RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 C11orf63Q6NUN7 778 aa4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 AADACL2Q6P093 401 aa4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM151BQ6UXP7 276 aa4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 RAD9BQ6WBX8 426 aa4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 DET1Q7L5Y6 550 aa4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 KIAA1328Q86T90 577 aa4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 GGNQ86UU5 652 aa4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 NT5DC3Q86UY8 548 aa4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 NRROSQ86YC3 692 aa4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 NAGSQ8N159 534 aa4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 TTC30BQ8N4P2 665 aa4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 TEX26Q8N6G2 289 aa4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 GPR26Q8NDV2 337 aa4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF248Q8NDW4 579 aa4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 GDAP1Q8TB36 358 aa4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 HCAR2Q8TDS4 363 aa4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 ACTRT2Q8TDY3 377 aa4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCT6BQ92526 530 aa4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 FGF11Q92914 225 aa4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 EID2BQ96D98 161 aa4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 SCRN2Q96FV2 425 aa4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 WDYHV1Q96HA8 205 aa4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 HIC2Q96JB3 615 aa4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 TBATAQ96M53 351 aa4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRR25Q96S07 402 aa4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 FICDQ9BVA6 458 aa4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 FSD1LQ9BXM9 530 aa4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 GPR63Q9BZJ6 419 aa4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 STRADBQ9C0K7 418 aa4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR2AG1Q9H205 316 aa4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 LRRN3Q9H3W5 708 aa4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 SERTAD4Q9NUC0 356 aa4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 LRIT1Q9P2V4 623 aa4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 LPAR3Q9UBY5 353 aa4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 RSPH14Q9UHP6 348 aa4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 SH2B3Q9UQQ2 575 aa4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 DGKBQ9Y6T7 804 aa4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa4.32□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 MYO18BQ8IUG5 2567 aa4.32□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 NBASA2RRP1 2371 aa4.32□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa4.32□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 COL12A1Q99715 3063 aa4.32□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 DOCK10Q96BY6 2186 aa4.32□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR2AG2A6NM03 316 aa4.32□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 LINC00473A8K010 186 aa4.32□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 PDZK1P1A8MUH7 402 aa4.32□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 ANKRD66B4E2M5 251 aa4.32□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 H7C0C1 242 aa4.32□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 AP4M1O00189 453 aa4.32□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 PSMD9O00233 223 aa4.32□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP4.32□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPRY2O43597 315 aa4.32□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 DNPH1O43598 174 aa4.32□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 FGF1P05230 155 aa4.32□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 IVLP07476 585 aa4.32□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 ITGA2BP08514 1039 aa4.32□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCL4P13236 92 aa4.32□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP4.32□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 CTNNA2P26232 953 aa4.32□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 PSMB4P28070 264 aa4.32□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 AKT1P31749 480 aa4.32□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 UGT1A5P35504 534 aa4.32□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP4.32□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRIM23P36406 574 aa4.32□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARHGAP25P42331 645 aa4.32□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP4.32□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 ATP5OP48047 213 aa4.32□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 DRG2P55039 364 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 GFERP55789 205 aa4.32□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 WASHC5Q12768 1159 aa4.32□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 FOXO1Q12778 655 aa4.32□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 LY6DQ14210 128 aa4.32□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 PTPRCAPQ14761 206 aa4.32□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 CLCA4Q14CN2 919 aa4.32□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 PYCR3Q53H96 274 aa4.32□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP4.32□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 TFDP3Q5H9I0 405 aa4.32□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 SIRPB2Q5JXA9 342 aa4.32□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 HECTD2Q5U5R9 776 aa4.32□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 LVRNQ6Q4G3 990 aa4.32□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 SARM1Q6SZW1 724 aa4.32□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 Q6ZWC4 215 aa4.32□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 USP51Q70EK9 711 aa4.32□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 RAB11FIP2Q7L804 512 aa4.32□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms