RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 FKBP1BP68106 108 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 LCP2Q13094 533 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 PTPN14Q15678 1187 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 CNSTQ6PJW8 725 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF410Q86VK4 478 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 LAX1Q8IWV1 398 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 LSMEM2Q8N112 164 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 C9orf106Q8NAJ2 232 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF524Q96C55 264 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 EPSTI1Q96J88 318 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 C10orf90Q96M02 699 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 ACPTQ9BZG2 426 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 TNMDQ9H2S6 317 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 DPEP2Q9H4A9 486 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 EGLN3Q9H6Z9 239 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 ANO10Q9NW15 660 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 PILRBQ9UKJ0 227 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 C5orf51A6NDU8 294 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 KIF5CO60282 957 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 NADKO95544 446 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 IGLV2-11P01706 119 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 FAM157CP0CG43 387 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 FERP16591 822 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 TYMPP19971 482 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF74Q16587 644 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 FAM76BQ5HYJ3 339 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 DHRS11Q6UWP2 260 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 SERPINA12Q8IW75 414 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 TDHQ8IZJ6 230 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 THEM5Q8N1Q8 247 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 CLEC1AQ8NC01 280 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 RNF149Q8NC42 400 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 OR2T11Q8NH01 316 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 GGHQ92820 318 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 RFT1Q96AA3 541 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 ULK4Q96C45 1275 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 CTAGE1Q96RT6 745 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 FAM213AQ9BRX8 229 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 TRIM7Q9C029 511 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 ODF2LQ9ULJ1 636 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 TCF19Q9Y242 345 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 PMS2P5A8MQ11 134 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 A8MVM7 634 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 TRMUO75648 421 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 AP2A2O94973 939 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 SEC24AO95486 1093 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 LBX1P52954 281 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 DCDC1P59894 354 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 LRRC2Q9BYS8 371 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 NYXQ9GZU5 481 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 ICAM5Q9UMF0 924 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 SELENOKQ9Y6D0 94 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM129A0AVI4 362 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 SLCO1B7G3V0H7 640 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 CYTIPO60759 359 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 SRD5A2P31213 254 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 TIMP3P35625 211 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 CLCN4P51793 760 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 SMSP52788 366 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 LEKR1Q6ZMV7 388 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF619Q8N2I2 560 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 SMYD1Q8NB12 490 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 OR10G8Q8NGN5 311 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 ZNRF4Q8WWF5 429 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 ARHGAP45Q92619 1136 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 NXPE2Q96DL1 559 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 RUFY1Q96T51 708 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 ABCG8Q9H221 673 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 SLC52A3Q9NQ40 469 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 HACD3Q9P035 362 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 TMED7Q9Y3B3 224 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 MTMR11A4FU01 709 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 MSGN1A6NI15 193 aa6.79□□□□□ -1.32
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