIAS1	O75925	651 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	VAPB	O95292	243 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	CXCL14	O95715	111 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	GSR	P00390	522 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	PENK	P01210	267 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	FSHB	P01225	129 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	SERPINE1	P05121	402 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	PRKCG	P05129	697 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	C2	P06681	752 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	CD72	P21854	359 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	CCT8	P50990	548 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	DGKQ	P52824	942 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	CDH15	P55291	814 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	FOXL2	P58012	376 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	C1QTNF8	P60827	252 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	RAB10	P61026	200 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	NAA20	P61599	178 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	BST1	Q10588	318 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	BNIP1	Q12981	228 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	OLIG2	Q13516	323 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	DMC1	Q14565	340 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	POU6F1	Q14863	301 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	CYTH1	Q15438	398 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	TAF11	Q15544	211 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	TAF1A	Q15573	450 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	CNGA3	Q16281	694 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	SIRPB2	Q5JXA9	342 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	SH2D4B	Q5SQS7	431 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	RFWD3	Q6PCD5	774 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	INO80C	Q6PI98	192 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	CES3	Q6UWW8	571 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	NUDCD3	Q8IVD9	361 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	PTGR2	Q8N8N7	351 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	OR13J1	Q8NGT2	312 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	FIBIN	Q8TAL6	211 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	C10orf82	Q8WW14	230 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	ISG20	Q96AZ6	181 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	SH3KBP1	Q96B97	665 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	OTUB2	Q96DC9	234 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	ALG14	Q96F25	216 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	VPS50	Q96JG6	964 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	TSNARE1	Q96NA8	513 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	AGAP2	Q99490	1192 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	APOL2	Q9BQE5	337 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	FEM1A	Q9BSK4	669 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	DUSP26	Q9BV47	211 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	TDRD1	Q9BXT4	1180 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	ADGRE3	Q9BY15	652 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	TASP1	Q9H6P5	420 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	ZNF334	Q9HCZ1	680 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	SAR1A	Q9NR31	198 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	ASAH2	Q9NR71	780 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	GKN1	Q9NS71	199 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	IARS2	Q9NSE4	1012 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	TXLNG	Q9NUQ3	528 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	COPG2	Q9UBF2	871 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ANKS1B-227	ENST00000552210	TLK1	Q9UKI8	766 aa		4.95	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms