RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285199.11

USP43-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 43, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP43, Length 4,169 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43-201ENST00000285199 NTSP30990 170 aa15.19■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 BDKRB1P46663 353 aa15.19■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP15.19■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 ZNF181Q2M3W8 571 aa15.19■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa15.19■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 ZNF697Q5TEC3 545 aa15.19■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 TICAM1Q8IUC6 712 aa15.19■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa15.19■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 RDH8Q9NYR8 311 aa15.19■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 AGAP5A6NIR3 686 aa15.18■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa15.18■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 SLC10A3P09131 477 aa15.18■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 ELFN1P0C7U0 828 aa15.18■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 C4BPBP20851 252 aa15.18■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 RGRP47804 291 aa15.18■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 ZNF81P51508 661 aa15.18■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 NDUFAF6Q330K2 333 aa15.18■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 TXNDC8Q6A555 127 aa15.18■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 CEP68Q76N32 757 aa15.18■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa15.18■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa15.18■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 KCNH6Q9H252 994 aa15.18■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 USP3Q9Y6I4 520 aa15.18■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 MEN1O00255 615 aa15.18■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 CNR2P34972 360 aa15.18■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 AQP6Q13520 282 aa15.18■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 SPHARQ15513 63 aa15.18■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 ZSWIM9Q86XI8 627 aa15.18■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 NLGN2Q8NFZ4 835 aa15.18■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 AUTS2Q8WXX7 1259 aa15.18■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 UFD1Q92890 307 aa15.18■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 MAF1Q9H063 256 aa15.18■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 CPNE5Q9HCH3 593 aa15.18■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 TMEM248Q9NWD8 314 aa15.18■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa15.18■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 HPRP00739 348 aa15.18■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 NPPAP01160 153 aa15.18■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 C1QAP02745 245 aa15.18■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 EBLN1P0CF75 366 aa15.18■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 UQCRC1P31930 480 aa15.18■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 RPL4P36578 427 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 CAV3P56539 151 aa15.18■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 BEND5Q7L4P6 421 aa15.18■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 SCD5Q86SK9 330 aa15.18■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 CCDC28AQ8IWP9 274 aa15.18■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 OR52L1Q8NGH7 329 aa15.18■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 GTF2H4Q92759 462 aa15.18■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 AP2M1Q96CW1 435 aa15.18■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 FAM25EA8MYX2 175 aa15.17■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 PTGER1P34995 402 aa15.17■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 SMIM11AP58511 58 aa15.17■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 ATG9BQ674R7 924 aa15.17■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 PRSS48Q7RTY5 328 aa15.17■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 NPAS3Q8IXF0 933 aa15.17■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 FBXW2Q9UKT8 454 aa15.17■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 GPR52Q9Y2T5 361 aa15.17■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa15.17■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 SLC3A1Q07837 685 aa15.17■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 Q8N402 240 aa15.17■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 GATAD2BQ8WXI9 593 aa15.17■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 CENPOQ9BU64 300 aa15.17■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 SPAG17Q6Q759 2223 aa15.17■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 A0A1B0GW55 424 aa15.17■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 WWP2O00308 870 aa15.17■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 COQ9O75208 318 aa15.17■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 GPR32O75388 356 aa15.17■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 DUX4L2P0CJ85 424 aa15.17■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 DUX4L3P0CJ86 424 aa15.17■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 DUX4L4P0CJ87 422 aa15.17■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 DUX4L5P0CJ88 424 aa15.17■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 DUX4L6P0CJ89 424 aa15.17■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 DUX4L7P0CJ90 424 aa15.17■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 RPA4Q13156 261 aa15.17■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 FBXO43Q4G163 708 aa15.17■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 FUT10Q6P4F1 479 aa15.17■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 PAMR1Q6UXH9 720 aa15.17■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 PEX5LQ8IYB4 626 aa15.17■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 NAGSQ8N159 534 aa15.17■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 CD200R1Q8TD46 325 aa15.17■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 SH3RF2Q8TEC5 729 aa15.17■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 DOK4Q8TEW6 326 aa15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.3 ms