RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636621.1

LINC00598-211, long intergenic non-protein coding RNA 598, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LINC00598, Length 3,241 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00598-211ENST00000636621 PTSQ03393 145 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 RBBP4Q09028 425 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 TPRG1LQ5T0D9 272 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 RNLSQ5VYX0 342 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 GRHL2Q6ISB3 625 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 ZNF367Q7RTV3 350 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 TAS1R1Q7RTX1 841 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 ATCAYQ86WG3 371 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 DEPDC4Q8N2C3 294 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 ZNF675Q8TD23 568 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 LMLNQ96KR4 655 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 COPS8Q99627 209 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 CCDC32Q9BV29 185 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 FZD3Q9NPG1 666 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 ABCB8Q9NUT2 735 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 TMEM184CQ9NVA4 438 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 ADPRHL2Q9NX46 363 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 ZNF226Q9NYT6 803 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 ZNF232Q9UNY5 417 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 DSPPQ9NZW4 1301 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 TET1Q8NFU7 2136 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 K7ERQ8 282 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 TSPAN3O60637 253 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 SLCO2B1O94956 709 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 DIRAS1O95057 198 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 C1SP09871 688 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 S100A1P23297 94 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 RRM2P31350 389 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 GPNMBQ14956 572 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 MICAQ29983 383 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 ANXA8L1Q5VT79 327 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 AKAP14Q86UN6 197 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 SYT12Q8IV01 421 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 P3H2Q8IVL5 708 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 CPXM2Q8N436 756 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 IL17RCQ8NAC3 791 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 P2RY13Q9BPV8 354 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 RACGAP1Q9H0H5 632 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 C3orf14Q9HBI5 128 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 PCDH12Q9NPG4 1184 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 RASSF1Q9NS23 344 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 GPATCH2Q9NW75 528 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 ENOPH1Q9UHY7 261 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 FZD4Q9ULV1 537 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 SLC35F4A4IF30 521 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 C2orf78A6NCI8 922 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 SGTAO43765 313 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 GSTM1P09488 218 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 LAMP1P11279 417 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 CYP2A7P20853 494 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 SERPINA4P29622 427 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 HNF4AP41235 474 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 ALDH9A1P49189 494 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 CLK1P49759 484 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 ACLYP53396 1101 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 TPTEP56180 551 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 DCDC1P59894 354 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 FCHO2Q0JRZ9 810 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 SLC13A2Q13183 592 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 PDE7AQ13946 482 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 CRB2Q5IJ48 1285 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 TPGS2Q68CL5 300 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 NPAS3Q8IXF0 933 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 SLC22A15Q8IZD6 547 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 IL17RDQ8NFM7 739 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 SETD6Q8TBK2 473 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 ATL1Q8WXF7 558 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 PROX1Q92786 737 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 TP53INP1Q96A56 240 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 FEVQ99581 238 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 MYOCQ99972 504 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 SYT17Q9BSW7 474 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 DUSP26Q9BV47 211 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 QPCTLQ9NXS2 382 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 ATP6V1HQ9UI12 483 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 KCND3Q9UK17 655 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00598-211ENST00000636621 SLC22A14Q9Y267 594 aa6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.3 ms