RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 CST9Q5W186 159 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 SCIMPQ6UWF3 145 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 TPRG1Q6ZUI0 275 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 ADIPOR2Q86V24 386 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 OR14K1Q8NGZ2 314 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 GAL3ST4Q96RP7 486 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 FUNDC2Q9BWH2 189 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 ADAMTS10Q9H324 1103 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM9BQ9NQ34 198 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 OBP2AQ9NY56 170 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 GPRC5BQ9NZH0 403 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 SHOC2Q9UQ13 582 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 INVSQ9Y283 1065 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 RGPD5Q99666 1765 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 CPED1A4D0V7 1026 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 DBX1A6NMT0 343 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 WASH4PA8MWX3 477 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 ISM1B1AKI9 464 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 E7ENX8 843 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 H0Y8G0 127 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 CLCN5P51795 746 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 KCNK10P57789 538 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 NCS1P62166 190 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 PTGR1Q14914 329 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF805Q5CZA5 627 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 ATG9BQ674R7 924 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 MZT2AQ6P582 158 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 XKR5Q6UX68 686 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 KATNAL2Q8IYT4 538 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 FAM71DQ8N9W8 422 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 SNX33Q8WV41 574 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 FAM3CQ92520 227 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 SLC41A3Q96GZ6 507 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 CITED1Q99966 193 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 CFHR5Q9BXR6 569 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 TTYH3Q9C0H2 523 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 METTL9Q9H1A3 318 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 OCEL1Q9H607 264 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF556Q9HAH1 456 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 GKN1Q9NS71 199 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 FTSJ1Q9UET6 329 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 ACOT9Q9Y305 439 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 CACNG2Q9Y698 323 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 A0A1W2PPW3 197 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 A0A1W2PRU2 124 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 SHISA7A6NL88 538 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 AKR7A2O43488 359 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 PLOD3O60568 738 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 IFNA21P01568 189 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 TCF4P15884 667 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 CERS1P27544 350 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 IL2P60568 153 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 SLC10A7Q0GE19 358 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 BATFQ16520 125 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 SMTNL2Q2TAL5 461 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 CERCAMQ5T4B2 595 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 MBLAC2Q68D91 279 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 UNC5AQ6ZN44 842 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM126BQ8IUX1 230 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 ARMC10Q8N2F6 343 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 OR56A4Q8NGH8 313 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 NXPE2Q96DL1 559 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 SPHK1Q9NYA1 384 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 IL37Q9NZH6 218 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 IL36AQ9UHA7 158 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 A0A087X0B3 334 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 SLC31A2O15432 143 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 PAGE1O75459 146 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 OPN1MWP04001 364 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 OPN1MW2P0DN77 364 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 OPN1MW3P0DN78 364 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 PBX3P40426 434 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 TGM4P49221 684 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 AQP4P55087 323 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 CBLBQ13191 982 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 ARHGAP19Q14CB8 494 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 TEX30Q5JUR7 227 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 FAM69AQ5T7M9 428 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 C1orf185Q5T7R7 199 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF529Q6P280 563 aa6.12□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms