RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323374.8

SPHK1-201, Transcript of sphingosine kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPHK1, Length 2,138 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1-201ENST00000323374 TEX101Q9BY14 249 aa20.87■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 CHST8Q9H2A9 424 aa20.87■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 MYNNQ9NPC7 610 aa20.87■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 KMOO15229 486 aa20.87■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 FURINP09958 794 aa20.87■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 ERGP11308 486 aa20.87■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 GDI1P31150 447 aa20.87■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 SHMT2P34897 504 aa20.87■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 C2orf80Q0P641 193 aa20.87■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 AGERQ15109 404 aa20.87■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 FAM129CQ86XR2 697 aa20.87■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 ARL10Q8N8L6 244 aa20.87■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 ACAT2Q9BWD1 397 aa20.87■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 PBX4Q9BYU1 374 aa20.87■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa20.87■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 TM9SF3Q9HD45 589 aa20.87■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 SEMG1P04279 462 aa20.86■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 FABP3P05413 133 aa20.86■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 KLK1P06870 262 aa20.86■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 PRKACGP22612 351 aa20.86■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 HLCSP50747 726 aa20.86■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 CDK9P50750 372 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 PDE7AQ13946 482 aa20.86■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 C16orf72Q14CZ0 275 aa20.86■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 RFX4Q33E94 735 aa20.86■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa20.86■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 OR2T5Q6IEZ7 315 aa20.86■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 SYCE2Q6PIF2 218 aa20.86■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 LPCAT2Q7L5N7 544 aa20.86■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 C17orf64Q86WR6 236 aa20.86■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 OR4K1Q8NGD4 311 aa20.86■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 OR2T29Q8NH02 315 aa20.86■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 PPCDCQ96CD2 204 aa20.86■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 MYADMQ96S97 322 aa20.86■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa20.86■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 WDR26Q9H7D7 661 aa20.86■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 BAG5Q9UL15 447 aa20.86■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 ABCG2Q9UNQ0 655 aa20.86■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 ORC6Q9Y5N6 252 aa20.86■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 A0A1W2PP55 124 aa20.86■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 KLHL33A6NCF5 533 aa20.86■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 GPR89AB7ZAQ6 455 aa20.86■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 NTRK1P04629 796 aa20.86■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 GPR89BP0CG08 455 aa20.86■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 ARHGDIAP52565 204 aa20.86■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 TAS2R50P59544 299 aa20.86■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 ZBED5Q49AG3 693 aa20.86■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 FAM71E1Q6IPT2 247 aa20.86■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 TMEM26Q6ZUK4 368 aa20.86■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 GALNT10Q86SR1 603 aa20.86■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 ELSPBP1Q96BH3 223 aa20.86■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 HSH2DQ96JZ2 352 aa20.86■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 SPASTQ9UBP0 616 aa20.86■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 SERGEFQ9UGK8 458 aa20.86■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 FKBP9O95302 570 aa20.85■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 NUDT7P0C024 238 aa20.85■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 ELK4P28324 431 aa20.85■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 RAD23AP54725 363 aa20.85■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 HBA1P69905 142 aa20.85■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 MC1RQ01726 317 aa20.85■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 KCNAB2Q13303 367 aa20.85■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 IER5LQ5T953 404 aa20.85■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 ANKRD34AQ69YU3 496 aa20.85■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 VN1R5Q7Z5H4 357 aa20.85■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 VTCN1Q7Z7D3 282 aa20.85■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 MTERF3Q96E29 417 aa20.85■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa20.85■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 PELI2Q9HAT8 420 aa20.85■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 VNN3Q9NY84 501 aa20.85■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 TAC3Q9UHF0 121 aa20.85■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 OR1A2Q9Y585 309 aa20.85■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa20.85■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 GPR37L1O60883 481 aa20.84■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 SLC35G4P0C7Q5 338 aa20.84■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 TEAD1P28347 426 aa20.84■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 YAP1P46937 504 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP20.84■□□□□ 0.931e-8■□□□□ 9.3
SPHK1-201ENST00000323374 PPP2R2DQ66LE6 453 aa20.84■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 ANKRD54Q6NXT1 300 aa20.84■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa20.84■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 NAGSQ8N159 534 aa20.84■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 AHSPQ9NZD4 102 aa20.84■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 ACSL5Q9ULC5 683 aa20.84■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 C5orf42Q9H799 3197 aa20.84■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 EPOPA6NHQ4 379 aa20.84■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 LINC01565O15544 149 aa20.84■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 KLHL18O94889 574 aa20.84■□□□□ 0.93
SPHK1-201ENST00000323374 C6orf47O95873 294 aa20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms