RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 DNAJC11Q9NVH1 559 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 ADGRE2Q9UHX3 823 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 INVSQ9Y283 1065 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 MYRFQ9Y2G1 1151 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 PPIL1Q9Y3C6 166 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 KNL1Q8NG31 2342 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 NUMA1Q14980 2115 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 F5P12259 2224 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa6.76□□□□□ -1.33
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HERC4-211ENST00000492996 C16orf96A6NNT2 1141 aa6.76□□□□□ -1.33
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HERC4-211ENST00000492996 PDHA2P29803 388 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 CBSP35520 551 aa6.76□□□□□ -1.33
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HERC4-211ENST00000492996 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP6.76□□□□□ -1.33
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HERC4-211ENST00000492996 XKR6Q5GH73 641 aa6.76□□□□□ -1.33
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HERC4-211ENST00000492996 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 ZNF438Q7Z4V0 828 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 GALNT10Q86SR1 603 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 SFTPA1Q8IWL2 248 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 HS3ST5Q8IZT8 346 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 CENPSQ8N2Z9 138 aa6.76□□□□□ -1.33
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HERC4-211ENST00000492996 UBTD2Q8WUN7 234 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 ASZ1Q8WWH4 475 aa6.76□□□□□ -1.33
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HERC4-211ENST00000492996 FAM162AQ96A26 154 aa6.76□□□□□ -1.33
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HERC4-211ENST00000492996 PRORYQ9H606 182 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 UCK1Q9HA47 277 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 LMAN1LQ9HAT1 526 aa6.76□□□□□ -1.33
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HERC4-211ENST00000492996 ARHGEF33A8MVX0 844 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 SGTAO43765 313 aa6.75□□□□□ -1.33
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HERC4-211ENST00000492996 C8GP07360 202 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 SDC1P18827 310 aa6.75□□□□□ -1.33
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HERC4-211ENST00000492996 CDKN2CP42773 168 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 DGKGP49619 791 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 DHCR24Q15392 516 aa6.75□□□□□ -1.33
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HERC4-211ENST00000492996 ATP6AP1Q15904 470 aa6.75□□□□□ -1.33
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HERC4-211ENST00000492996 TMEM220Q6QAJ8 160 aa6.75□□□□□ -1.33
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HERC4-211ENST00000492996 LPCAT2Q7L5N7 544 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 CLEC4FQ8N1N0 589 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa6.75□□□□□ -1.33
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HERC4-211ENST00000492996 ITPKCQ96DU7 683 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
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HERC4-211ENST00000492996 DPYSL5Q9BPU6 564 aa6.75□□□□□ -1.33
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HERC4-211ENST00000492996 C12orf4Q9NQ89 552 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 PNPLA3Q9NST1 481 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 SACM1LQ9NTJ5 587 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 IL36AQ9UHA7 158 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa6.75□□□□□ -1.33
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HERC4-211ENST00000492996 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa6.75□□□□□ -1.33
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HERC4-211ENST00000492996 FCGR1AP12314 374 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 ADRM1Q16186 407 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 FRG2Q64ET8 278 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 PROSER1Q86XN7 944 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 DHRSXQ8N5I4 330 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 GPR156Q8NFN8 814 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 OR7A2PQ8NGA2 310 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 TMBIM1Q969X1 311 aa6.75□□□□□ -1.33
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