RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 ASB1Q9Y576 335 aa14.63□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 MAU2Q9Y6X3 613 aa14.63□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 CDC14CA4D256 554 aa14.62□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 CCDC151A5D8V7 595 aa14.62□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 I3L1I5 382 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 CLEC3AO75596 197 aa14.62□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 NSA2O95478 260 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 STATHP02808 62 aa14.62□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 EPORP19235 508 aa14.62□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 CRHR1P34998 444 aa14.62□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 CYP4F2P78329 520 aa14.62□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 NFKB2Q00653 900 aa14.62□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 E2F2Q14209 437 aa14.62□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 SSPNQ14714 243 aa14.62□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC9A5Q14940 896 aa14.62□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 UGT8Q16880 541 aa14.62□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 CCDC153Q494R4 210 aa14.62□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 LIPJQ5W064 366 aa14.62□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 MED27Q6P2C8 311 aa14.62□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa14.62□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM151AQ8N4L1 468 aa14.62□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa14.62□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 ANKRD53Q8N9V6 530 aa14.62□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 KCT2Q8NC54 265 aa14.62□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 OR2Y1Q8NGV0 311 aa14.62□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 PPP4R1Q8TF05 950 aa14.62□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 NACC2Q96BF6 587 aa14.62□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 REPS1Q96D71 796 aa14.62□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 VPS50Q96JG6 964 aa14.62□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 RUFY1Q96T51 708 aa14.62□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 MACROD1Q9BQ69 325 aa14.62□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 YIPF2Q9BWQ6 316 aa14.62□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 SPNS1Q9H2V7 528 aa14.62□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC22A11Q9NSA0 550 aa14.62□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 C14orf105Q9NVL8 296 aa14.62□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 TRPC4Q9UBN4 977 aa14.62□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 MID2Q9UJV3 735 aa14.62□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 POLHQ9Y253 713 aa14.62□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa14.62□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 ITPR1Q14643 2758 aa14.62□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 MGAQ8IWI9 3026 aa14.61□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A088AWK7 358 aa14.61□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 A8MT66 165 aa14.61□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 E2F3O00716 465 aa14.61□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 FOXS1O43638 330 aa14.61□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 MED26O95402 600 aa14.61□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 IGHEP01854 428 aa14.61□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 ALOX12P18054 663 aa14.61□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 IL10P22301 178 aa14.61□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 RPS18P62269 152 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 HERVK_113P63132 956 aa14.61□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 PHEXP78562 749 aa14.61□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 TGM3Q08188 693 aa14.61□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 NKG7Q16617 165 aa14.61□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 KRT71Q3SY84 523 aa14.61□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 GRHL2Q6ISB3 625 aa14.61□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 SH2D5Q6ZV89 423 aa14.61□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa14.61□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 RDH11Q8TC12 318 aa14.61□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 CCT6BQ92526 530 aa14.61□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 MIEF2Q96C03 454 aa14.61□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa14.61□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 ERVK-6Q9BXR3 956 aa14.61□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC6A16Q9GZN6 736 aa14.61□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 RHBGQ9H310 441 aa14.61□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 PCTPQ9UKL6 214 aa14.61□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa14.61□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa14.61□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 LAMA5O15230 3695 aa14.61□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 KLHL18O94889 574 aa14.6□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 CLDN9O95484 217 aa14.6□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 MYL2P10916 166 aa14.6□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 IL1RNP18510 177 aa14.6□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 CCR10P46092 362 aa14.6□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 CCNG1P51959 295 aa14.6□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 PRKAA2P54646 552 aa14.6□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 NAA20P61599 178 aa14.6□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC18A2Q05940 514 aa14.6□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 DEFB109BQ30KR1 87 aa14.6□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 BORAQ6PGQ7 559 aa14.6□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 COX15Q7KZN9 410 aa14.6□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 TRABD2AQ86V40 505 aa14.6□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa14.6□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 CCDC63Q8NA47 563 aa14.6□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PGGT1B-202ENST00000379615 OR9A4Q8NGU2 314 aa14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms