RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465909.2

SOGA3-201, Transcript of SOGA family member 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SOGA3, Length 3,756 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3-201ENST00000465909 ELP2Q6IA86 826 aa14.39□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 SHFQ7M4L6 423 aa14.39□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 SYT12Q8IV01 421 aa14.39□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 ZNF599Q96NL3 588 aa14.39□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 SEMA3CQ99985 751 aa14.39□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 HTATIP2Q9BUP3 242 aa14.39□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 NTMT1Q9BV86 223 aa14.39□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 SLC39A8Q9C0K1 460 aa14.39□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 EXTL2Q9UBQ6 330 aa14.39□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa14.39□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 KLHL21Q9UJP4 597 aa14.39□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 STON1Q9Y6Q2 735 aa14.39□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 TAF1LQ8IZX4 1826 aa14.39□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 LCHNA4D1U4 455 aa14.39□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 GPR182O15218 404 aa14.39□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 KLHL18O94889 574 aa14.39□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 LCN1P31025 176 aa14.39□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 ERVPABLB-1P60509 514 aa14.39□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 CXCR4P61073 352 aa14.39□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 KEAP1Q14145 624 aa14.39□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP14.39□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 LETMD1Q6P1Q0 360 aa14.39□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa14.39□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 RAET1EQ8TD07 263 aa14.39□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa14.39□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 COPS5Q92905 334 aa14.39□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP14.39□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 SRRQ9GZT4 340 aa14.39□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 OR6C2Q9NZP2 312 aa14.39□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa14.38□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 TTLL8A6PVC2 850 aa14.38□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 PCDH17O14917 1159 aa14.38□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 TGFB3P10600 412 aa14.38□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP14.38□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP14.38□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 P2RY14Q15391 338 aa14.38□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 TUSC1Q2TAM9 212 aa14.38□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 ATAT1Q5SQI0 421 aa14.38□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 TMEM88Q6PEY1 159 aa14.38□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP14.38□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 ELMOD3Q96FG2 381 aa14.38□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 ZNF285Q96NJ3 590 aa14.38□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 SLC28A3Q9HAS3 691 aa14.38□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 ENAMQ9NRM1 1142 aa14.38□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP14.38□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 SHROOM3Q8TF72 1996 aa14.38□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa14.38□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa14.38□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 F8W810 466 aa14.38□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 DCLK1O15075 740 aa14.38□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 BEST1O76090 585 aa14.38□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 ALDOBP05062 364 aa14.38□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 ITGAMP11215 1152 aa14.38□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 HYAL2Q12891 473 aa14.38□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 GRIN2CQ14957 1233 aa14.38□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP14.38□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 RTL4Q6ZR62 310 aa14.38□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 MIB1Q86YT6 1006 aa14.38□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP14.38□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 TCEANCQ8N8B7 351 aa14.38□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 OR8K5Q8NH50 307 aa14.38□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 FXYD6Q9H0Q3 95 aa14.38□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP14.38□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa14.38□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 PDCD5O14737 125 aa14.38□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 LRRTM2O43300 516 aa14.38□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 RAF1P04049 648 aa14.38□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 DNAJB2P25686 324 aa14.38□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP14.38□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 OR4K2Q8NGD2 314 aa14.38□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 NANPQ8TBE9 248 aa14.38□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 AP2M1Q96CW1 435 aa14.38□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 FAM167AQ96KS9 214 aa14.38□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 SPNS1Q9H2V7 528 aa14.38□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP14.38□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 SDHAF2Q9NX18 166 aa14.38□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 S1PR4O95977 384 aa14.37□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 PAHP00439 452 aa14.37□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 C4BPBP20851 252 aa14.37□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 MAGEA2P43356 314 aa14.37□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 HSPA14Q0VDF9 509 aa14.37□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 FAM171BQ6P995 826 aa14.37□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 PAQR6Q6TCH4 344 aa14.37□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 IL20RBQ6UXL0 311 aa14.37□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 RNF130Q86XS8 419 aa14.37□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 MEIOBQ8N635 442 aa14.37□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 OR8J3Q8NGG0 315 aa14.37□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 HMGB4Q8WW32 186 aa14.37□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 ZSWIM3Q96MP5 696 aa14.37□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP14.37□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 PRDM9Q9NQV7 894 aa14.37□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 ACTR10Q9NZ32 417 aa14.37□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 FBXL2Q9UKC9 423 aa14.37□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 MAFO75444 373 aaPredicted RBP14.37□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 ATG12O94817 140 aa14.37□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 CCNDBP1O95273 360 aa14.37□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 ESR1P03372 595 aa14.37□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 KDELR2P33947 212 aa14.37□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 DUSP6Q16828 381 aa14.37□□□□□ -0.11
SOGA3-201ENST00000465909 COQ5Q5HYK3 327 aa14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms