RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424089.5

POLR1A-204, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 576 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-204ENST00000424089 AURKCQ9UQB9 309 aa9.66□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa9.66□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 AP4B1Q9Y6B7 739 aa9.66□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa9.66□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa9.66□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 ELOVL7A1L3X0 281 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 IGLON5A6NGN9 336 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 EVPLLA8MZ36 301 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 TXNDC9O14530 226 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 RFXANKO14593 260 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 MID1O15344 667 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 TIPRLO75663 272 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 PCDH8O95206 1070 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 LDLRP01130 860 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 RAP2AP10114 183 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 ERGP11308 486 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 DDX5P17844 614 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 CD22P20273 847 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 PPIBP23284 216 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 NTSR1P30989 418 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 TAS2R38P59533 333 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 TBPL1P62380 186 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 CHRNB3Q05901 458 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 SGCGQ13326 291 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 WSCD2Q2TBF2 565 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 HMBOX1Q6NT76 420 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 ERICH5Q6P6B1 374 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 NXPE4Q6UWF7 544 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 HEATR4Q86WZ0 1026 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 CALHM3Q86XJ0 350 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 EID3Q8N140 333 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 SLC5A11Q8WWX8 675 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 TSSK3Q96PN8 268 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 PHF12Q96QT6 1004 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 MAGIXQ9H6Y5 334 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 WDR26Q9H7D7 661 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 NT5DC2Q9H857 520 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 COQ10BQ9H8M1 238 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 PELI2Q9HAT8 420 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 SERHLQ9NQF3 203 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 OLAHQ9NV23 265 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 AHSPQ9NZD4 102 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 NDUFA13Q9P0J0 144 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 FAM8A1Q9UBU6 413 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 BTNL2Q9UIR0 455 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 PADI4Q9UM07 663 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 CORO2BQ9UQ03 480 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 MYOFQ9NZM1 2061 aa9.64□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 CACNA1EQ15878 2313 aa9.64□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa9.64□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 PLK4O00444 970 aa9.64□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 ARHGAP33O14559 1287 aa9.64□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 KDM1AO60341 852 aa9.64□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 DFNA5O60443 496 aa9.64□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 TNFAIP8O95379 198 aa9.64□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 ZCCHC18P0CG32 403 aa9.64□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 HRH2P25021 359 aa9.64□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 HPCAL1P37235 193 aa9.64□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 CCT8P50990 548 aa9.64□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 OR4D2P58180 307 aa9.64□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 MTPNP58546 118 aa9.64□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 SLC14A1Q13336 389 aa9.64□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 NFE2L1Q14494 772 aa9.64□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 ADRM1Q16186 407 aa9.64□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 CYP2A13Q16696 494 aa9.64□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 PGS1Q32NB8 556 aa9.64□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 CCSMST1Q4G0I0 132 aa9.64□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 OR52E8Q6IFG1 317 aa9.64□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 CRTC3Q6UUV7 619 aa9.64□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 UGT2A3Q6UWM9 527 aa9.64□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 XKR5Q6UX68 686 aa9.64□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 TMEM92Q6UXU6 159 aa9.64□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 SPRED1Q7Z699 444 aa9.64□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 SERPINA11Q86U17 422 aa9.64□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 TRIM74Q86UV6 250 aa9.64□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 SFTPA1Q8IWL2 248 aa9.64□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 MSRB3Q8IXL7 192 aa9.64□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 MICU2Q8IYU8 434 aa9.64□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 GALNT4Q8N4A0 578 aa9.64□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 DTWD1Q8N5C7 304 aa9.64□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 NATD1Q8N6N6 113 aa9.64□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 IL17RCQ8NAC3 791 aa9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.5 ms