RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 GARNL3Q5VVW2 1013 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-212ENST00000485532 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
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PRAME-212ENST00000485532 CYS1Q717R9 158 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-212ENST00000485532 HDXQ7Z353 690 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-212ENST00000485532 VN1R4Q7Z5H5 301 aa11.95□□□□□ -0.5
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PRAME-212ENST00000485532 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
PRAME-212ENST00000485532 OR2W6PQ8NHA6 318 aa11.95□□□□□ -0.5
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PRAME-212ENST00000485532 VN1R1Q9GZP7 353 aa11.95□□□□□ -0.5
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PRAME-212ENST00000485532 HCN3Q9P1Z3 774 aa11.95□□□□□ -0.5
PRAME-212ENST00000485532 FBXO5Q9UKT4 447 aa11.95□□□□□ -0.5
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PRAME-212ENST00000485532 SGK494L7N484 410 aa11.94□□□□□ -0.5
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PRAME-212ENST00000485532 IL1RNP18510 177 aa11.94□□□□□ -0.5
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PRAME-212ENST00000485532 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa11.94□□□□□ -0.5
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PRAME-212ENST00000485532 SLC17A6Q9P2U8 582 aa11.94□□□□□ -0.5
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PRAME-212ENST00000485532 CSNK1G2P78368 415 aa11.93□□□□□ -0.5
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PRAME-212ENST00000485532 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa11.93□□□□□ -0.5
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PRAME-212ENST00000485532 OR51Q1Q8NH59 317 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAME-212ENST00000485532 ZIM3Q96PE6 472 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAME-212ENST00000485532 CYTH2Q99418 400 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAME-212ENST00000485532 RBCK1Q9BYM8 510 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAME-212ENST00000485532 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
PRAME-212ENST00000485532 TMEM184CQ9NVA4 438 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAME-212ENST00000485532 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
PRAME-212ENST00000485532 KLHL42Q9P2K6 505 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAME-212ENST00000485532 PDE10AQ9Y233 779 aa11.93□□□□□ -0.5
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PRAME-212ENST00000485532 ZNF860A6NHJ4 632 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-212ENST00000485532 A8MUI8 341 aa11.92□□□□□ -0.5
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PRAME-212ENST00000485532 RDH16O75452 317 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-212ENST00000485532 B3GALT4O96024 378 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-212ENST00000485532 CDH1P12830 882 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-212ENST00000485532 GABRB3P28472 473 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-212ENST00000485532 GCAP28676 217 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-212ENST00000485532 XCR1P46094 333 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-212ENST00000485532 CDKN2DP55273 166 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-212ENST00000485532 PER3P56645 1201 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-212ENST00000485532 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
PRAME-212ENST00000485532 ZNF844Q08AG5 666 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-212ENST00000485532 NDUFA9Q16795 377 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-212ENST00000485532 PHKG1Q16816 387 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-212ENST00000485532 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
PRAME-212ENST00000485532 BTBD16Q32M84 506 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-212ENST00000485532 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa11.92□□□□□ -0.5
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