RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547298.5

CS-208, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-208ENST00000547298 SPATA7Q9P0W8 599 aa10.47□□□□□ -0.73
CS-208ENST00000547298 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
CS-208ENST00000547298 ACAD8Q9UKU7 415 aa10.47□□□□□ -0.73
CS-208ENST00000547298 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
CS-208ENST00000547298 DUSP10Q9Y6W6 482 aa10.47□□□□□ -0.73
CS-208ENST00000547298 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-208ENST00000547298 MROH6A6NGR9 719 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-208ENST00000547298 SAGE2PA6NJ88 616 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-208ENST00000547298 ACOT7O00154 380 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-208ENST00000547298 SUSD5O60279 629 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-208ENST00000547298 RDH16O75452 317 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-208ENST00000547298 ITGA10O75578 1167 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-208ENST00000547298 IFNA2P01563 188 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-208ENST00000547298 TUBB4AP04350 444 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-208ENST00000547298 ZNF136P52737 540 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-208ENST00000547298 SORDQ00796 357 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-208ENST00000547298 PLGLB1Q02325 96 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-208ENST00000547298 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
CS-208ENST00000547298 FOXO1Q12778 655 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-208ENST00000547298 SEMA3AQ14563 771 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-208ENST00000547298 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
CS-208ENST00000547298 LRRC38Q5VT99 294 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-208ENST00000547298 ICE2Q659A1 982 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-208ENST00000547298 TTC23LQ6PF05 361 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-208ENST00000547298 HIPK1Q86Z02 1210 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-208ENST00000547298 FAM109AQ8N4B1 249 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-208ENST00000547298 OR5T3Q8NGG3 340 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-208ENST00000547298 SMPDL3BQ92485 455 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-208ENST00000547298 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
CS-208ENST00000547298 P3H4Q92791 437 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-208ENST00000547298 JKAMPQ9P055 326 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-208ENST00000547298 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
CS-208ENST00000547298 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
CS-208ENST00000547298 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-208ENST00000547298 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-208ENST00000547298 HACD1B0YJ81 288 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-208ENST00000547298 G3V3Y1 287 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-208ENST00000547298 DVL2O14641 736 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-208ENST00000547298 SIAH2O43255 324 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-208ENST00000547298 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
CS-208ENST00000547298 SOX30O94993 753 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-208ENST00000547298 APOA4P06727 396 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-208ENST00000547298 PKMP14618 531 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
CS-208ENST00000547298 GABRA1P14867 456 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-208ENST00000547298 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
CS-208ENST00000547298 MAN2A2P49641 1150 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-208ENST00000547298 MYL5Q02045 173 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-208ENST00000547298 POU6F1Q14863 301 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-208ENST00000547298 HYAL4Q2M3T9 481 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-208ENST00000547298 XKR6Q5GH73 641 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-208ENST00000547298 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-208ENST00000547298 WLSQ5T9L3 541 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-208ENST00000547298 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-208ENST00000547298 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-208ENST00000547298 KCTD11Q693B1 232 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-208ENST00000547298 ZNF534Q76KX8 674 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-208ENST00000547298 SLC22A16Q86VW1 577 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-208ENST00000547298 KIF18BQ86Y91 864 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-208ENST00000547298 TMEM156Q8N614 296 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-208ENST00000547298 OR13J1Q8NGT2 312 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-208ENST00000547298 SMPDL3AQ92484 453 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-208ENST00000547298 SARAFQ96BY9 339 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-208ENST00000547298 TM4SF19Q96DZ7 209 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-208ENST00000547298 LRRC46Q96FV0 321 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-208ENST00000547298 CAPZA3Q96KX2 299 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-208ENST00000547298 OR1F2PQ96R84 312 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-208ENST00000547298 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
CS-208ENST00000547298 DEFB126Q9BYW3 111 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-208ENST00000547298 NUP62CLQ9H1M0 184 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-208ENST00000547298 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-208ENST00000547298 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
CS-208ENST00000547298 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
CS-208ENST00000547298 TAC3Q9UHF0 121 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-208ENST00000547298 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
CS-208ENST00000547298 A0A087X1B8 175 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-208ENST00000547298 ZNF860A6NHJ4 632 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-208ENST00000547298 HAX1O00165 279 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-208ENST00000547298 KCNAB3O43448 404 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-208ENST00000547298 H2AFZP0C0S5 128 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-208ENST00000547298 IL10P22301 178 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-208ENST00000547298 BTG2P78543 158 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-208ENST00000547298 DMTNQ08495 405 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-208ENST00000547298 TRIM14Q14142 442 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-208ENST00000547298 TFDP2Q14188 446 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-208ENST00000547298 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-208ENST00000547298 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-208ENST00000547298 H2AFVQ71UI9 128 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-208ENST00000547298 RAB42Q8N4Z0 105 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-208ENST00000547298 KCT2Q8NC54 265 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-208ENST00000547298 OR9A1PQ8NGU1 263 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-208ENST00000547298 MCOLN3Q8TDD5 553 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-208ENST00000547298 IGFBPL1Q8WX77 278 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-208ENST00000547298 DACH2Q96NX9 599 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-208ENST00000547298 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
CS-208ENST00000547298 GSX2Q9BZM3 304 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-208ENST00000547298 EPB41L4BQ9H329 900 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-208ENST00000547298 IL1RL2Q9HB29 575 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-208ENST00000547298 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
CS-208ENST00000547298 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
CS-208ENST00000547298 LCMT1Q9UIC8 334 aa10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms