RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378546.8

FAAP20-202, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAAP20, Length 729 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-202ENST00000378546 CDC7O00311 574 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 DEFB134Q4QY38 66 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 C4orf17Q53FE4 359 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 TMEM207Q6UWW9 146 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 BCORP1Q8N888 145 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 ZNF740Q8NDX6 193 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 SUN3Q8TAQ9 357 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 PYROXD1Q8WU10 500 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 FAR1Q8WVX9 515 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 MOCOSQ96EN8 888 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 PDLIM2Q96JY6 352 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 GPAMQ9HCL2 828 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 OLAHQ9NV23 265 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 NAV2Q8IVL1 2488 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 OR2W5A6NFC9 320 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 A8MUI8 341 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 E7ESA3 106 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 TNFSF10P50591 281 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 TAS2R39P59534 338 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 PWP1Q13610 501 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 PPP1R3AQ16821 1122 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 ABHD13Q7L211 337 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 SHISA5Q8N114 240 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 OR4K1Q8NGD4 311 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 OR5T3Q8NGG3 340 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 CDKL2Q92772 493 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 IMMP1LQ96LU5 166 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 AIF1LQ9BQI0 150 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 RHOJQ9H4E5 214 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 SAYSD1Q9NPB0 183 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 MOCS1Q9NZB8 636 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 ZFP69BQ9UJL9 534 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 KCNE2Q9Y6J6 123 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 TP73O15350 636 aa24.03■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 WDPCPO95876 746 aa24.03■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 EDN3P14138 238 aa24.03■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 ALOX12P18054 663 aa24.03■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 OLR1P78380 273 aa24.03■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 ABRAXAS2Q15018 415 aa24.03■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa24.03■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 NIPAL1Q6NVV3 410 aa24.03■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 ANKRD37Q7Z713 158 aa24.03■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 OR1F2PQ96R84 312 aa24.03■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 SPNS1Q9H2V7 528 aa24.03■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 PELI2Q9HAT8 420 aa24.03■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 SLC22A14Q9Y267 594 aa24.03■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 OARD1Q9Y530 152 aa24.03■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 FAM187AA6NFU0 413 aa24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 PIAS1O75925 651 aa24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 IL10P22301 178 aa24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 JAK1P23458 1154 aa24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 HNF4AP41235 474 aa24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 REEP5Q00765 189 aa24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 C2orf54Q08AI8 447 aa24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 TSNQ15631 228 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 NSDHLQ15738 373 aa24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 PLAG1Q6DJT9 500 aa24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 MAATS1Q7Z4T9 603 aa24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 ANKRD7Q92527 254 aa24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 HAS2Q92819 552 aa24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 SARGQ9BW04 601 aa24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 KCNK13Q9HB14 408 aa24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 STMN3Q9NZ72 180 aa24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 OSGIN2Q9Y236 505 aa24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-202ENST00000378546 URADA6NGE7 173 aa24.01■■□□□ 1.43
FAAP20-202ENST00000378546 E2F3O00716 465 aa24.01■■□□□ 1.43
FAAP20-202ENST00000378546 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
FAAP20-202ENST00000378546 WDR47O94967 919 aa24.01■■□□□ 1.43
FAAP20-202ENST00000378546 MYBL2P10244 700 aa24.01■■□□□ 1.43
FAAP20-202ENST00000378546 AHRP35869 848 aa24.01■■□□□ 1.43
FAAP20-202ENST00000378546 SCTRP47872 440 aa24.01■■□□□ 1.43
FAAP20-202ENST00000378546 HNMTP50135 292 aa24.01■■□□□ 1.43
FAAP20-202ENST00000378546 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
FAAP20-202ENST00000378546 INAQ16352 499 aa24.01■■□□□ 1.43
FAAP20-202ENST00000378546 EXT1Q16394 746 aa24.01■■□□□ 1.43
FAAP20-202ENST00000378546 SFT2D3Q587I9 215 aa24.01■■□□□ 1.43
FAAP20-202ENST00000378546 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
FAAP20-202ENST00000378546 CEP97Q8IW35 865 aa24.01■■□□□ 1.43
FAAP20-202ENST00000378546 AMER2Q8N7J2 671 aa24.01■■□□□ 1.43
FAAP20-202ENST00000378546 NT5CQ8TCD5 201 aa24.01■■□□□ 1.43
FAAP20-202ENST00000378546 ANKRD49Q8WVL7 239 aa24.01■■□□□ 1.43
FAAP20-202ENST00000378546 TBC1D20Q96BZ9 403 aa24.01■■□□□ 1.43
FAAP20-202ENST00000378546 TSPAN17Q96FV3 270 aa24.01■■□□□ 1.43
FAAP20-202ENST00000378546 LPAR4Q99677 370 aa24.01■■□□□ 1.43
FAAP20-202ENST00000378546 ERP44Q9BS26 406 aa24.01■■□□□ 1.43
FAAP20-202ENST00000378546 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
FAAP20-202ENST00000378546 POPDC3Q9HBV1 291 aa24.01■■□□□ 1.43
FAAP20-202ENST00000378546 WHRNQ9P202 907 aa24.01■■□□□ 1.43
FAAP20-202ENST00000378546 ABI3Q9P2A4 366 aa24.01■■□□□ 1.43
FAAP20-202ENST00000378546 SCN2AQ99250 2005 aa24■■□□□ 1.43
FAAP20-202ENST00000378546 OR5H15A6NDH6 313 aa24■■□□□ 1.43
FAAP20-202ENST00000378546 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.9 ms