RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540501.1

STIP1-208, Transcript of stress induced phosphoprotein 1, humanhuman

TSL 3

Gene STIP1, Length 880 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STIP1-208ENST00000540501 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
STIP1-208ENST00000540501 GPR19Q15760 415 aa24.52■■□□□ 1.52
STIP1-208ENST00000540501 TMEM35AQ53FP2 167 aa24.52■■□□□ 1.52
STIP1-208ENST00000540501 CEACAM20Q6UY09 585 aa24.52■■□□□ 1.52
STIP1-208ENST00000540501 OR4N4Q8N0Y3 316 aa24.52■■□□□ 1.52
STIP1-208ENST00000540501 BMPERQ8N8U9 685 aa24.52■■□□□ 1.52
STIP1-208ENST00000540501 AGR3Q8TD06 166 aa24.52■■□□□ 1.52
STIP1-208ENST00000540501 TWIST2Q8WVJ9 160 aa24.52■■□□□ 1.52
STIP1-208ENST00000540501 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
STIP1-208ENST00000540501 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
STIP1-208ENST00000540501 B3GNT4Q9C0J1 378 aa24.52■■□□□ 1.52
STIP1-208ENST00000540501 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa24.52■■□□□ 1.52
STIP1-208ENST00000540501 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa24.52■■□□□ 1.52
STIP1-208ENST00000540501 OCIAD1Q9NX40 245 aa24.52■■□□□ 1.52
STIP1-208ENST00000540501 FITM1A5D6W6 292 aa24.51■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 TRPC5OSA6NMA1 111 aa24.51■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 HDAC3O15379 428 aa24.51■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 TGDSO95455 350 aa24.51■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 VIMP08670 466 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 HBQ1P09105 142 aa24.51■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 SERPINB3P29508 390 aa24.51■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 SKP1P63208 163 aa24.51■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 CUL3Q13618 768 aa24.51■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 UGT3A2Q3SY77 523 aa24.51■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP24.51■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 FAM47EQ6ZV65 393 aa24.51■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 TRIM46Q7Z4K8 759 aa24.51■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 SIKE1Q9BRV8 207 aa24.51■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 MS4A8Q9BY19 250 aa24.51■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa24.51■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 SLC6A16Q9GZN6 736 aa24.51■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 PNPOQ9NVS9 261 aa24.51■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 SLC39A1Q9NY26 324 aa24.51■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 AHSPQ9NZD4 102 aa24.51■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 SRPK3Q9UPE1 567 aa24.51■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 MAGEB17A8MXT2 336 aa24.5■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 RGS14O43566 566 aa24.5■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 SEMA3DO95025 777 aa24.5■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 NEK2P51955 445 aa24.5■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 RPS13P62277 151 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 CYP4F2P78329 520 aa24.5■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 ABRAXAS2Q15018 415 aa24.5■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 IMPG1Q17R60 797 aa24.5■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 MUM1Q2TAK8 710 aa24.5■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 PRTGQ2VWP7 1150 aa24.5■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 ADPRMQ3LIE5 342 aa24.5■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 SGO1Q5FBB7 561 aa24.5■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 DEPDC1Q5TB30 811 aa24.5■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 TMEM164Q5U3C3 297 aa24.5■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 ABHD13Q7L211 337 aa24.5■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 VN1R5Q7Z5H4 357 aa24.5■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 OR1L3Q8NH93 324 aa24.5■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 TAAR9Q96RI9 348 aa24.5■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa24.5■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 SEC16AO15027 2179 aa24.5■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 A0A088AWK7 358 aa24.49■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 HCRTR1O43613 425 aa24.49■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 CLDN6P56747 220 aa24.49■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 DCAF12Q5T6F0 453 aa24.49■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 DDIASQ8IXT1 998 aa24.49■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 GAL3ST3Q96A11 431 aa24.49■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 CHMP6Q96FZ7 201 aa24.49■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 NDC1Q9BTX1 674 aa24.49■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 DDA1Q9BW61 102 aa24.49■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 ROGDIQ9GZN7 287 aa24.49■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 RIC8BQ9NVN3 520 aa24.49■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 VPS29Q9UBQ0 182 aa24.49■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa24.49■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 SLC22A7Q9Y694 548 aa24.49■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 LRIT2A6NDA9 550 aa24.48■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 TMEM233B4DJY2 109 aa24.48■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 NPIPB8E9PQR5 432 aa24.48■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 H3BMH7 237 aa24.48■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 VPS4BO75351 444 aa24.48■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 TGFB1P01137 390 aa24.48■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 CCL4P13236 92 aa24.48■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 LSP1P33241 339 aa24.48■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 TSFMP43897 325 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 HTR6P50406 440 aa24.48■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 GYS2P54840 703 aa24.48■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 GNGT1P63211 74 aa24.48■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 FAM53BQ14153 422 aa24.48■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 HERC3Q15034 1050 aa24.48■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 TRIM40Q6P9F5 258 aa24.48■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 MVB12AQ96EY5 273 aa24.48■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa24.48■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa24.48■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 HYKKA2RU49 373 aa24.47■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
STIP1-208ENST00000540501 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms