RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345425.6

GIPC1-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-201ENST00000345425 MS4A8Q9BY19 250 aa26.5■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 URADA6NGE7 173 aa26.49■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 JMJD7P0C870 316 aa26.49■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 LSP1P33241 339 aa26.49■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 RPS13P62277 151 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 TLDC1Q6P9B6 456 aa26.49■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 CHSY3Q70JA7 882 aa26.49■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 PPP1R3BQ86XI6 285 aa26.49■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 DDIASQ8IXT1 998 aa26.49■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 HBEGFQ99075 208 aa26.49■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 SERPINI1Q99574 410 aa26.49■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 NMRK1Q9NWW6 199 aa26.49■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 PLD2O14939 933 aa26.48■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 HDAC3O15379 428 aa26.48■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 P2RX6O15547 441 aa26.48■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 TGFB1P01137 390 aa26.48■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 STATHP02808 62 aa26.48■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 CCL4P13236 92 aa26.48■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 GRM7Q14831 915 aa26.48■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 HKDC1Q2TB90 917 aa26.48■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 TRIM46Q7Z4K8 759 aa26.48■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 RNF175Q8N4F7 328 aa26.48■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 CHMP6Q96FZ7 201 aa26.48■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 CENPKQ9BS16 269 aa26.48■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 SLC6A16Q9GZN6 736 aa26.48■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 FITM1A5D6W6 292 aa26.48■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 H3BMH7 237 aa26.48■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 SLC28A1O00337 649 aa26.48■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 PIP5K1BO14986 540 aa26.48■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 RAB15P59190 212 aa26.48■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 IMPG1Q17R60 797 aa26.48■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 PRTGQ2VWP7 1150 aa26.48■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 SCIMPQ6UWF3 145 aa26.48■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 MACROD1Q9BQ69 325 aa26.48■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 TUBB1Q9H4B7 451 aa26.48■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa26.48■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 SLC39A1Q9NY26 324 aa26.48■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 ADAM21Q9UKJ8 722 aa26.48■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 LRIT2A6NDA9 550 aa26.47■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 TRPC5OSA6NMA1 111 aa26.47■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 CTSBP07858 339 aa26.47■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 FGF5P12034 268 aa26.47■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 CUL3Q13618 768 aa26.47■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 TMEM35AQ53FP2 167 aa26.47■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 C19orf60Q96EN9 201 aa26.47■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 STARD5Q9NSY2 213 aa26.47■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 SLC12A4Q9UP95 1085 aa26.47■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 PTPRBP23467 1997 aa26.47■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 KIF26BQ2KJY2 2108 aa26.47■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 KNTC1P50748 2209 aa26.46■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 FAM149AA5PLN7 773 aa26.46■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 RGS14O43566 566 aa26.46■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 TGDSO95455 350 aa26.46■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 LINC00032P0C843 101 aa26.46■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 EMP3P54852 163 aa26.46■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 HYAL2Q12891 473 aa26.46■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 NDUFA9Q16795 377 aa26.46■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 ADPRMQ3LIE5 342 aa26.46■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 DEPDC1Q5TB30 811 aa26.46■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 GARNL3Q5VVW2 1013 aa26.46■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 LRRC34Q8IZ02 419 aa26.46■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 KCT2Q8NC54 265 aa26.46■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 ACPTQ9BZG2 426 aa26.46■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 OR51B5Q9H339 312 aa26.46■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 VPS29Q9UBQ0 182 aa26.46■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 BTKQ06187 659 aa26.46■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 TGM3Q08188 693 aa26.46■■□□□ 1.83
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GIPC1-201ENST00000345425 C3orf38Q5JPI3 329 aa26.46■■□□□ 1.83
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GIPC1-201ENST00000345425 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
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GIPC1-201ENST00000345425 NUF2Q9BZD4 464 aa26.46■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 PISDQ9UG56 409 aa26.46■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 USH1CQ9Y6N9 552 aa26.46■■□□□ 1.83
GIPC1-201ENST00000345425 ITIH1P19827 911 aa26.45■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP26.45■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 ABHD13Q7L211 337 aa26.45■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 GAL3ST3Q96A11 431 aa26.45■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 F2RL3Q96RI0 385 aa26.45■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 APMAPQ9HDC9 416 aa26.45■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 RIC8BQ9NVN3 520 aa26.45■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 SATB2Q9UPW6 733 aa26.45■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa26.45■■□□□ 1.82
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