RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000280780.6

FAM53B-201, Transcript of family with sequence similarity 53 member B, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM53B, Length 1,568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM53B-201	ENST00000280780	ZBTB11	O95625	1053 aa	Predicted RBP	21.33	■■□□□ 1.01
FAM53B-201	ENST00000280780	PDYN	P01213	254 aa		21.33	■■□□□ 1.01
FAM53B-201	ENST00000280780	PCNA	P12004	261 aa		21.33	■■□□□ 1.01
FAM53B-201	ENST00000280780	CXCR2	P25025	360 aa		21.33	■■□□□ 1.01
FAM53B-201	ENST00000280780	GABRA4	P48169	554 aa		21.33	■■□□□ 1.01
FAM53B-201	ENST00000280780	IDH3A	P50213	366 aa		21.33	■■□□□ 1.01
FAM53B-201	ENST00000280780	RELA	Q04206	551 aa		21.33	■■□□□ 1.01
FAM53B-201	ENST00000280780	BTK	Q06187	659 aa		21.33	■■□□□ 1.01
FAM53B-201	ENST00000280780	KCNAB1	Q14722	419 aa		21.33	■■□□□ 1.01
FAM53B-201	ENST00000280780	NAA25	Q14CX7	972 aa		21.33	■■□□□ 1.01
FAM53B-201	ENST00000280780	DEFB110	Q30KQ9	67 aa		21.33	■■□□□ 1.01
FAM53B-201	ENST00000280780	LACTB2	Q53H82	288 aa	Predicted RBP	21.33	■■□□□ 1.01
FAM53B-201	ENST00000280780	FRMPD2B	Q6IN97	320 aa		21.33	■■□□□ 1.01
FAM53B-201	ENST00000280780	VN1R4	Q7Z5H5	301 aa		21.33	■■□□□ 1.01
FAM53B-201	ENST00000280780	HUS1B	Q8NHY5	278 aa		21.33	■■□□□ 1.01
FAM53B-201	ENST00000280780	PMEPA1	Q969W9	287 aa		21.33	■■□□□ 1.01
FAM53B-201	ENST00000280780	SLC41A2	Q96JW4	573 aa		21.33	■■□□□ 1.01
FAM53B-201	ENST00000280780	OR2A5	Q96R48	311 aa		21.33	■■□□□ 1.01
FAM53B-201	ENST00000280780	DPYSL5	Q9BPU6	564 aa		21.33	■■□□□ 1.01
FAM53B-201	ENST00000280780	STRADB	Q9C0K7	418 aa		21.33	■■□□□ 1.01
FAM53B-201	ENST00000280780	PITHD1	Q9GZP4	211 aa	Predicted RBP	21.33	■■□□□ 1.01
FAM53B-201	ENST00000280780	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		21.33	■■□□□ 1.01
FAM53B-201	ENST00000280780	RHBG	Q9H310	441 aa		21.33	■■□□□ 1.01
FAM53B-201	ENST00000280780	ZNF768	Q9H5H4	540 aa	Known RBP	21.33	■■□□□ 1.01
FAM53B-201	ENST00000280780	HEY2	Q9UBP5	337 aa		21.33	■■□□□ 1.01
FAM53B-201	ENST00000280780	USP24	Q9UPU5	2620 aa		21.33	■■□□□ 1.01
FAM53B-201	ENST00000280780	PCDHGA11	Q9Y5H2	935 aa		21.33	■■□□□ 1.01
FAM53B-201	ENST00000280780		A0A0J9YVX5	310 aa		21.32	■■□□□ 1
FAM53B-201	ENST00000280780	PLD2	O14939	933 aa		21.32	■■□□□ 1
FAM53B-201	ENST00000280780	HGS	O14964	777 aa	Predicted RBP	21.32	■■□□□ 1
FAM53B-201	ENST00000280780	PIP5K1B	O14986	540 aa		21.32	■■□□□ 1
FAM53B-201	ENST00000280780	STATH	P02808	62 aa		21.32	■■□□□ 1
FAM53B-201	ENST00000280780	CTSB	P07858	339 aa		21.32	■■□□□ 1
FAM53B-201	ENST00000280780	ANKRD34C	P0C6C1	535 aa		21.32	■■□□□ 1
FAM53B-201	ENST00000280780	CYP4F2	P78329	520 aa		21.32	■■□□□ 1
FAM53B-201	ENST00000280780	DDX39B	Q13838	428 aa	Known RBP	21.32	■■□□□ 1
FAM53B-201	ENST00000280780	VWA5B1	Q5TIE3	1220 aa		21.32	■■□□□ 1
FAM53B-201	ENST00000280780	DNAJC22	Q8N4W6	341 aa		21.32	■■□□□ 1
FAM53B-201	ENST00000280780	MFSD9	Q8NBP5	474 aa		21.32	■■□□□ 1
FAM53B-201	ENST00000280780	NXPE2	Q96DL1	559 aa		21.32	■■□□□ 1
FAM53B-201	ENST00000280780	TCTN2	Q96GX1	697 aa		21.32	■■□□□ 1
FAM53B-201	ENST00000280780	C3orf30	Q96M34	536 aa		21.32	■■□□□ 1
FAM53B-201	ENST00000280780	MTERF1	Q99551	399 aa	Known RBP	21.32	■■□□□ 1
FAM53B-201	ENST00000280780	EBF4	Q9BQW3	602 aa		21.32	■■□□□ 1
FAM53B-201	ENST00000280780	NUF2	Q9BZD4	464 aa		21.32	■■□□□ 1
FAM53B-201	ENST00000280780	CHRNA10	Q9GZZ6	450 aa		21.32	■■□□□ 1
FAM53B-201	ENST00000280780	ELOVL6	Q9H5J4	265 aa		21.32	■■□□□ 1
FAM53B-201	ENST00000280780	SNX6	Q9UNH7	406 aa		21.32	■■□□□ 1
FAM53B-201	ENST00000280780	TSC22D4	Q9Y3Q8	395 aa		21.32	■■□□□ 1
FAM53B-201	ENST00000280780	PCDHGA8	Q9Y5G5	932 aa		21.32	■■□□□ 1
FAM53B-201	ENST00000280780	DSP	P15924	2871 aa	Known RBP	21.32	■■□□□ 1
FAM53B-201	ENST00000280780	LOC105369274	A0A096LPK9	316 aa		21.31	■■□□□ 1
FAM53B-201	ENST00000280780	LOC102723532	A0A0G2JNH3	316 aa		21.31	■■□□□ 1
FAM53B-201	ENST00000280780	TMX2-CTNND1	H3BSU7	103 aa		21.31	■■□□□ 1
FAM53B-201	ENST00000280780	TOX3	O15405	576 aa	Predicted RBP	21.31	■■□□□ 1
FAM53B-201	ENST00000280780	TNFSF15	O95150	251 aa		21.31	■■□□□ 1
FAM53B-201	ENST00000280780	KRT6A	P02538	564 aa		21.31	■■□□□ 1
FAM53B-201	ENST00000280780	KRT6B	P04259	564 aa		21.31	■■□□□ 1
FAM53B-201	ENST00000280780	GRK3	P35626	688 aa		21.31	■■□□□ 1
FAM53B-201	ENST00000280780	KRT6C	P48668	564 aa		21.31	■■□□□ 1
FAM53B-201	ENST00000280780	RPS15A	P62244	130 aa	Known RBP	21.31	■■□□□ 1
FAM53B-201	ENST00000280780	HIST2H2AC	Q16777	129 aa	Predicted RBP	21.31	■■□□□ 1
FAM53B-201	ENST00000280780	HIST2H2AA3	Q6FI13	130 aa		21.31	■■□□□ 1
FAM53B-201	ENST00000280780	CCDC121	Q6ZUS5	278 aa		21.31	■■□□□ 1
FAM53B-201	ENST00000280780	OR4N4	Q8N0Y3	316 aa		21.31	■■□□□ 1
FAM53B-201	ENST00000280780	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		21.31	■■□□□ 1
FAM53B-201	ENST00000280780	OR2T11	Q8NH01	316 aa		21.31	■■□□□ 1
FAM53B-201	ENST00000280780	CREB3L4	Q8TEY5	395 aa		21.31	■■□□□ 1
FAM53B-201	ENST00000280780	SELENOM	Q8WWX9	145 aa		21.31	■■□□□ 1
FAM53B-201	ENST00000280780	UBE2E3	Q969T4	207 aa		21.31	■■□□□ 1
FAM53B-201	ENST00000280780	PPP1R36	Q96LQ0	422 aa		21.31	■■□□□ 1
FAM53B-201	ENST00000280780	ZFYVE21	Q9BQ24	234 aa		21.31	■■□□□ 1
FAM53B-201	ENST00000280780	SOHLH2	Q9NX45	425 aa		21.31	■■□□□ 1
FAM53B-201	ENST00000280780	DKK4	Q9UBT3	224 aa		21.31	■■□□□ 1
FAM53B-201	ENST00000280780	PISD	Q9UG56	409 aa		21.31	■■□□□ 1
FAM53B-201	ENST00000280780	MAGEB17	A8MXT2	336 aa		21.31	■■□□□ 1
FAM53B-201	ENST00000280780	ULK1	O75385	1050 aa		21.31	■■□□□ 1
FAM53B-201	ENST00000280780	ETHE1	O95571	254 aa		21.31	■■□□□ 1
FAM53B-201	ENST00000280780	LINC00032	P0C843	101 aa		21.31	■■□□□ 1
FAM53B-201	ENST00000280780	NELFE	P18615	380 aa	Known RBP	21.31	■■□□□ 1
FAM53B-201	ENST00000280780	HSD11B2	P80365	405 aa		21.31	■■□□□ 1
FAM53B-201	ENST00000280780	TRA2A	Q13595	282 aa	Known RBP eCLIP	21.31	■■□□□ 1
FAM53B-201	ENST00000280780	XKR7	Q5GH72	579 aa		21.31	■■□□□ 1
FAM53B-201	ENST00000280780	RNF165	Q6ZSG1	346 aa		21.31	■■□□□ 1
FAM53B-201	ENST00000280780	D2HGDH	Q8N465	521 aa		21.31	■■□□□ 1
FAM53B-201	ENST00000280780	ZCCHC14	Q8WYQ9	949 aa	Known RBP	21.31	■■□□□ 1
FAM53B-201	ENST00000280780	MAEL	Q96JY0	434 aa	Known RBP	21.31	■■□□□ 1
FAM53B-201	ENST00000280780	MACROD1	Q9BQ69	325 aa		21.31	■■□□□ 1
FAM53B-201	ENST00000280780	AICDA	Q9GZX7	198 aa		21.31	■■□□□ 1
FAM53B-201	ENST00000280780	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		21.31	■■□□□ 1
FAM53B-201	ENST00000280780	ZFP69B	Q9UJL9	534 aa		21.31	■■□□□ 1
FAM53B-201	ENST00000280780	CCL27	Q9Y4X3	112 aa		21.31	■■□□□ 1
FAM53B-201	ENST00000280780	ACACA	Q13085	2346 aa		21.3	■■□□□ 1
FAM53B-201	ENST00000280780	ANKRD11	Q6UB99	2663 aa	Predicted RBP	21.3	■■□□□ 1
FAM53B-201	ENST00000280780	P2RX6	O15547	441 aa		21.3	■■□□□ 1
FAM53B-201	ENST00000280780	DXO	O77932	396 aa	Known RBP	21.3	■■□□□ 1
FAM53B-201	ENST00000280780	KIAA0754	O94854	1291 aa		21.3	■■□□□ 1
FAM53B-201	ENST00000280780	AHR	P35869	848 aa		21.3	■■□□□ 1
FAM53B-201	ENST00000280780	MLLT3	P42568	568 aa	Predicted RBP	21.3	■■□□□ 1
FAM53B-201	ENST00000280780	RPS13	P62277	151 aa	Known RBP	21.3	■■□□□ 1

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