RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480058.5

PRPF4B-205, Transcript of pre-mRNA processing factor 4B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRPF4B, Length 6,775 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4B-205ENST00000480058 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 FOXO6A8MYZ6 492 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 PRH1P02810 166 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 GGT1P19440 569 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 DLX5P56178 289 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 GINS1Q14691 196 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 FAM214AQ32MH5 1076 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 C4orf46Q504U0 113 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 C1orf189Q5VU69 101 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 CXCL17Q6UXB2 119 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 CHST4Q8NCG5 386 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 ZMIZ2Q8NF64 920 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 BPIFB1Q8TDL5 484 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 NXPE2Q96DL1 559 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 BTF3L4Q96K17 158 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 CD244Q9BZW8 370 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 BPIFA1Q9NP55 256 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 FAM118AQ9NWS6 357 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 PADI3Q9ULW8 664 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 SCML2Q9UQR0 700 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 ZNF536O15090 1300 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 SLIT2O94813 1529 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 FANCGO15287 622 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 GPRIN2O60269 458 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 IL1AP01583 271 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 HLA-DQB2P05538 268 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 ITPKBP27987 946 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 MAP3K8P41279 467 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 ACTA2P62736 377 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 ACTG2P63267 376 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 S100A12P80511 92 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 E2F1Q01094 437 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 MFSD13AQ14CX5 517 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 GRIK5Q16478 980 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 ARL9Q6T311 187 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 CEP97Q8IW35 865 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 ZNF440Q8IYI8 595 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 FAM86B1Q8N7N1 296 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 OR9I1Q8NGQ6 314 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 OR14K1Q8NGZ2 314 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 ZNF563Q8TA94 476 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 NEIL3Q8TAT5 605 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 HMCESQ96FZ2 354 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 FAM129BQ96TA1 746 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 GORASP2Q9H8Y8 452 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 Q9N2J8 555 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 IFT46Q9NQC8 304 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 A0A0U1RQF3 1178 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 LRRC72A6NJI9 287 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 UQCRC2P22695 453 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 IL32P24001 234 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 ADH6P28332 368 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 FMO3P31513 532 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 GLP1RP43220 463 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 MTNR1AP48039 350 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 SF1Q15637 639 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 ATAT1Q5SQI0 421 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 OR4F3Q6IEY1 312 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 AMIGO1Q86WK6 493 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 SLC9A6Q92581 669 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 TESCQ96BS2 214 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 RBP7Q96R05 134 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 SMURF1Q9HCE7 757 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 GPRC5BQ9NZH0 403 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 KCNN3Q9UGI6 736 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 TMEM127O75204 238 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 SNAP29O95721 258 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 BCKDHAP12694 445 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 C1QTNF8P60827 252 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 HMGCS1Q01581 520 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 LINGO2Q7L985 606 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 GPR142Q7Z601 462 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 GPR150Q8NGU9 434 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 LCN9Q8WX39 176 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 TWNKQ96RR1 684 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 SPEF2Q9C093 1822 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 ABCC6O95255 1503 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 CAPN14A8MX76 684 aa5.95□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms