RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475618.1

BACE2-208, Transcript of beta-secretase 2, human

TSL 5

Gene BACE2, Length 229 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BACE2-208	ENST00000475618	BCL6	P41182	706 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	SKIV2L2	P42285	1042 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	XCR1	P46094	333 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	RGS4	P49798	205 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	CLCN7	P51798	805 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	RIPPLY3	P57055	190 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	YBX1	P67809	324 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	ALDH6A1	Q02252	535 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	OC90	Q02509	493 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	SRSF11	Q05519	484 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	MLC1	Q15049	377 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	NSDHL	Q15738	373 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	SYT16	Q17RD7	645 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	MSS51	Q4VC12	460 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	EEF1AKMT2	Q5JPI9	291 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	ACER2	Q5QJU3	275 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	FBXW10	Q5XX13	1052 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	CES3	Q6UWW8	571 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	UBE2R2	Q712K3	238 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	ANKRD37	Q7Z713	158 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	PRUNE1	Q86TP1	453 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	C17orf64	Q86WR6	236 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	SPPL2C	Q8IUH8	684 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	CILP2	Q8IUL8	1156 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	RELL1	Q8IUW5	271 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	TMEM139	Q8IV31	216 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	LGI4	Q8N135	537 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	GHDC	Q8N2G8	530 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	PRELID2	Q8N945	189 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	GOLM1	Q8NBJ4	401 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	PPFIBP2	Q8ND30	876 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	PLPP5	Q8NEB5	264 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	OR9A4	Q8NGU2	314 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	OR51Q1	Q8NH59	317 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	SLC13A3	Q8WWT9	602 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	KCNJ9	Q92806	393 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	FAM136A	Q96C01	138 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	LURAP1	Q96LR2	239 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	CCDC138	Q96M89	665 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	PRAP1	Q96NZ9	151 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	LPAR4	Q99677	370 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	MESP1	Q9BRJ9	268 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	DESI2	Q9BSY9	194 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	VN1R1	Q9GZP7	353 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	CLK4	Q9HAZ1	481 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	XAB2	Q9HCS7	855 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	SYBU	Q9NX95	663 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	SH3BGRL2	Q9UJC5	107 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	METRN	Q9UJH8	293 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	DHRS7	Q9Y394	339 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	SLC22A7	Q9Y694	548 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	NBPF19	A0A087WUL8	3843 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	KRT87P	A6NCN2	255 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	URAD	A6NGE7	173 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	MAGEB17	A8MXT2	336 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	FAM227A	F5H4B4	570 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	PRRG2	O14669	202 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	NDC80	O14777	642 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	SLC16A5	O15375	505 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	P2RX6	O15547	441 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	ASNA1	O43681	348 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	CEP104	O60308	925 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	FGG	P02679	453 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	PGR	P06401	933 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	C8G	P07360	202 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	CELA2A	P08217	269 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	HIST1H2AG	P0C0S8	130 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	ABO	P16442	354 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	IL1RN	P18510	177 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	HIST1H2AD	P20671	130 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	GRN	P28799	593 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	IMPA1	P29218	277 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	CDC25B	P30305	580 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	CD96	P40200	585 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	MAGEA6	P43360	314 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	KCNJ1	P48048	391 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	OR4D2	P58180	307 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	MAT1A	Q00266	395 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	GPS1	Q13098	491 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	SP140	Q13342	867 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	CTBP1	Q13363	440 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	TUBA3C	Q13748	450 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	KCNJ11	Q14654	390 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	HERC3	Q15034	1050 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	SETDB1	Q15047	1291 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	SIX1	Q15475	284 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	OR1C1	Q15619	314 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	C3AR1	Q16581	482 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	C11orf91	Q3C1V1	193 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	SFT2D3	Q587I9	215 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	ZNF470	Q6ECI4	717 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	SLC25A25	Q6KCM7	469 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	CAPN13	Q6MZZ7	669 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BACE2-208	ENST00000475618	TUBA3E	Q6PEY2	450 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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