RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa4.12□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 ERMARDQ5T6L9 678 aa4.12□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 KCTD16Q68DU8 428 aa4.12□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 DUPD1Q68J44 220 aa4.12□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 C11orf63Q6NUN7 778 aa4.12□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 CCDC121Q6ZUS5 278 aa4.12□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa4.12□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 H2AFVQ71UI9 128 aa4.12□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 VPS36Q86VN1 386 aa4.12□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
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SGCE-211ENST00000522045 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 L3MBTL4Q8NA19 623 aa4.12□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 CCDC26Q8TAB7 109 aa4.12□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 ETNPPLQ8TBG4 499 aa4.12□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 IFT81Q8WYA0 676 aa4.12□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 SLC35C1Q96A29 364 aa4.12□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 PGM2Q96G03 612 aa4.12□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 RUNDC3BQ96NL0 473 aa4.12□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 FOXN4Q96NZ1 517 aa4.12□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 SPAG5Q96R06 1193 aa4.12□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 PSMD1Q99460 953 aa4.12□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 FMO2Q99518 471 aa4.12□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 GFI1Q99684 422 aa4.12□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 RAB17Q9H0T7 212 aa4.12□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 CPVLQ9H3G5 476 aa4.12□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 JMJD4Q9H9V9 463 aa4.12□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 PRR34Q9NV39 138 aa4.12□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 RRN3Q9NYV6 651 aa4.12□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 FLRT3Q9NZU0 649 aa4.12□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 KLK13Q9UKR3 277 aa4.12□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa4.12□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 PFASO15067 1338 aa4.12□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 AFF2P51816 1311 aa4.12□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 CROCCQ5TZA2 2017 aa4.11□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa4.11□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 CFAP73A6NFT4 308 aa4.11□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 RRN3P2A6NIE6 340 aa4.11□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 E9PMD0 336 aa4.11□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 H0YHG0 523 aa4.11□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa4.11□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 TTI1O43156 1089 aa4.11□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 MGRN1O60291 552 aa4.11□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 MED24O75448 989 aa4.11□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 AKAP3O75969 853 aa4.11□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 AGTP01019 485 aa4.11□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 ACTN1P12814 892 aa4.11□□□□□ -1.75
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SGCE-211ENST00000522045 EPS15P42566 896 aa4.11□□□□□ -1.75
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SGCE-211ENST00000522045 KLRC3Q07444 240 aa4.11□□□□□ -1.75
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SGCE-211ENST00000522045 UBE2V1Q13404 147 aa4.11□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 RIPK1Q13546 671 aa4.11□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 GIT2Q14161 759 aa4.11□□□□□ -1.75
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SGCE-211ENST00000522045 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa4.11□□□□□ -1.75
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SGCE-211ENST00000522045 CYB5D1Q6P9G0 228 aa4.11□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
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SGCE-211ENST00000522045 ZNF534Q76KX8 674 aa4.11□□□□□ -1.75
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SGCE-211ENST00000522045 DNAJC22Q8N4W6 341 aa4.11□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 ERMNQ8TAM6 284 aa4.11□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 GSDMBQ8TAX9 411 aa4.11□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 MORC4Q8TE76 937 aa4.11□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 RAPGEF5Q92565 580 aa4.11□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 SLCO2A1Q92959 643 aa4.11□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 CHMP6Q96FZ7 201 aa4.11□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 FAM20AQ96MK3 541 aa4.11□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 PIGQQ9BRB3 760 aa4.11□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 GPR88Q9GZN0 384 aa4.11□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 UBA5Q9GZZ9 404 aa4.11□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 RABEP2Q9H5N1 569 aa4.11□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
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