RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296871.3

CSF2-201, Transcript of colony stimulating factor 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSF2, Length 787 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2-201ENST00000296871 GRHL3Q8TE85 626 aa14.51□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 SLC5A11Q8WWX8 675 aa14.51□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 VPS39Q96JC1 886 aa14.51□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 CYTH2Q99418 400 aa14.51□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 TUBB6Q9BUF5 446 aa14.51□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP14.51□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 IKZF3Q9UKT9 509 aa14.51□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa14.5□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 A0A1W2PQ72 361 aa14.5□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 TRBC2A0A5B9 178 aa14.5□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 OR2W5A6NFC9 320 aa14.5□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 A8MUI8 341 aa14.5□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 CDC7O00311 574 aa14.5□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 PIAS1O75925 651 aa14.5□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 SOX11P35716 441 aa14.5□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 EFNA3P52797 238 aa14.5□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 RGS1Q08116 209 aa14.5□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 HERC3Q15034 1050 aa14.5□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 BTBD16Q32M84 506 aa14.5□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 ABHD17BQ5VST6 288 aa14.5□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 SBSNQ6UWP8 590 aa14.5□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 TMEM207Q6UWW9 146 aa14.5□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 AMER2Q8N7J2 671 aa14.5□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 ZNF740Q8NDX6 193 aa14.5□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 ABHD11Q8NFV4 315 aa14.5□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 PYROXD1Q8WU10 500 aa14.5□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 PSMF1Q92530 271 aa14.5□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 NEIL2Q969S2 332 aa14.5□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 MOCOSQ96EN8 888 aa14.5□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 PEX11GQ96HA9 241 aa14.5□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 OR4K3Q96R72 315 aa14.5□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa14.5□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 TXNDC16Q9P2K2 825 aa14.5□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa14.5□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 SLC22A7Q9Y694 548 aa14.5□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 NAV2Q8IVL1 2488 aa14.49□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 E7ESA3 106 aa14.49□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 TP73O15350 636 aa14.49□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 RNF224P0DH78 156 aa14.49□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 HNF4AP41235 474 aa14.49□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 TAS2R39P59534 338 aa14.49□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 SKP1P63208 163 aa14.49□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 OLR1P78380 273 aa14.49□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 ZNF33BQ06732 778 aa14.49□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 DEFB134Q4QY38 66 aa14.49□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 C4orf17Q53FE4 359 aa14.49□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa14.49□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 TMPRSS11BQ86T26 416 aa14.49□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa14.49□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 OR5T3Q8NGG3 340 aa14.49□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 ZNF592Q92610 1267 aa14.49□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 C5orf34Q96MH7 638 aa14.49□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 SPNS1Q9H2V7 528 aa14.49□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 GPAMQ9HCL2 828 aa14.49□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 SAYSD1Q9NPB0 183 aa14.49□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 MOCS1Q9NZB8 636 aa14.49□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 TEKT2Q9UIF3 430 aa14.49□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 SLC22A14Q9Y267 594 aa14.49□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 SLC5A6Q9Y289 635 aa14.49□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 SCN3AQ9NY46 2000 aa14.48□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 TRAV17A0A0B4J275 112 aa14.48□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 DDAH2O95865 285 aa14.48□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 WDPCPO95876 746 aa14.48□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 B3GALT4O96024 378 aa14.48□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 ALOX12P18054 663 aa14.48□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 AGTR2P50052 363 aa14.48□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 TNFSF10P50591 281 aa14.48□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 C2orf54Q08AI8 447 aa14.48□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 PWP1Q13610 501 aa14.48□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 ABRAXAS2Q15018 415 aa14.48□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 NSDHLQ15738 373 aa14.48□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 PPP1R3AQ16821 1122 aa14.48□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 ABHD13Q7L211 337 aa14.48□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 MAATS1Q7Z4T9 603 aa14.48□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 ANKRD37Q7Z713 158 aa14.48□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 CEP97Q8IW35 865 aa14.48□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 OR4K1Q8NGD4 311 aa14.48□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 SUN3Q8TAQ9 357 aa14.48□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 FAR1Q8WVX9 515 aa14.48□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 CDKL2Q92772 493 aa14.48□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 IMMP1LQ96LU5 166 aa14.48□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 AIF1LQ9BQI0 150 aa14.48□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 ERP44Q9BS26 406 aa14.48□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 RHOJQ9H4E5 214 aa14.48□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 PELI2Q9HAT8 420 aa14.48□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 OLAHQ9NV23 265 aa14.48□□□□□ -0.09
CSF2-201ENST00000296871 ZFP69BQ9UJL9 534 aa14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms