RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 SERPINB3P29508 390 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 MMP12P39900 470 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 NSG1P42857 185 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 RGS4P49798 205 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 AQP5P55064 265 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 TMPRSS3P57727 454 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 HERVK_113P63132 956 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 ROM1Q03395 351 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 COL10A1Q03692 680 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 ZBTB16Q05516 673 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 ELP6Q0PNE2 266 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 ARHGEF7Q14155 803 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 NUMA1Q14980 2115 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 HLA-BQ31612 363 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 TBC1D25Q3MII6 688 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 ZNF805Q5CZA5 627 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 METTL21CQ5VZV1 264 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 SEL1L3Q68CR1 1132 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 TMEM215Q68D42 235 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 ERAP2Q6P179 960 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 CRTC1Q6UUV9 634 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 FAM151BQ6UXP7 276 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 NAPRTQ6XQN6 538 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 DSG4Q86SJ6 1040 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 ISCA2Q86U28 154 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 SERPINA9Q86WD7 417 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 ZNF781Q8N8C0 355 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 STAG3L4Q8TBR4 150 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 ANKRD49Q8WVL7 239 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 OR8D1Q8WZ84 308 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 EID2BQ96D98 161 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 PANX3Q96QZ0 392 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 ATOH8Q96SQ7 321 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 GPR21Q99679 349 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 ERVK-6Q9BXR3 956 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 C20orf27Q9GZN8 174 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 ALG9Q9H6U8 611 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 ASB8Q9H765 288 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 IL26Q9NPH9 171 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 STK38LQ9Y2H1 464 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 PDZD2O15018 2839 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 PCSK5Q92824 1860 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 AKAP9Q99996 3911 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 TRPC5OSA6NMA1 111 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 ITM2AO43736 263 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 ZBTB14O43829 449 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 MAGEC1O60732 1142 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 NIPSNAP2O75323 286 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 AP2A2O94973 939 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 CLDN7O95471 211 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 TSPAN12O95859 305 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 RPS17P08708 135 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 PRSS56P0CW18 603 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 CBSLP0DN79 551 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 ITGB6P18564 788 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 XPAP23025 273 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 FMO4P31512 558 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 ARRB2P32121 409 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 GKP32189 559 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 CBSP35520 551 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 MAPK9P45984 424 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 SPINT3P49223 89 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 MAN2A2P49641 1150 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 RPL14P50914 215 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 NAGLUP54802 743 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 IL2P60568 153 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP6.35□□□□□ -1.393e-9■■■■■ 29.4
CCL20-202ENST00000409189 KDSRQ06136 332 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 RALGDSQ12967 914 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 CDC16Q13042 620 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 SP140Q13342 867 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 ZNF284Q2VY69 593 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 LINC00303Q3SY05 128 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 ZNF678Q5SXM1 525 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 HES3Q5TGS1 186 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 TMEM207Q6UWW9 146 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 SLC36A4Q6YBV0 504 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 ASRGL1Q7L266 308 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 TAS2R42Q7RTR8 314 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 MAVSQ7Z434 540 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 TSPAN33Q86UF1 283 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 NRSN1Q8IZ57 195 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 MYO1HQ8N1T3 1032 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 TRAM1L1Q8N609 369 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 ZBTB2Q8N680 514 aa6.35□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms