RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 MLF1P58340 268 aa15.34■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 GPR85P60893 370 aa15.34■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 PTK6Q13882 451 aa15.34■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 ITIH4Q14624 930 aa15.34■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 SPA17Q15506 151 aa15.34■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa15.34■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC181Q5TID7 509 aa15.34■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 PAOXQ6QHF9 649 aa15.34■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 LRRC8AQ8IWT6 810 aa15.34■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 LRRC57Q8N9N7 239 aa15.34■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 CFAP61Q8NHU2 1237 aa15.34■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 CREB3L4Q8TEY5 395 aa15.34■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 SMC6Q96SB8 1091 aa15.34■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 LPAR4Q99677 370 aa15.34■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 DPH7Q9BTV6 452 aa15.34■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 ARNT2Q9HBZ2 717 aa15.34■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 HEATR5AQ86XA9 2040 aa15.34■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 NCKAP5O14513 1909 aa15.33■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 ROS1P08922 2347 aa15.33■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 CLCA1A8K7I4 914 aa15.33■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 HRGP04196 525 aa15.33■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 XCR1P46094 333 aa15.33■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 ASCL1P50553 236 aa15.33■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP15.33■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP1-1Q07627 177 aa15.33■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 NAA25Q14CX7 972 aa15.33■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa15.33■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 KCTD11Q693B1 232 aa15.33■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 PCGF5Q86SE9 256 aa15.33■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 ARMC10Q8N2F6 343 aa15.33■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 OR9A4Q8NGU2 314 aa15.33■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 OR2A5Q96R48 311 aa15.33■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 TBL1YQ9BQ87 522 aa15.33■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 LACRTQ9GZZ8 138 aa15.33■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 LIPGQ9Y5X9 500 aa15.33■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 CR1P17927 2039 aa15.33■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 DOCK7Q96N67 2140 aa15.32■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa15.32■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 GRID2IPA4D2P6 1211 aa15.32■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 BTNL10A8MVZ5 291 aa15.32■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 H0YIG0 161 aa15.32■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 GPC4O75487 556 aa15.32■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 CCR7P32248 378 aa15.32■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 AVPR1BP47901 424 aa15.32■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 SPARCL1Q14515 664 aa15.32■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 CCSMST1Q4G0I0 132 aa15.32■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 PODNL1Q6PEZ8 512 aa15.32■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 PRSS41Q7RTY9 318 aa15.32■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 PANX2Q96RD6 677 aa15.32■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 PIP5K1AQ99755 562 aa15.32■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 KCNF1Q9H3M0 494 aa15.32■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 DEPPQ9NTK1 212 aa15.32■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 USF3Q68DE3 2245 aa15.32■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 TUBAL3A6NHL2 446 aa15.31■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 SMPD2O60906 423 aa15.31■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 WDR1O75083 606 aa15.31■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 NSA2O95478 260 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 IGHG3P01860 377 aa15.31■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 OR56A5P0C7T3 313 aa15.31■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 BMP7P18075 431 aa15.31■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 RWDD2BP57060 319 aa15.31■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 RHAGQ02094 409 aa15.31■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 HSPA14Q0VDF9 509 aa15.31■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 PRPSAP1Q14558 356 aa15.31■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 ABRAXAS2Q15018 415 aa15.31■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 CATSPEREQ5SY80 951 aa15.31■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 C1orf185Q5T7R7 199 aa15.31■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 RAD9BQ6WBX8 426 aa15.31■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 MDGA2Q7Z553 956 aa15.31■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 OR51Q1Q8NH59 317 aa15.31■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa15.31■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 TSLPQ969D9 159 aa15.31■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 FERMT1Q9BQL6 677 aa15.31■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 PINLYPA6NC86 204 aa15.3■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 FAM166BA8MTA8 275 aa15.3■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa15.3■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 STK10O94804 968 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 CMPK1P30085 196 aa15.3■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 BDKRB1P46663 353 aa15.3■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 PPIAP62937 165 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF425Q6IV72 752 aa15.3■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa15.3■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 RAD51AP1Q96B01 352 aa15.3■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa15.3■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa15.3■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 ACAT2Q9BWD1 397 aa15.3■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 HCN3Q9P1Z3 774 aa15.3■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
SPCS1-201ENST00000233025 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms