RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392539.3

HOXD13-201, Transcript of homeobox D13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD13, Length 2,240 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13-201ENST00000392539 ENTHD1Q8IYW4 607 aa25.41■■□□□ 1.66
HOXD13-201ENST00000392539 NAGSQ8N159 534 aa25.41■■□□□ 1.66
HOXD13-201ENST00000392539 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
HOXD13-201ENST00000392539 GPR156Q8NFN8 814 aa25.41■■□□□ 1.66
HOXD13-201ENST00000392539 MAL2Q969L2 176 aa25.41■■□□□ 1.66
HOXD13-201ENST00000392539 EPS8L2Q9H6S3 715 aa25.41■■□□□ 1.66
HOXD13-201ENST00000392539 ATP6V1HQ9UI12 483 aa25.41■■□□□ 1.66
HOXD13-201ENST00000392539 TOR1BO14657 336 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXD13-201ENST00000392539 PCDH7O60245 1069 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXD13-201ENST00000392539 MYCP01106 439 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
HOXD13-201ENST00000392539 NTRK1P04629 796 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXD13-201ENST00000392539 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
HOXD13-201ENST00000392539 RPS13P62277 151 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
HOXD13-201ENST00000392539 SELENOWP63302 87 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXD13-201ENST00000392539 FADDQ13158 208 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXD13-201ENST00000392539 TRIM60Q495X7 471 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXD13-201ENST00000392539 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXD13-201ENST00000392539 KREMEN2Q8NCW0 462 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXD13-201ENST00000392539 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
HOXD13-201ENST00000392539 APH1BQ8WW43 257 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXD13-201ENST00000392539 UBE2FQ969M7 185 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXD13-201ENST00000392539 ALPK1Q96QP1 1244 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXD13-201ENST00000392539 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXD13-201ENST00000392539 OR2A25A4D2G3 310 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXD13-201ENST00000392539 ADAMDEC1O15204 470 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXD13-201ENST00000392539 AQP1P29972 269 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXD13-201ENST00000392539 ALDH4A1P30038 563 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXD13-201ENST00000392539 DEFB115Q30KQ5 88 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXD13-201ENST00000392539 UBE2UQ5VVX9 321 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXD13-201ENST00000392539 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXD13-201ENST00000392539 AHSA2Q719I0 299 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXD13-201ENST00000392539 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
HOXD13-201ENST00000392539 TOX2Q96NM4 488 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXD13-201ENST00000392539 MROQ9BYG7 248 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXD13-201ENST00000392539 SELENONQ9NZV5 590 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXD13-201ENST00000392539 DAPK2Q9UIK4 370 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXD13-201ENST00000392539 TMEM229AB2RXF0 380 aa25.39■■□□□ 1.66
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF197O14709 1029 aa25.39■■□□□ 1.66
HOXD13-201ENST00000392539 CCL16O15467 120 aa25.39■■□□□ 1.66
HOXD13-201ENST00000392539 CDH3P22223 829 aa25.39■■□□□ 1.66
HOXD13-201ENST00000392539 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
HOXD13-201ENST00000392539 CCR2P41597 374 aa25.39■■□□□ 1.66
HOXD13-201ENST00000392539 CCR3P51677 355 aa25.39■■□□□ 1.66
HOXD13-201ENST00000392539 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
HOXD13-201ENST00000392539 BTLAQ7Z6A9 289 aa25.39■■□□□ 1.66
HOXD13-201ENST00000392539 FAM124AQ86V42 546 aa25.39■■□□□ 1.66
HOXD13-201ENST00000392539 P3H2Q8IVL5 708 aa25.39■■□□□ 1.66
HOXD13-201ENST00000392539 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
HOXD13-201ENST00000392539 SPPL2AQ8TCT8 520 aa25.39■■□□□ 1.66
HOXD13-201ENST00000392539 MYLIPQ8WY64 445 aa25.39■■□□□ 1.66
HOXD13-201ENST00000392539 FCGR1BQ92637 280 aa25.39■■□□□ 1.66
HOXD13-201ENST00000392539 SPHK2Q9NRA0 654 aa25.39■■□□□ 1.66
HOXD13-201ENST00000392539 CLDN24A6NM45 220 aa25.39■■□□□ 1.65
HOXD13-201ENST00000392539 TNFRSF11BO00300 401 aa25.39■■□□□ 1.65
HOXD13-201ENST00000392539 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.65
HOXD13-201ENST00000392539 NNMTP40261 264 aa25.39■■□□□ 1.65
HOXD13-201ENST00000392539 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa25.39■■□□□ 1.65
HOXD13-201ENST00000392539 NEIL2Q969S2 332 aa25.39■■□□□ 1.65
HOXD13-201ENST00000392539 REEP4Q9H6H4 257 aa25.39■■□□□ 1.65
HOXD13-201ENST00000392539 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.65
HOXD13-201ENST00000392539 OGDHLQ9ULD0 1010 aa25.39■■□□□ 1.65
HOXD13-201ENST00000392539 DOLKQ9UPQ8 538 aa25.39■■□□□ 1.65
HOXD13-201ENST00000392539 RNF6Q9Y252 685 aa25.39■■□□□ 1.65
HOXD13-201ENST00000392539 TTC34A8MYJ7 566 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXD13-201ENST00000392539 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
HOXD13-201ENST00000392539 CRATP43155 626 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXD13-201ENST00000392539 OXA1LQ15070 435 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXD13-201ENST00000392539 TMEM215Q68D42 235 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXD13-201ENST00000392539 TMEM220Q6QAJ8 160 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXD13-201ENST00000392539 TMPRSS11BQ86T26 416 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXD13-201ENST00000392539 ATAD3AQ9NVI7 634 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXD13-201ENST00000392539 IL36AQ9UHA7 158 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXD13-201ENST00000392539 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXD13-201ENST00000392539 FGF18O76093 207 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXD13-201ENST00000392539 CD36P16671 472 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXD13-201ENST00000392539 GGT2P36268 569 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXD13-201ENST00000392539 PXNP49023 591 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
HOXD13-201ENST00000392539 NCS1P62166 190 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF763Q0D2J5 394 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF385BQ569K4 471 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF805Q5CZA5 627 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXD13-201ENST00000392539 MINDY2Q8NBR6 621 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXD13-201ENST00000392539 DNASE1L2Q92874 299 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXD13-201ENST00000392539 KCNC2Q96PR1 638 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXD13-201ENST00000392539 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXD13-201ENST00000392539 NDUFAF4Q9P032 175 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXD13-201ENST00000392539 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXD13-201ENST00000392539 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
HOXD13-201ENST00000392539 TESMINQ9Y4I5 508 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXD13-201ENST00000392539 FKTNO75072 461 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXD13-201ENST00000392539 ADH1AP07327 375 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXD13-201ENST00000392539 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
HOXD13-201ENST00000392539 TGFBR2P37173 567 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXD13-201ENST00000392539 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
HOXD13-201ENST00000392539 CYP2A13Q16696 494 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXD13-201ENST00000392539 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
HOXD13-201ENST00000392539 GPR153Q6NV75 609 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXD13-201ENST00000392539 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXD13-201ENST00000392539 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
HOXD13-201ENST00000392539 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms