RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462256.5

DDX39B-215, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 2

Gene DDX39B, Length 4,027 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-215ENST00000462256 DEFB109BQ30KR1 87 aa8.9□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa8.9□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 VMP1Q96GC9 406 aa8.9□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 PEX11GQ96HA9 241 aa8.9□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 HBEGFQ99075 208 aa8.9□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 OR51B5Q9H339 312 aa8.9□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 STARD5Q9NSY2 213 aa8.9□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 EURLQ9NYK6 297 aa8.9□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa8.9□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 PPM1DO15297 605 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 E2F6O75461 281 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 CIB2O75838 187 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 EPORP19235 508 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 OR1D4P47884 311 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 MTTPP55157 894 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 NME5P56597 212 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 NXPE4Q6UWF7 544 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF534Q76KX8 674 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 IGDCC3Q8IVU1 814 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 ARHGAP24Q8N264 748 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 SLC25A45Q8N413 288 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 KCT2Q8NC54 265 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 OR4D9Q8NGE8 314 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 TIMM22Q9Y584 194 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 FAM227AF5H4B4 570 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF749O43361 778 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 BRINP1O60477 761 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 ENO1P06733 434 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 EBLN1P0CF75 366 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 ACPPP15309 386 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 ITIH1P19827 911 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 BGNP21810 368 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 XIAPP98170 497 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 VPS26BQ4G0F5 336 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 TSSK3Q96PN8 268 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 SEMA3GQ9NS98 782 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 ACACBO00763 2458 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 FEZF1A0PJY2 475 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 REM1O75628 298 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 ICAM2P13598 275 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 ASMTP46597 345 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 KCNAB1Q14722 419 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 SLC5A8Q8N695 610 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 CD200R1Q8TD46 325 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 KLHL6Q8WZ60 621 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 FBXL8Q96CD0 374 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 CD244Q9BZW8 370 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 LDAHQ9H6V9 325 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 LRTM1Q9HBL6 345 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 OARD1Q9Y530 152 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 UQCRBP14927 111 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 LBPP18428 481 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 CCKBRP32239 447 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 MAGEA6P43360 314 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 CCR10P46092 362 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 KCNC1P48547 511 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 SLC1A6P48664 564 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 CBX3Q13185 183 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF789Q5FWF6 425 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 FOXB2Q5VYV0 432 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF480Q8WV37 535 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 LRGUKQ96M69 825 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 KCNC2Q96PR1 638 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 ADAP2Q9NPF8 381 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 GALPQ9UBC7 116 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 H0YGG7 62 aa8.88□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 ITPKBP27987 946 aa8.88□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 FASLGP48023 281 aa8.88□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 CDKN2DP55273 166 aa8.88□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 NFKB2Q00653 900 aa8.88□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 IL11RAQ14626 422 aa8.88□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 TYSND1Q2T9J0 566 aa8.88□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 ATCAYQ86WG3 371 aa8.88□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 TAGAPQ8N103 731 aa8.88□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 SUMF1Q8NBK3 374 aa8.88□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 PMEPA1Q969W9 287 aa8.88□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 TMEM237Q96Q45 408 aa8.88□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 SLC29A3Q9BZD2 475 aa8.88□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa8.88□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa8.88□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 VTI1BQ9UEU0 232 aa8.88□□□□□ -0.99
DDX39B-215ENST00000462256 COL4A6Q14031 1691 aa8.88□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.2 ms