RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 C16orf54Q6UWD8 224 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 FUNDC1Q8IVP5 155 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 NT5DC2Q9H857 520 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 NMUR1Q9HB89 426 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 GRHPRQ9UBQ7 328 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 LRRN3E7EW58 273 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 G3V3G9 751 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 PEX12O00623 359 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 GPR37O15354 613 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 RPS6KA4O75676 772 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 SLITRK3O94933 977 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 F2P00734 622 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 RPN2P04844 631 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 SLC35G4P0C7Q5 338 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 FGFR1P11362 822 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 ADRA1BP35368 520 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 COMPP49747 757 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 OR2B8PP59922 312 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 UBE2KP61086 200 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 DPYSL2Q16555 572 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 LRRC26Q2I0M4 334 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 C11orf63Q6NUN7 778 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 WDR88Q6ZMY6 472 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 TRIM46Q7Z4K8 759 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 GPR149Q86SP6 731 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 KATNAL2Q8IYT4 538 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 BANPQ8N9N5 519 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 FAM156AQ8NDB6 213 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 OR9A1PQ8NGU1 263 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 SCARB1Q8WTV0 552 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 CHAC2Q8WUX2 184 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 ANAPC16Q96DE5 110 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 C7orf34Q96L11 122 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 OR2AG1Q9H205 316 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 ADAM7Q9H2U9 754 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 LRRN3Q9H3W5 708 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 RNF146Q9NTX7 359 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 MGAT4CQ9UBM8 478 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 PLLPQ9Y342 182 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 CTDSP2O14595 271 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 ARPC5O15511 151 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 HCN1O60741 890 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 SIX6O95475 246 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 OPN1MWP04001 364 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 IFNA6P05013 189 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 ALDOBP05062 364 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 DLDP09622 509 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 OPN1MW2P0DN77 364 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 OPN1MW3P0DN78 364 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 NDUFB7P17568 137 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 HDCP19113 662 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 KCNJ3P48549 501 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 NDST1P52848 882 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 GABARAPL2P60520 117 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 ITPK1Q13572 414 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 ATP6V1FQ16864 119 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 GPR33Q49SQ1 333 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 BCL2L15Q5TBC7 163 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 PAMR1Q6UXH9 720 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 GLRX5Q86SX6 157 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 RAB24Q969Q5 203 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 FAHD2AQ96GK7 314 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 MECRQ9BV79 373 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 THAP2Q9H0W7 228 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 BRF2Q9HAW0 419 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 NANSQ9NR45 359 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 COL20A1Q9P218 1284 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 IL19Q9UHD0 177 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 CNTNAP1P78357 1384 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM82A0PJX8 343 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 LGALS8O00214 317 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 CYB5BO43169 146 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 LYRM1O43325 122 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 PRPSAP2O60256 369 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 FAM189A1O60320 539 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 OTCP00480 354 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 SERPIND1P05546 499 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 ICAM3P32942 547 aa5.43□□□□□ -1.54
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