RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514705.5

TSPAN17-208, Transcript of tetraspanin 17, human

TSL 2

Gene TSPAN17, Length 4,445 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TSPAN17-208	ENST00000514705	PIPSL	A2A3N6	862 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705		M0QZQ0	153 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	CASK	O14936	926 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	CDRT1	O95170	752 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	APOL3	O95236	402 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	RORC	P51449	518 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	FAM214A	Q32MH5	1076 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	ADGRF1	Q5T601	910 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	LKAAEAR1	Q8TD35	194 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	CMTM7	Q96FZ5	175 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	ELOVL2	Q9NXB9	296 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	IL17C	Q9P0M4	197 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	CSRP3	P50461	194 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	SCARB2	Q14108	478 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	TNFAIP8L2	Q6P589	184 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	TRPV1	Q8NER1	839 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	CCM2	Q9BSQ5	444 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	ZC4H2	Q9NQZ6	224 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	HECA	Q9UBI9	543 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	ZNF639	Q9UID6	485 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	TTC34	A8MYJ7	566 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705		H3BM21	787 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	FGB	P02675	491 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	PSKH1	P11801	424 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	UGT2B15	P54855	530 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	TEAD4	Q15561	434 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	NADSYN1	Q6IA69	706 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	HOMEZ	Q8IX15	550 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	MMP28	Q9H239	520 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	TRIM45	Q9H8W5	580 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	ATP6V1H	Q9UI12	483 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	PCDHGA3	Q9Y5H0	932 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	MTMR11	A4FU01	709 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	CARNS1	A5YM72	827 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	HAT1	O14929	419 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	PRR35	P0CG20	571 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	TGM1	P22735	817 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	EPHB3	P54753	998 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	CXCR4	P61073	352 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	FKBP10	Q96AY3	582 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	FAM129B	Q96TA1	746 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	SLC35A5	Q9BS91	424 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	TEX12	Q9BXU0	123 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	ACSL6	Q9UKU0	697 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	NR2F6	P10588	404 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	CD72	P21854	359 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	HMGCL	P35914	325 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	CEP78	Q5JTW2	689 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	NRARP	Q7Z6K4	114 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	ALOXE3	Q9BYJ1	711 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	DUSP21	Q9H596	190 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	CCDC177	Q9NQR7	707 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	LOC107983988	A0A1B0GUW6	1196 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	ACR	P10323	421 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	ETFA	P13804	333 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	CLCN7	P51798	805 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	SRP54	P61011	504 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	TIAL1	Q01085	375 aa	Known RBP eCLIP	13.4	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	IL18	Q14116	193 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	FAM180B	Q6P0A1	224 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	FUT10	Q6P4F1	479 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	SUN5	Q8TC36	379 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	UGT2A1	Q9Y4X1	527 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	SPIN1	Q9Y657	262 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	TGFB1	P01137	390 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	FEN1	P39748	380 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	ASMT	P46597	345 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	AP1S1	P61966	158 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	ACVR1	Q04771	509 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	C5orf22	Q49AR2	442 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	CRTC2	Q53ET0	693 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	AGAP6	Q5VW22	663 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	GGH	Q92820	318 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	CRELD1	Q96HD1	420 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	AGAP4	Q96P64	663 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	DOHH	Q9BU89	302 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	MRPL17	Q9NRX2	175 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	STMN3	Q9NZ72	180 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	TMEFF2	Q9UIK5	374 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	TRBC2	A0A5B9	178 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	PTH	P01270	115 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	FH	P07954	510 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	SNRPD1	P62314	119 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	AFMID	Q63HM1	303 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	NLGN4X	Q8N0W4	816 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	NAGS	Q8N159	534 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	NXPE1	Q8N323	547 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	ASZ1	Q8WWH4	475 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	MRPS31	Q92665	395 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	ZNF300	Q96RE9	604 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TSPAN17-208	ENST00000514705	OR2B2	Q9GZK3	357 aa		13.4	□□□□□ -0.26

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms