RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 MUSKO15146 869 aa8.24□□□□□ -1.09
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PTPRB-208ENST00000550358 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-208ENST00000550358 CHRNA4P43681 627 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-208ENST00000550358 TM4SF4P48230 202 aa8.24□□□□□ -1.09
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PTPRB-208ENST00000550358 DHCR24Q15392 516 aa8.24□□□□□ -1.09
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PTPRB-208ENST00000550358 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
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PTPRB-208ENST00000550358 RNF39Q9H2S5 420 aa8.23□□□□□ -1.09
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PTPRB-208ENST00000550358 EPCAMP16422 314 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-208ENST00000550358 FDXRP22570 491 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-208ENST00000550358 HTR1EP28566 365 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-208ENST00000550358 LMAN2Q12907 356 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-208ENST00000550358 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-208ENST00000550358 TGFBIQ15582 683 aa8.23□□□□□ -1.09
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