RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618056.4

PMS1-220, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 1,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-220ENST00000618056 ZNF740Q8NDX6 193 aa23.63■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 MACROD1Q9BQ69 325 aa23.63■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 AIF1LQ9BQI0 150 aa23.63■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 TGIF2Q9GZN2 237 aa23.63■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 ALG9Q9H6U8 611 aa23.63■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 C14orf105Q9NVL8 296 aa23.63■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 WWOXQ9NZC7 414 aa23.63■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 CD274Q9NZQ7 290 aa23.63■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 TRPC4Q9UBN4 977 aa23.63■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 ZFP69BQ9UJL9 534 aa23.63■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 CCDC189A1A4V9 331 aa23.62■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 AGPSO00116 658 aa23.62■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 RHOXF2BP0C7M4 288 aa23.62■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 SERPINB8P50452 374 aa23.62■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 CDC16Q13042 620 aa23.62■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 KCT2Q8NC54 265 aa23.62■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 ATOH8Q96SQ7 321 aa23.62■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 RHOXF2Q9BQY4 288 aa23.62■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 SLC25A23Q9BV35 468 aa23.62■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 CAPS2Q9BXY5 557 aa23.62■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 GPRC5BQ9NZH0 403 aa23.62■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa23.62■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 SLC22A7Q9Y694 548 aa23.62■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 KERAO60938 352 aa23.62■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 INHBAP08476 426 aa23.62■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 SERPINB9P50453 376 aa23.62■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 VWA2Q5GFL6 755 aa23.62■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa23.62■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa23.62■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 OR9A4Q8NGU2 314 aa23.62■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 RHEBL1Q8TAI7 183 aa23.62■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 ISL2Q96A47 359 aa23.62■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 NXNL1Q96CM4 212 aa23.62■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 PAFAH2Q99487 392 aa23.62■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 CRB3Q9BUF7 120 aa23.62■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 NUDT4Q9NZJ9 180 aa23.62■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 IKBKGQ9Y6K9 419 aa23.62■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 NBASA2RRP1 2371 aa23.62■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 SCN2AQ99250 2005 aa23.61■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 K7EM74 188 aa23.61■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 SOCS6O14544 535 aa23.61■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 STK16O75716 305 aa23.61■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 ABHD2P08910 425 aa23.61■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 FAM83EQ2M2I3 478 aa23.61■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 LRRN4CLQ8ND94 238 aa23.61■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 KCTD4Q8WVF5 259 aa23.61■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 DNAJC11Q9NVH1 559 aa23.61■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 ZNF180Q9UJW8 692 aa23.61■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa23.61■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 A0A096LPK6 155 aa23.6■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 NDUFS4O43181 175 aa23.6■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 SUV39H1O43463 412 aa23.6■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 S100BP04271 92 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 TYK2P29597 1187 aa23.6■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 MAGEA12P43365 314 aa23.6■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 HSPA7P48741 367 aa23.6■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 IRF9Q00978 393 aa23.6■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 ATG9BQ674R7 924 aa23.6■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 KIRREL2Q6UWL6 708 aa23.6■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 TAOK1Q7L7X3 1001 aa23.6■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 PRSS41Q7RTY9 318 aa23.6■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa23.6■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 ANKRD53Q8N9V6 530 aa23.6■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 CLEC1AQ8NC01 280 aa23.6■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 NT5CQ8TCD5 201 aa23.6■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 MOCOSQ96EN8 888 aa23.6■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 VPS50Q96JG6 964 aa23.6■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 EHD1Q9H4M9 534 aa23.6■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 ANKHQ9HCJ1 492 aa23.6■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 COPG2Q9UBF2 871 aa23.6■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa23.59■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 IL1RNP18510 177 aa23.59■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 CXCR2P25025 360 aa23.59■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 CNTFP26441 200 aa23.59■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 VARSP26640 1264 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 SOX8P57073 446 aa23.59■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 RGS1Q08116 209 aa23.59■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 HERC3Q15034 1050 aa23.59■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 ACAP2Q15057 778 aa23.59■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 RBBP7Q16576 425 aa23.59■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 ASB18Q6ZVZ8 466 aa23.59■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 LAPTM4BQ86VI4 370 aa23.59■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 TRPV3Q8NET8 790 aa23.59■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 FDCSPQ8NFU4 85 aa23.59■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa23.59■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 YIPF2Q9BWQ6 316 aa23.59■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
PMS1-220ENST00000618056 ANAPC2Q9UJX6 822 aa23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms