RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479230.5

GNL3-208, Transcript of G protein nucleolar 3, human

TSL 4

Gene GNL3, Length 547 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GNL3-208	ENST00000479230	PPP1R21	Q6ZMI0	780 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	SLFN11	Q7Z7L1	901 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	GPC2	Q8N158	579 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	KIF18A	Q8NI77	898 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	FAM222B	Q8WU58	562 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	PGM2	Q96G03	612 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	FER1L6-AS2	Q96M78	137 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	KLHL5	Q96PQ7	755 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	LRRC61	Q9BV99	259 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	NDE1	Q9NXR1	346 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	GIMAP2	Q9UG22	337 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GNL3-208	ENST00000479230	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	NUP155	O75694	1391 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	IL16	Q14005	1332 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	TRBV4-1	A0A0J9YWV2	114 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	TOM1	O60784	492 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	PSMA3	P25788	255 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	CDC25C	P30307	473 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	ALDH1B1	P30837	517 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	MTCP1	P56278	107 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	DCDC1	P59894	354 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	CACNG1	Q06432	222 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	PAQR6	Q6TCH4	344 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	LYG1	Q8N1E2	194 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230		Q8NFD4	153 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	OMA1	Q96E52	524 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	C2orf48	Q96LS8	159 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	PRICKLE1	Q96MT3	831 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	BTBD9	Q96Q07	612 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	MTHFD2L	Q9H903	347 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	ANAPC5	Q9UJX4	755 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	WIPI2	Q9Y4P8	454 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	TMEM94	Q12767	1356 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	LOC105371242	A0A075B767	164 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	EPM2A	B3EWF7	344 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	PENK	P01210	267 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	SERPING1	P05155	500 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	PTAFR	P25105	342 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	TRA2A	Q13595	282 aa	Known RBP eCLIP	4.57	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	ENPP2	Q13822	863 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	RBBP7	Q16576	425 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	FAM174B	Q3ZCQ3	159 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	SUSD4	Q5VX71	490 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	ERN2	Q76MJ5	926 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	CHMP1B	Q7LBR1	199 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	ZER1	Q7Z7L7	766 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230		Q8NBF4	154 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	FAM218A	Q96MZ4	157 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	GPATCH1	Q9BRR8	931 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	GTPBP2	Q9BX10	602 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	EGLN3	Q9H6Z9	239 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	B3GAT2	Q9NPZ5	323 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	KLK13	Q9UKR3	277 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	MED14	O60244	1454 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	NOS1	P29475	1434 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	CEP152	O94986	1710 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	C17orf105	B2RV13	164 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	PI15	O43692	258 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	LUC7L3	O95232	432 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	EPOR	P19235	508 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	SFTPD	P35247	375 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	LY6D	Q14210	128 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	ZNF273	Q14593	569 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	AMIGO1	Q86WK6	493 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	CCDC60	Q8IWA6	550 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	LRTM2	Q8N967	370 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	IQUB	Q8NA54	791 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	AQP11	Q8NBQ7	271 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	C9orf43	Q8TAL5	461 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	PYCR2	Q96C36	320 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	AGAP4	Q96P64	663 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	NDN	Q99608	321 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	KATNB1	Q9BVA0	655 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	PKD2L2	Q9NZM6	624 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	IL36A	Q9UHA7	158 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	ALK	Q9UM73	1620 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	SYNM	O15061	1565 aa		4.56	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.9 ms