RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409937.1

CNGA3-204, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CNGA3, Length 2,615 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-204ENST00000409937 LHX8Q68G74 356 aa13.56□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 SPATC1Q76KD6 591 aa13.56□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 NFKBIDQ8NI38 313 aa13.56□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 SLC38A4Q969I6 547 aa13.56□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 SIGLEC11Q96RL6 698 aa13.56□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 TCF25Q9BQ70 676 aa13.56□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 CHST8Q9H2A9 424 aa13.56□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 TMED5Q9Y3A6 229 aa13.56□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 OBSL1O75147 1896 aa13.55□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 A0A1W2PRU2 124 aa13.55□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 C1orf226A1L170 272 aa13.55□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 GFYI3L273 518 aa13.55□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 SLC16A8O95907 504 aa13.55□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 PRPH2P23942 346 aa13.55□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 CXCR4P61073 352 aa13.55□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 SELENBP1Q13228 472 aa13.55□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 LYSMD2Q8IV50 215 aa13.55□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 NPAS3Q8IXF0 933 aa13.55□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 POC5Q8NA72 575 aa13.55□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 OR10G2Q8NGC3 310 aa13.55□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 RHOXF1Q8NHV9 184 aa13.55□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 HUS1BQ8NHY5 278 aa13.55□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 PITX2Q99697 317 aa13.55□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 NRTNQ99748 197 aa13.55□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 ZNF226Q9NYT6 803 aa13.55□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 ERVW-1Q9UQF0 538 aa13.55□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa13.55□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 BACE2Q9Y5Z0 518 aa13.55□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 PCM1Q15154 2024 aa13.55□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 FADS2P1A8MWK0 482 aa13.55□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 KCNK2O95069 426 aa13.55□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 C6orf47O95873 294 aa13.55□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 HBA1P69905 142 aa13.55□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 HTRA3P83110 453 aa13.55□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP13.55□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 PRSS53Q2L4Q9 553 aa13.55□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 ZNF404Q494X3 552 aa13.55□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa13.55□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 AGTRAPQ6RW13 159 aa13.55□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 TMPRSS11BQ86T26 416 aa13.55□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa13.55□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 HRASLS5Q96KN8 279 aa13.55□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 SIAEQ9HAT2 523 aa13.55□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa13.54□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 PCDH17O14917 1159 aa13.54□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 GSTT2P0CG29 244 aa13.54□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 GSTT2BP0CG30 244 aa13.54□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 CTSKP43235 329 aa13.54□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 TMEM53Q6P2H8 277 aa13.54□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 HEATR4Q86WZ0 1026 aa13.54□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 LGI4Q8N135 537 aa13.54□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 ELMOD1Q8N336 334 aa13.54□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 DNAJC22Q8N4W6 341 aa13.54□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 OR8J2Q8NGG1 315 aa13.54□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 ZNF675Q8TD23 568 aa13.54□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa13.54□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 SNX8Q9Y5X2 465 aa13.54□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 CHD7Q9P2D1 2997 aa13.54□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa13.54□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 MGAT4DA6NG13 374 aa13.54□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 METTL15A6NJ78 407 aa13.54□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 ADORA3P0DMS8 318 aa13.54□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 ALOX12P18054 663 aa13.54□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 IDSP22304 550 aa13.54□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 WEE1P30291 646 aa13.54□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 HNMTP50135 292 aa13.54□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 EPHB3P54753 998 aa13.54□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 KCNJ8Q15842 424 aa13.54□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 UAP1L1Q3KQV9 507 aa13.54□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 UBE2UQ5VVX9 321 aa13.54□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 ERICH5Q6P6B1 374 aa13.54□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 SLC43A3Q8NBI5 491 aa13.54□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 NEIL2Q969S2 332 aa13.54□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 OR5M11Q96RB7 305 aa13.54□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 CCM2Q9BSQ5 444 aa13.54□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 DOHHQ9BU89 302 aa13.54□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa13.54□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 ADPRHL2Q9NX46 363 aa13.54□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 OGDHLQ9ULD0 1010 aa13.54□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 ITM2BQ9Y287 266 aa13.54□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa13.54□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 EFEMP2O95967 443 aa13.53□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 TGFB1P01137 390 aa13.53□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 INHAP05111 366 aa13.53□□□□□ -0.24
CNGA3-204ENST00000409937 POU1F1P28069 291 aa13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms