RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447698.5

STRADB-204, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta, humanhuman

TSL 4

Gene STRADB, Length 576 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADB-204ENST00000447698 KLHL18O94889 574 aa22.11■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 B3GALT4O96024 378 aa22.11■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 S100BP04271 92 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 INHBAP08476 426 aa22.11■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 TYK2P29597 1187 aa22.11■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 AHRP35869 848 aa22.11■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 GLRBP48167 497 aa22.11■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 KLRB1Q12918 225 aa22.11■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 TEX19Q8NA77 164 aa22.11■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 PAFAH2Q99487 392 aa22.11■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 ANAPC2Q9UJX6 822 aa22.11■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa22.11■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 SLC22A7Q9Y694 548 aa22.11■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 J3QKU1 62 aa22.1■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 PRAMEF4O60810 478 aa22.1■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 KERAO60938 352 aa22.1■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 IPO13O94829 963 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 BMP10O95393 424 aa22.1■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 HEXBP07686 556 aa22.1■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 FAM153BP0C7A2 387 aa22.1■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 HNF4AP41235 474 aa22.1■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 AGTR2P50052 363 aa22.1■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 SERPINB8P50452 374 aa22.1■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 EFNA3P52797 238 aa22.1■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 RGS1Q08116 209 aa22.1■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP22.1■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 TUBB8Q3ZCM7 444 aa22.1■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 FAM153CQ494X1 144 aa22.1■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa22.1■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 ATG9BQ674R7 924 aa22.1■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa22.1■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 OR51Q1Q8NH59 317 aa22.1■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 NT5CQ8TCD5 201 aa22.1■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 NUDT4Q9NZJ9 180 aa22.1■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 MKL2Q9ULH7 1088 aa22.1■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa22.1■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 IKBKGQ9Y6K9 419 aa22.1■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 ACPPP15309 386 aa22.09■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 MSH2P43246 934 aa22.09■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 XCR1P46094 333 aa22.09■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 MYBPC3Q14896 1274 aa22.09■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 HERC3Q15034 1050 aa22.09■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 FAM83EQ2M2I3 478 aa22.09■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 DEFB134Q4QY38 66 aa22.09■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 CCDC91Q7Z6B0 441 aa22.09■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 PARP9Q8IXQ6 854 aa22.09■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 OR5T3Q8NGG3 340 aa22.09■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 CREB3L4Q8TEY5 395 aa22.09■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 CD244Q9BZW8 370 aa22.09■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 EPN3Q9H201 632 aa22.09■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 VPS11Q9H270 941 aa22.09■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 KLHL31Q9H511 634 aa22.09■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 GPRC5BQ9NZH0 403 aa22.09■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 OR2W5A6NFC9 320 aa22.08■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 MAP2K7O14733 419 aa22.08■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 CLGNO14967 610 aa22.08■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 DNAJB6O75190 326 aa22.08■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 MTHFD2P13995 350 aa22.08■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 ALOX12P18054 663 aa22.08■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 ITGA3P26006 1051 aa22.08■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 CASRP41180 1078 aa22.08■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 HYAL2Q12891 473 aa22.08■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 PDK4Q16654 411 aa22.08■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 TRPV3Q8NET8 790 aa22.08■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 DCAKDQ8WVC6 231 aa22.08■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 GPR78Q96P69 363 aa22.08■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 CAPS2Q9BXY5 557 aa22.08■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 AICDAQ9GZX7 198 aa22.08■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 L2HGDHQ9H9P8 463 aa22.08■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa22.08■■□□□ 1.13
STRADB-204ENST00000447698 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
STRADB-204ENST00000447698 KLHL2O95198 593 aa22.07■■□□□ 1.12
STRADB-204ENST00000447698 EPORP19235 508 aa22.07■■□□□ 1.12
STRADB-204ENST00000447698 CXCR2P25025 360 aa22.07■■□□□ 1.12
STRADB-204ENST00000447698 SERPINB9P50453 376 aa22.07■■□□□ 1.12
STRADB-204ENST00000447698 SOX8P57073 446 aa22.07■■□□□ 1.12
STRADB-204ENST00000447698 RAB8AP61006 207 aa22.07■■□□□ 1.12
STRADB-204ENST00000447698 OLR1P78380 273 aa22.07■■□□□ 1.12
STRADB-204ENST00000447698 TLE1Q04724 770 aa22.07■■□□□ 1.12
STRADB-204ENST00000447698 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
STRADB-204ENST00000447698 Q0VFX4 171 aa22.07■■□□□ 1.12
STRADB-204ENST00000447698 NADK2Q4G0N4 442 aa22.07■■□□□ 1.12
STRADB-204ENST00000447698 XKR6Q5GH73 641 aa22.07■■□□□ 1.12
STRADB-204ENST00000447698 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa22.07■■□□□ 1.12
STRADB-204ENST00000447698 MFSD4BQ5TF39 518 aa22.07■■□□□ 1.12
STRADB-204ENST00000447698 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa22.07■■□□□ 1.12
STRADB-204ENST00000447698 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa22.07■■□□□ 1.12
STRADB-204ENST00000447698 RHEBL1Q8TAI7 183 aa22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 86.8 ms