RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 MYDGFQ969H8 173 aa8.12□□□□□ -1.11
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RABGEF1-203ENST00000439720 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
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RABGEF1-203ENST00000439720 TBX18O95935 607 aa8.11□□□□□ -1.11
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RABGEF1-203ENST00000439720 MYL12AP19105 171 aa8.11□□□□□ -1.11
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RABGEF1-203ENST00000439720 FAM26DQ5JW98 314 aa8.11□□□□□ -1.11
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RABGEF1-203ENST00000439720 STX19Q8N4C7 294 aa8.11□□□□□ -1.11
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RABGEF1-203ENST00000439720 PHF21AQ96BD5 680 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM209Q96SK2 561 aa8.11□□□□□ -1.11
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RABGEF1-203ENST00000439720 AP5M1Q9H0R1 490 aa8.11□□□□□ -1.11
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RABGEF1-203ENST00000439720 A8MVJ9 347 aa8.11□□□□□ -1.11
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RABGEF1-203ENST00000439720 EFCAB14O75071 495 aa8.11□□□□□ -1.11
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RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF682O95780 498 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 PTPN5P54829 565 aa8.11□□□□□ -1.11
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RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP8.11□□□□□ -1.112e-6■■■■■ 26.9
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RABGEF1-203ENST00000439720 HDDC2Q7Z4H3 204 aa8.11□□□□□ -1.11
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RABGEF1-203ENST00000439720 TNIP3Q96KP6 325 aa8.11□□□□□ -1.11
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