RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007722.11

ITGA3-201, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene ITGA3, Length 3,665 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-201ENST00000007722 KCNK5O95279 499 aa12.66□□□□□ -0.38
ITGA3-201ENST00000007722 PSPHP78330 225 aa12.66□□□□□ -0.38
ITGA3-201ENST00000007722 IL10RBQ08334 325 aa12.66□□□□□ -0.38
ITGA3-201ENST00000007722 SLC39A12Q504Y0 691 aa12.66□□□□□ -0.38
ITGA3-201ENST00000007722 BBS7Q8IWZ6 715 aa12.66□□□□□ -0.38
ITGA3-201ENST00000007722 STK40Q8N2I9 435 aa12.66□□□□□ -0.38
ITGA3-201ENST00000007722 SH3KBP1Q96B97 665 aa12.66□□□□□ -0.38
ITGA3-201ENST00000007722 RNF31Q96EP0 1072 aa12.66□□□□□ -0.38
ITGA3-201ENST00000007722 APIPQ96GX9 242 aa12.66□□□□□ -0.38
ITGA3-201ENST00000007722 HDHD2Q9H0R4 259 aa12.66□□□□□ -0.38
ITGA3-201ENST00000007722 GLTPQ9NZD2 209 aa12.66□□□□□ -0.38
ITGA3-201ENST00000007722 SH3BP4Q9P0V3 963 aa12.66□□□□□ -0.38
ITGA3-201ENST00000007722 ACPPP15309 386 aa12.65□□□□□ -0.38
ITGA3-201ENST00000007722 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
ITGA3-201ENST00000007722 CCL23P55773 120 aa12.65□□□□□ -0.38
ITGA3-201ENST00000007722 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP12.65□□□□□ -0.38
ITGA3-201ENST00000007722 SAXO2Q658L1 398 aa12.65□□□□□ -0.38
ITGA3-201ENST00000007722 FAHD1Q6P587 224 aa12.65□□□□□ -0.38
ITGA3-201ENST00000007722 VN1R5Q7Z5H4 357 aa12.65□□□□□ -0.38
ITGA3-201ENST00000007722 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
ITGA3-201ENST00000007722 PLCZ1Q86YW0 608 aa12.65□□□□□ -0.38
ITGA3-201ENST00000007722 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
ITGA3-201ENST00000007722 GALNT6Q8NCL4 622 aa12.65□□□□□ -0.38
ITGA3-201ENST00000007722 OR6C4Q8NGE1 309 aa12.65□□□□□ -0.38
ITGA3-201ENST00000007722 C8orf48Q96LL4 319 aa12.65□□□□□ -0.38
ITGA3-201ENST00000007722 BOCQ9BWV1 1114 aa12.65□□□□□ -0.38
ITGA3-201ENST00000007722 TMEM45AQ9NWC5 275 aa12.65□□□□□ -0.38
ITGA3-201ENST00000007722 OSER1Q9NX31 292 aa12.65□□□□□ -0.38
ITGA3-201ENST00000007722 ARL15Q9NXU5 204 aa12.65□□□□□ -0.38
ITGA3-201ENST00000007722 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
ITGA3-201ENST00000007722 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
ITGA3-201ENST00000007722 LEUTXA8MZ59 168 aa12.65□□□□□ -0.38
ITGA3-201ENST00000007722 TAPBPO15533 448 aa12.65□□□□□ -0.38
ITGA3-201ENST00000007722 TNNI3P19429 210 aa12.65□□□□□ -0.38
ITGA3-201ENST00000007722 CNR2P34972 360 aa12.65□□□□□ -0.38
ITGA3-201ENST00000007722 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
ITGA3-201ENST00000007722 PRIM2P49643 509 aa12.65□□□□□ -0.38
ITGA3-201ENST00000007722 ACVR1Q04771 509 aa12.65□□□□□ -0.38
ITGA3-201ENST00000007722 MAB21L1Q13394 359 aa12.65□□□□□ -0.38
ITGA3-201ENST00000007722 C5orf22Q49AR2 442 aa12.65□□□□□ -0.38
ITGA3-201ENST00000007722 MZT2BQ6NZ67 158 aa12.65□□□□□ -0.38
ITGA3-201ENST00000007722 ZNF767PQ75MW2 155 aa12.65□□□□□ -0.38
ITGA3-201ENST00000007722 WACQ9BTA9 647 aa12.65□□□□□ -0.38
ITGA3-201ENST00000007722 C3orf14Q9HBI5 128 aa12.65□□□□□ -0.38
ITGA3-201ENST00000007722 EVA1BQ9NVM1 165 aa12.65□□□□□ -0.38
ITGA3-201ENST00000007722 TMEM161AQ9NX61 479 aa12.65□□□□□ -0.38
ITGA3-201ENST00000007722 MAPRE3Q9UPY8 281 aa12.65□□□□□ -0.38
ITGA3-201ENST00000007722 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
ITGA3-201ENST00000007722 FAM227AF5H4B4 570 aa12.65□□□□□ -0.39
ITGA3-201ENST00000007722 CNMDO75829 334 aa12.65□□□□□ -0.39
ITGA3-201ENST00000007722 CLDN9O95484 217 aa12.65□□□□□ -0.39
ITGA3-201ENST00000007722 MMP3P08254 477 aa12.65□□□□□ -0.39
ITGA3-201ENST00000007722 SDC1P18827 310 aa12.65□□□□□ -0.39
ITGA3-201ENST00000007722 HOXC13P31276 330 aa12.65□□□□□ -0.39
ITGA3-201ENST00000007722 GZMMP51124 257 aa12.65□□□□□ -0.39
ITGA3-201ENST00000007722 CLDN8P56748 225 aa12.65□□□□□ -0.39
ITGA3-201ENST00000007722 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.39
ITGA3-201ENST00000007722 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.39
ITGA3-201ENST00000007722 DDI2Q5TDH0 399 aa12.65□□□□□ -0.39
ITGA3-201ENST00000007722 PAQR6Q6TCH4 344 aa12.65□□□□□ -0.39
ITGA3-201ENST00000007722 SBSNQ6UWP8 590 aa12.65□□□□□ -0.39
ITGA3-201ENST00000007722 IDO2Q6ZQW0 420 aa12.65□□□□□ -0.39
ITGA3-201ENST00000007722 CBLL1Q75N03 491 aa12.65□□□□□ -0.39
ITGA3-201ENST00000007722 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP12.65□□□□□ -0.39
ITGA3-201ENST00000007722 PHC2Q8IXK0 858 aa12.65□□□□□ -0.39
ITGA3-201ENST00000007722 OR4M1Q8NGD0 313 aa12.65□□□□□ -0.39
ITGA3-201ENST00000007722 NACC2Q96BF6 587 aa12.65□□□□□ -0.39
ITGA3-201ENST00000007722 SIGLEC11Q96RL6 698 aa12.65□□□□□ -0.39
ITGA3-201ENST00000007722 FAM129BQ96TA1 746 aa12.65□□□□□ -0.39
ITGA3-201ENST00000007722 TPT1P8Q9HAU6 139 aa12.65□□□□□ -0.39
ITGA3-201ENST00000007722 ASAH2Q9NR71 780 aa12.65□□□□□ -0.39
ITGA3-201ENST00000007722 POFUT2Q9Y2G5 429 aa12.65□□□□□ -0.39
ITGA3-201ENST00000007722 NINQ8N4C6 2090 aa12.65□□□□□ -0.39
ITGA3-201ENST00000007722 RRN3P2A6NIE6 340 aa12.64□□□□□ -0.39
ITGA3-201ENST00000007722 STK16O75716 305 aa12.64□□□□□ -0.39
ITGA3-201ENST00000007722 PDGFAP04085 211 aa12.64□□□□□ -0.39
ITGA3-201ENST00000007722 PRKAR1AP10644 381 aa12.64□□□□□ -0.39
ITGA3-201ENST00000007722 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
ITGA3-201ENST00000007722 ITPKAP23677 461 aa12.64□□□□□ -0.39
ITGA3-201ENST00000007722 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
ITGA3-201ENST00000007722 SERINC3Q13530 473 aa12.64□□□□□ -0.39
ITGA3-201ENST00000007722 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
ITGA3-201ENST00000007722 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
ITGA3-201ENST00000007722 DUOXA1Q1HG43 343 aa12.64□□□□□ -0.39
ITGA3-201ENST00000007722 TAPT1Q6NXT6 567 aa12.64□□□□□ -0.39
ITGA3-201ENST00000007722 TMC8Q8IU68 726 aa12.64□□□□□ -0.39
ITGA3-201ENST00000007722 THEM5Q8N1Q8 247 aa12.64□□□□□ -0.39
ITGA3-201ENST00000007722 OR52E4Q8NGH9 312 aa12.64□□□□□ -0.39
ITGA3-201ENST00000007722 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
ITGA3-201ENST00000007722 KCNJ9Q92806 393 aa12.64□□□□□ -0.39
ITGA3-201ENST00000007722 CD244Q9BZW8 370 aa12.64□□□□□ -0.39
ITGA3-201ENST00000007722 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
ITGA3-201ENST00000007722 A0A075B6Q4 140 aa12.64□□□□□ -0.39
ITGA3-201ENST00000007722 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa12.64□□□□□ -0.39
ITGA3-201ENST00000007722 WASHC1A8K0Z3 465 aa12.64□□□□□ -0.39
ITGA3-201ENST00000007722 ISM1B1AKI9 464 aa12.64□□□□□ -0.39
ITGA3-201ENST00000007722 ADAMDEC1O15204 470 aa12.64□□□□□ -0.39
ITGA3-201ENST00000007722 SH3BP5O60239 455 aa12.64□□□□□ -0.39
ITGA3-201ENST00000007722 ZNF250P15622 560 aa12.64□□□□□ -0.39
ITGA3-201ENST00000007722 SEMG2Q02383 582 aa12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms