RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362858.1

RNU6-655P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 655, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-655P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-655P-201ENST00000362858 KIAA1524Q8TCG1 905 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 DYRK2Q92630 601 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 C10orf90Q96M02 699 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 SPATA13Q96N96 652 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 LPAR4Q99677 370 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 NACAP1Q9BZK3 213 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 WWTR1Q9GZV5 400 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 MMP28Q9H239 520 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 C1orf21Q9H246 121 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 CARD9Q9H257 536 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 HSD3B7Q9H2F3 369 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 TMEM245Q9H330 911 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 EGLN3Q9H6Z9 239 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 SYTL2Q9HCH5 934 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 KCNMB3Q9NPA1 279 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 EXOC1Q9NV70 894 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 PANK4Q9NVE7 773 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 TBC1D13Q9NVG8 400 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 NINJ2Q9NZG7 142 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 UBQLN2Q9UHD9 624 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 FBXL4Q9UKA2 621 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP2.18□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP2.18□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 SERINC4A6NH21 518 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 MSGN1A6NI15 193 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 M0R296 226 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 BMPR1BO00238 502 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 SLC28A1O00337 649 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 KLF11O14901 512 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 CHUKO15111 745 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 EPHB6O15197 1021 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 TEX28O15482 410 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 KCNAB3O43448 404 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 EXTL3O43909 919 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 CLN5O75503 358 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 B3GALNT1O75752 331 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 GRAP2O75791 330 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 STAM2O75886 525 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 KRT36O76013 467 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 STBD1O95210 358 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 CLPTM1O96005 669 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP2.18□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 SLC4A1P02730 911 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 VTNP04004 478 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 MMP10P09238 476 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 UGT1A6P19224 532 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 CCKARP32238 428 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 MAGEA11P43364 429 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 TNFSF10P50591 281 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP2.18□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 DLX5P56178 289 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 GALK2Q01415 458 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP2.18□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP2.18□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 PDK1Q15118 436 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP2.18□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZNF74Q16587 644 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 KIAA1644Q3SXP7 199 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP2.18□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 SLC35E4Q6ICL7 350 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 CD164L2Q6UWJ8 174 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 FCRLAQ7L513 359 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 MIER3Q7Z3K6 550 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 ERC1Q8IUD2 1116 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 STHQ8IWL8 128 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 GPC2Q8N158 579 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 FAM89BQ8N5H3 189 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP2.18□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 RNF149Q8NC42 400 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 NEK11Q8NG66 645 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 EXOC6Q8TAG9 804 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 RSPH1Q8WYR4 309 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 SEPT8Q92599 483 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP2.18□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 HAS2Q92819 552 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 TMEM186Q96B77 213 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 SLCO4A1Q96BD0 722 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 ULK4Q96C45 1275 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZNF524Q96C55 264 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 GIMAP5Q96F15 307 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 LMLNQ96KR4 655 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZNF560Q96MR9 790 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 RUNDC3BQ96NL0 473 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 PKP2Q99959 881 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 FAM213AQ9BRX8 229 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZNF577Q9BSK1 485 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 FSD1Q9BTV5 496 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP2.18□□□□□ -2.06
RNU6-655P-201ENST00000362858 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP2.18□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.8 ms