RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487547.1

USP34-216, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, humanhuman

TSL 3

Gene USP34, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34-216ENST00000487547 NXPE2Q96DL1 559 aa4.91□□□□□ -1.62
USP34-216ENST00000487547 SIPA1Q96FS4 1042 aa4.91□□□□□ -1.62
USP34-216ENST00000487547 SOSTQ9BQB4 213 aa4.91□□□□□ -1.62
USP34-216ENST00000487547 PI4K2AQ9BTU6 479 aa4.91□□□□□ -1.62
USP34-216ENST00000487547 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa4.91□□□□□ -1.62
USP34-216ENST00000487547 NACAP1Q9BZK3 213 aa4.91□□□□□ -1.62
USP34-216ENST00000487547 TUBB1Q9H4B7 451 aa4.91□□□□□ -1.62
USP34-216ENST00000487547 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
USP34-216ENST00000487547 POLKQ9UBT6 870 aa4.91□□□□□ -1.62
USP34-216ENST00000487547 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa4.91□□□□□ -1.62
USP34-216ENST00000487547 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa4.91□□□□□ -1.62
USP34-216ENST00000487547 PCNX3Q9H6A9 2034 aa4.9□□□□□ -1.62
USP34-216ENST00000487547 HTR3EA5X5Y0 456 aa4.9□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 PRAF2O60831 178 aa4.9□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 CAPZA1P52907 286 aa4.9□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 SHEQ5VZ18 495 aa4.9□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 OR4C11Q6IEV9 310 aa4.9□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 FAM131BQ86XD5 332 aa4.9□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 CDC20BQ86Y33 519 aa4.9□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 PHC2Q8IXK0 858 aa4.9□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 C17orf47Q8NEP4 570 aa4.9□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 NCOA7Q8NI08 942 aa4.9□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 C11orf45Q8TAV5 145 aa4.9□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 RADILQ96JH8 1075 aa4.9□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 FOXN4Q96NZ1 517 aa4.9□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 INPP5KQ9BT40 448 aa4.9□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 UBQLN3Q9H347 655 aa4.9□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 CTSZQ9UBR2 303 aa4.9□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 A0A1B0GVY2 172 aa4.89□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 FLRT2O43155 660 aa4.89□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 TIMM44O43615 452 aa4.89□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 NXPH4O95158 308 aa4.89□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 POP4O95707 220 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 RPN1P04843 607 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 VIMP08670 466 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 AOC1P19801 751 aa4.89□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 EDNRAP25101 427 aa4.89□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 PKLRP30613 574 aa4.89□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 GPR183P32249 361 aa4.89□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 TFCP2Q12800 502 aa4.89□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 TAZQ16635 292 aa4.89□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 ALDH1L2Q3SY69 923 aa4.89□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 FAM91A1Q658Y4 838 aa4.89□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 LMNTD2Q8IXW0 634 aa4.89□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 OR52B6Q8NGF0 335 aa4.89□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 LURAP1Q96LR2 239 aa4.89□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 ATF6BQ99941 703 aa4.89□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 RPS10P5Q9NQ39 176 aa4.89□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 HEG1Q9ULI3 1381 aa4.89□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 TCP10L2B9ZVM9 353 aa4.88□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 WDR46O15213 610 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 GBAP04062 536 aa4.88□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 KRT3P12035 628 aa4.88□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 GIFP27352 417 aa4.88□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 OXTRP30559 389 aa4.88□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 DUTP33316 252 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 NPY4RP50391 375 aa4.88□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 PPA1Q15181 289 aa4.88□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa4.88□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 SPECC1Q5M775 1068 aa4.88□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 ABHD12Q8N2K0 398 aa4.88□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 CHPT1Q8WUD6 406 aa4.88□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 HEXDCQ8WVB3 486 aa4.88□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 GBP5Q96PP8 586 aa4.88□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 CHCHD5Q9BSY4 110 aa4.88□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 FAM129AQ9BZQ8 928 aa4.88□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 GTSE1Q9NYZ3 720 aa4.88□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 POMT2Q9UKY4 750 aa4.88□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa4.87□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 TSPY3P0CV98 308 aa4.87□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 TSPY8P0CW00 308 aa4.87□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 ADRA2CP18825 462 aa4.87□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 C4BPBP20851 252 aa4.87□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 SSTR1P30872 391 aa4.87□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 NDST2P52849 883 aa4.87□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 FCHO2Q0JRZ9 810 aa4.87□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 HIGD2BQ4VC39 106 aa4.87□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 DHRS11Q6UWP2 260 aa4.87□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa4.87□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 OCC1Q8TAD7 63 aa4.87□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 ERO1AQ96HE7 468 aa4.87□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 NEDD4LQ96PU5 975 aa4.87□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa4.87□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 KLK11Q9UBX7 282 aa4.87□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa4.86□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 FCGR3BO75015 233 aa4.86□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.1 ms