RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000209256.1

Ptpre-202, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptpre, Length 2,593 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Gm21964A0A1W2P7S4 437 aa20.14■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 1700001O22RikA2APZ1 375 aa20.14■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Znf382B2RXC5 579 aa20.14■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 8030474K03RikE9Q4Y8 554 aa20.14■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 MbP04247 154 aa20.14■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Sat1P48026 171 aa20.14■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 KrtdapQ3V2T4 102 aa20.14■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Nfe2l1Q61985 741 aa20.14■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Dnajc15Q78YY6 149 aa20.14■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Q80Y39 304 aa20.14■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Kctd20Q8CDD8 419 aa20.14■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 SrrdQ8K2M3 249 aa20.14■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Olfr665Q8VG79 316 aa20.14■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Uts2rQ8VIH9 385 aa20.14■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 CacybpQ9CXW3 229 aa20.14■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Ola1Q9CZ30 396 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Rps19Q9CZX8 145 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Psg23Q9D2U0 471 aa20.14■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Psg21Q9DAV5 471 aa20.14■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Nif3l1Q9EQ80 376 aa20.14■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Shisa8J3QNX5 399 aa20.13■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Rgs5O08850 181 aa20.13■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Mybpc3O70468 1270 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Cav3P51637 151 aa20.13■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Znf800Q0VEE6 662 aa20.13■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Slc30a1Q60738 503 aa20.13■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Klhl5Q6PFE1 708 aa20.13■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Fam109aQ8BH49 266 aa20.13■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Fam131aQ8BWU3 361 aa20.13■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Samd3Q8C4H2 520 aa20.13■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Ly6g5cQ8K1T5 149 aa20.13■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Myl9Q9CQ19 172 aa20.13■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Mfsd13bA0A1L1SUA2 455 aa20.13■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Olfr1023A2ASU6 311 aa20.13■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Slc22a8O88909 537 aa20.13■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Hoxc5P32043 222 aa20.13■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Nkx3-2P97503 333 aa20.13■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Usp39Q3TIX9 564 aa20.13■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Eif2b4Q61749 524 aa20.13■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Pea15Q62048 130 aa20.13■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Ces5aQ6AW46 575 aa20.13■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Cyth4Q80YW0 393 aa20.13■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Atg10Q8R1P4 215 aa20.13■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Nudt4Q8R2U6 179 aa20.13■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Tspan33Q8R3S2 283 aa20.13■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Olfr444Q8VFS6 310 aa20.13■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Olfr348Q8VGK3 313 aa20.13■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Smg9Q9DB90 520 aa20.13■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Phc2Q9QWH1 850 aa20.13■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Foxe3Q9QY14 288 aa20.13■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Nfkb2Q9WTK5 899 aa20.13■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Zfp964B2RR88 472 aa20.12■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Bcl7cO08664 217 aa20.12■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Neurod4O09105 330 aa20.12■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 MaffO54791 156 aa20.12■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 P01665 111 aa20.12■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 P01666 111 aa20.12■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 F9P16294 471 aa20.12■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 AcadvlP50544 656 aa20.12■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Zbtb2Q3V3W4 514 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Hmgcs1Q8JZK9 520 aa20.12■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 CcsapQ8QZT2 252 aa20.12■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Olfr622Q8VGY7 317 aa20.12■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Cyp4f3Q99N16 524 aa20.12■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Kdelr2Q9CQM2 212 aa20.12■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Tmem269Q9D4Y8 254 aa20.12■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Prokr1Q9JKL1 393 aa20.12■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Zfp600A2A7V0 737 aa20.12■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Gm13089A2AGW7 455 aa20.12■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 NsmafO35242 920 aa20.12■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Crybb2P62696 205 aa20.12■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Pyroxd2Q3U4I7 581 aa20.12■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Ska3Q8C263 411 aa20.12■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Abhd4Q8VD66 342 aa20.12■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Sdcbp2Q99JZ0 292 aa20.12■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Moxd1Q9CXI3 613 aa20.12■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Hspb11Q9D6H2 143 aa20.12■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Gm28048F7BCN0 99 aa20.11■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Vmn1r25H3BLP0 302 aa20.11■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Elovl3O35949 271 aa20.11■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 TfamP40630 243 aa20.11■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Gp1bbP56400 206 aa20.11■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Cdkn2cQ60772 168 aa20.11■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Slc7a6Q8BGK6 515 aa20.11■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Elp2Q91WG4 831 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Psat1Q99K85 370 aa20.11■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Tnk1Q99ML2 666 aa20.11■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Gbe1Q9D6Y9 702 aa20.11■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Pop5Q9DB28 169 aa20.11■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Khdrbs3Q9R226 346 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Smarcb1Q9Z0H3 385 aa20.11■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Gm6811E9Q3Y8 510 aa20.11■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 TspearJ3S6Y1 670 aa20.11■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Gm3159K7N760 267 aa20.11■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Gm17174M0QWQ9 212 aa20.11■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Csf2rbP26955 896 aa20.11■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 MatkP41242 505 aa20.11■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Stat6P52633 837 aa20.11■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Mkl2P59759 1080 aa20.11■□□□□ 0.81
Ptpre-202ENSMUST00000209256 D13Ertd608eQ3UPR8 151 aa20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 22.4 ms