RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623196.1

C9orf139-202, Transcript of chromosome 9 open reading frame 139, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene C9orf139, Length 4,990 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf139-202ENST00000623196 PRSS58Q8IYP2 241 aa14.48□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 ALPK1Q96QP1 1244 aa14.48□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa14.48□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 TMEM150CB9EJG8 249 aa14.48□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 C9IYK1 514 aa14.48□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 PRMT3O60678 531 aa14.48□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 RFPL1O75677 317 aa14.48□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 LHCGRP22888 699 aa14.48□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 GJA9P57773 515 aa14.48□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 SEMG2Q02383 582 aa14.48□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 EMX2Q04743 252 aa14.48□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 LRRC32Q14392 662 aa14.48□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 CEACAM20Q6UY09 585 aa14.48□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 ZNF101Q8IZC7 436 aa14.48□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 CMTM7Q96FZ5 175 aa14.48□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 SIGLEC10Q96LC7 697 aa14.48□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 LCHNA4D1U4 455 aa14.47□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 LOC730098B7Z3J9 87 aa14.47□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 RGMBQ6NW40 437 aa14.47□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 ABCB8Q9NUT2 735 aa14.47□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 H7C2Y5 167 aa14.47□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 PCLAFQ15004 111 aa14.47□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 TGFBIQ15582 683 aa14.47□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 TIGD5Q53EQ6 642 aa14.47□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 ADGRF1Q5T601 910 aa14.47□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 FBXL22Q6P050 247 aa14.47□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 PSKH2Q96QS6 385 aa14.47□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 TM9SF2Q99805 663 aa14.47□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 HTATIP2Q9BUP3 242 aa14.47□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 XKR8Q9H6D3 395 aa14.47□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 ENAMQ9NRM1 1142 aa14.47□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 LAMB4A4D0S4 1761 aa14.47□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa14.47□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 J3QLW9 94 aa14.47□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 SNAPC5O75971 98 aa14.47□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 RPP14O95059 124 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 CLIC3O95833 236 aa14.47□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 KLK1P06870 262 aa14.47□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 GNAO1P09471 354 aa14.47□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 ZNF19P17023 458 aa14.47□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 MAN2A2P49641 1150 aa14.47□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 TMBIM6P55061 237 aa14.47□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 VITQ6UXI7 678 aa14.47□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 TMED4Q7Z7H5 227 aa14.47□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 CEP97Q8IW35 865 aa14.47□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 KIAA1191Q96A73 305 aa14.47□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 ISOC1Q96CN7 298 aa14.47□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 CYP2S1Q96SQ9 504 aa14.47□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 TSSK6Q9BXA6 273 aa14.47□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 NEUROD4Q9HD90 331 aa14.47□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 TIGARQ9NQ88 270 aa14.47□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa14.47□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 MYH11P35749 1972 aa14.47□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 CH25HO95992 272 aa14.47□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 CARD16Q5EG05 197 aa14.47□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 PIM3Q86V86 326 aa14.47□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 NPAS4Q8IUM7 802 aa14.47□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 TSPEARQ8WU66 669 aa14.47□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 CREB3L1Q96BA8 519 aa14.47□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 SLC25A36Q96CQ1 311 aa14.47□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 TMEM80Q96HE8 168 aa14.47□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 BCO2Q9BYV7 579 aa14.47□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 SIRPGQ9P1W8 387 aa14.47□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 HCN3Q9P1Z3 774 aa14.47□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 MANBAO00462 879 aa14.46□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 ERI3O43414 337 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 EOMESO95936 686 aa14.46□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 CSF2P04141 144 aa14.46□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 PGGT1BP53609 377 aa14.46□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 MAPK14Q16539 360 aa14.46□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 LRRC73Q5JTD7 316 aa14.46□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa14.46□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 HFE2Q6ZVN8 426 aa14.46□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 ASRGL1Q7L266 308 aa14.46□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa14.46□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 JAGN1Q8N5M9 183 aa14.46□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 FAM46DQ8NEK8 389 aa14.46□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 FBXO22Q8NEZ5 403 aa14.46□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 DHRS1Q96LJ7 313 aa14.46□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 SYT11Q9BT88 431 aa14.46□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa14.46□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa14.46□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 MYH7BA7E2Y1 1941 aa14.46□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa14.46□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 ZNF878C9JN71 531 aa14.46□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 M0R036 132 aa14.46□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 OR7A10O76100 309 aa14.46□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 PTPN2P17706 415 aa14.46□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
C9orf139-202ENST00000623196 CXCR1P25024 350 aa14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms