RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 SULT1C3Q6IMI6 304 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 RABEPKQ7Z6M1 372 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 PARP8Q8N3A8 854 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 DNAJB8Q8NHS0 232 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 FKBP10Q96AY3 582 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 NUS1Q96E22 293 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 VMP1Q96GC9 406 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 MAGIXQ9H6Y5 334 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 GAREM1Q9H706 876 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 BPIFA1Q9NP55 256 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 C3orf18Q9UK00 162 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 ALOX5P09917 674 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC159P0C7I6 412 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 IL1RNP18510 177 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 PFN3P60673 137 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 PPP2R2BQ00005 443 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 UGT3A1Q6NUS8 523 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 RNF165Q6ZSG1 346 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 ABHD11Q8NFV4 315 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF566Q969W8 418 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 ZBTB18Q99592 522 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 GPR21Q99679 349 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 NEURL2Q9BR09 285 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 LGR4Q9BXB1 951 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 ABCG8Q9H221 673 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 ST14Q9Y5Y6 855 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 C4orf47A7E2U8 309 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 GSTA4O15217 222 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 MT-ND1P03886 318 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 PKMP14618 531 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 RYKP34925 604 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 TRIM16LQ309B1 348 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 CRTC3Q6UUV7 619 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 Q6ZSR9 355 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 DENND6BQ8NEG7 585 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 MROQ9BYG7 248 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 GALPQ9UBC7 116 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 BAG5Q9UL15 447 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 SPTBN2O15020 2390 aa25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 C2orf81A6NN90 581 aa25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF30P17039 623 aa25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 ATP1A4Q13733 1029 aa25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP25.36■■□□□ 1.653e-9■□□□□ 10.3
CAPNS1-201ENST00000246533 CYP20A1Q6UW02 462 aa25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 IGFN1Q86VF2 1251 aa25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 OR2T12Q8NG77 320 aa25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 PPP3R2Q96LZ3 170 aa25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF583Q96ND8 569 aa25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 FUNDC2Q9BWH2 189 aa25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 CD274Q9NZQ7 290 aa25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 IKZF3Q9UKT9 509 aa25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 OR4F21O95013 312 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 SOD1P00441 154 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 NFKBIAP25963 317 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 ITGADQ13349 1161 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 KCNJ9Q92806 393 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 PPM1MQ96MI6 270 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 CSF3RQ99062 836 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 GPR63Q9BZJ6 419 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 GPR27Q9NS67 375 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 KLF15Q9UIH9 416 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 CORINQ9Y5Q5 1042 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 J3QRK9 145 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 PSMD11O00231 422 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 B4GAT1O43505 415 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 UGT2B11O75310 529 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 TSPAN12O95859 305 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 CST1P01037 141 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 SYPP08247 313 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 AKT1P31749 480 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 SPINT3P49223 89 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 AGTR2P50052 363 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 OXA1LQ15070 435 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 SHBQ15464 509 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 UAP1L1Q3KQV9 507 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 PNCKQ6P2M8 343 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 IQCHQ86VS3 1027 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 GPR26Q8NDV2 337 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 OR5K1Q8NHB7 308 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 FBXL8Q96CD0 374 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 MBOAT4Q96T53 435 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 USP22Q9UPT9 525 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-201ENST00000246533 ORC6Q9Y5N6 252 aa25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms