RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391071.1

RNA5SP171-201, Transcript of RNA, 5S ribosomal pseudogene 171, humanhuman

BASIC

Gene RNA5SP171, Length 115 nt, Biotype rRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNA5SP171-201ENST00000391071 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa3.4□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 CNTN6Q9UQ52 1028 aa3.4□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 CAMK2AQ9UQM7 478 aa3.4□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 RNF115Q9Y4L5 304 aa3.4□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 MMP24Q9Y5R2 645 aa3.4□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 ALMS1Q8TCU4 4167 aa3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 A0A0J9YVX5 310 aa3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 MYO1FO00160 1098 aa3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 DFFAO00273 331 aa3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 AURKAO14965 403 aa3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 LILRA1O75019 489 aa3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 TGM6O95932 706 aa3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 CGAP01215 116 aa3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 PIRTP0C851 137 aa3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 CCL3P10147 92 aa3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 KRT13P13646 458 aa3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 SELEP16581 610 aa3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 PRTN3P24158 256 aa3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 NR2F2P24468 414 aa3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 SOX3P41225 446 aa3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 PTPN9P43378 593 aa3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 DIO3P55073 304 aa3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 C21orf58P58505 322 aa3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 RHAGQ02094 409 aa3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 ENPEPQ07075 957 aa3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 CD69Q07108 199 aa3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 ZNF844Q08AG5 666 aa3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 GALNT2Q10471 571 aa3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 AP1B1Q10567 949 aa3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 RAB35Q15286 201 aa3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 TAF9Q16594 264 aa3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 HKDC1Q2TB90 917 aa3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 IQCCQ4KMZ1 466 aa3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 DEFB121Q5J5C9 76 aa3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 FAM182AQ5T1J6 154 aa3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 NCMAPQ5T1S8 102 aa3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 MFSD4BQ5TF39 518 aa3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 MCTP1Q6DN14 999 aa3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 DENND5AQ6IQ26 1287 aa3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 SARM1Q6SZW1 724 aa3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 C17orf107Q6ZR85 190 aa3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 GK5Q6ZS86 529 aa3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 PRSS41Q7RTY9 318 aa3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 TMC3Q7Z5M5 1100 aa3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 PPM1KQ8N3J5 372 aa3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 ZNF610Q8N9Z0 462 aa3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 LINC01555Q8NAE3 123 aa3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 LPCAT1Q8NF37 534 aa3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 OR5AR1Q8NGP9 310 aa3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 SGCDQ92629 289 aa3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 TMIGD2Q96BF3 282 aa3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 FAF2Q96CS3 445 aa3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 THAP11Q96EK4 314 aa3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 CABS1Q96KC9 395 aa3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 VPS35Q96QK1 796 aa3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 SERINC2Q96SA4 455 aa3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 LPAR4Q99677 370 aa3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 C7orf25Q9BPX7 421 aa3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 TUBA1CQ9BQE3 449 aa3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 C11orf70Q9BRQ4 267 aa3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 KLHL4Q9C0H6 718 aa3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 BPESC1Q9GZL8 116 aa3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 ADAP2Q9NPF8 381 aa3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 FZD10Q9ULW2 581 aa3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 MOKQ9UQ07 419 aa3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 SHOC2Q9UQ13 582 aa3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 ERVK-11Q9UQG0 969 aa3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 SLC6A5Q9Y345 797 aa3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 ATG4BQ9Y4P1 393 aa3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 U3KQK5 164 aa3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 KMT2AQ03164 3969 aa3.38□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 A0A0U1RQJ8 604 aa3.38□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 ESYT3A0FGR9 886 aa3.38□□□□□ -1.87
RNA5SP171-201ENST00000391071 DPRXA6NFQ7 191 aa3.38□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms