RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 CREB5Q02930 508 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 BTBD16Q32M84 506 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 CDKL4Q5MAI5 379 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 C6orf141Q5SZD1 244 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 AADACL4Q5VUY2 407 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 IFNL1Q8IU54 200 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 CFAP206Q8IYR0 622 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 ELMOD2Q8IZ81 293 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 TOMM5Q8N4H5 51 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 WDTC1Q8N5D0 677 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 SCAMP5Q8TAC9 235 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 PMM1Q92871 262 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 NKD1Q969G9 470 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 COL21A1Q96P44 957 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 GAL3ST4Q96RP7 486 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 FXYD6Q9H0Q3 95 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 PDLIM7Q9NR12 457 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 FZD4Q9ULV1 537 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 PLCL2Q9UPR0 1127 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 IRAK2O43187 625 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 ANXA3P12429 323 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 KCNE1P15382 129 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 GDF5P43026 501 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 NFKB2Q00653 900 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 SGCBQ16585 318 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 ARL9Q6T311 187 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 GALNT6Q8NCL4 622 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 OR5AK3PQ8NH89 298 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 OSBPL2Q9H1P3 480 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 RNF121Q9H920 327 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 SMURF1Q9HCE7 757 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 TM9SF3Q9HD45 589 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 LTBP3Q9NS15 1303 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 RCBTB2O95199 551 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 PET100P0DJ07 73 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 FLT3LGP49771 235 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 C3orf33Q6P1S2 294 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM126BQ8IUX1 230 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 SCML4Q8N228 414 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 STOML3Q8TAV4 291 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 POC1BQ8TC44 478 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 LRRC46Q96FV0 321 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 C16orf58Q96GQ5 468 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 SLC38A3Q99624 504 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 TTYH2Q9BSA4 534 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 NUDT15Q9NV35 164 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 SPATA7Q9P0W8 599 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 CFAP97Q9P2B7 532 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 LAMA4Q16363 1823 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF878C9JN71 531 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 ARVCFO00192 962 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 SOX14O95416 240 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 FCER2P06734 321 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 PRPS1L1P21108 318 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 PLA2G16P53816 162 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 IL10RBQ08334 325 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 SCARB2Q14108 478 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 GRK1Q15835 563 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 TIGD5Q53EQ6 642 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 NLGN2Q8NFZ4 835 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 FUZQ9BT04 418 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 TMED9Q9BVK6 235 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 RNF39Q9H2S5 420 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 MMP27Q9H306 513 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 DPAGT1Q9H3H5 408 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF696Q9H7X3 374 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 ANKHQ9HCJ1 492 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 TREM1Q9NP99 234 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 ALKBH4Q9NXW9 302 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 A0A0G2JN53 185 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 SLC35F4A4IF30 521 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 SDHDO14521 159 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 MPIP34949 423 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 SLC9A3P48764 834 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 PYURFQ96I23 114 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 NPY6RQ99463 290 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 MYNNQ9NPC7 610 aa8.6□□□□□ -1.03
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