RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607941.5

SYT6-202, Transcript of synaptotagmin 6, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SYT6, Length 4,352 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6-202ENST00000607941 PRAP1Q96NZ9 151 aa9.51□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 TTTY10Q9BZA0 68 aa9.51□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 UTS2RQ9UKP6 389 aa9.51□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 KLHL33A6NCF5 533 aa9.5□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 GGT1P19440 569 aa9.5□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 ACRV1P26436 265 aa9.5□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 SEC13P55735 322 aa9.5□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 HTRA3P83110 453 aa9.5□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 COX10Q12887 443 aa9.5□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 IL18Q14116 193 aa9.5□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 C2orf27AQ580R0 203 aa9.5□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 CRB2Q5IJ48 1285 aa9.5□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 CTSL3PQ5NE16 218 aa9.5□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 PLET1Q6UQ28 207 aa9.5□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 MACC1Q6ZN28 852 aa9.5□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 FGD2Q7Z6J4 655 aa9.5□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 WDR48Q8TAF3 677 aa9.5□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 TIFAQ96CG3 184 aa9.5□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 Q96MT0 163 aa9.5□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 QRFPRQ96P65 431 aa9.5□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 GIN1Q9NXP7 522 aa9.5□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 GPR83Q9NYM4 423 aa9.5□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 LEFTY2O00292 366 aa9.5□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 B4GALT3O60512 393 aa9.5□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 MATN4O95460 622 aa9.5□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 DNTTP04053 509 aa9.5□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 RPN2P04844 631 aa9.5□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 NUDT7P0C024 238 aa9.5□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 SAGP10523 405 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 ATF6P18850 670 aa9.5□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 ARL4DP49703 201 aa9.5□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 ATP12AP54707 1039 aa9.5□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 MC1RQ01726 317 aa9.5□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 IQCCQ4KMZ1 466 aa9.5□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 DSG4Q86SJ6 1040 aa9.5□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 ADAMTS15Q8TE58 950 aa9.5□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 RNF31Q96EP0 1072 aa9.5□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 C12orf66Q96MD2 445 aa9.5□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 BRINP2Q9C0B6 783 aa9.5□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 POPDC3Q9HBV1 291 aa9.5□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 NDOR1Q9UHB4 597 aa9.5□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 ZNF232Q9UNY5 417 aa9.5□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 KCNK6Q9Y257 313 aa9.5□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 A0A096LPI6 279 aa9.5□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 E7EQ34 232 aa9.5□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 QSOX1O00391 747 aa9.5□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 SLC22A1O15245 554 aa9.5□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 TEX28O15482 410 aa9.5□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 FCER2P06734 321 aa9.5□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 PRG2P13727 222 aa9.5□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 PFKLP17858 780 aa9.5□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 BMP7P18075 431 aa9.5□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 CXCR2P25025 360 aa9.5□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 RXRGP48443 463 aa9.5□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 ARF5P84085 180 aa9.5□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 NCEH1Q6PIU2 408 aa9.5□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 NDNFQ8TB73 568 aa9.5□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 SLC39A13Q96H72 371 aa9.5□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 PPP1R16AQ96I34 528 aa9.5□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 GAL3ST1Q99999 423 aa9.5□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 FAIM2Q9BWQ8 316 aa9.5□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 ADAP2Q9NPF8 381 aa9.5□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 MS4A12Q9NXJ0 267 aa9.5□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa9.5□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 IL20RAQ9UHF4 553 aa9.5□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 RNF6Q9Y252 685 aa9.5□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 TTC34A8MYJ7 566 aa9.49□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 TNFRSF10BO14763 440 aa9.49□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 FGBP02675 491 aa9.49□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 CYBAP13498 195 aa9.49□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 LAG3P18627 525 aa9.49□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 CLCN2P51788 898 aa9.49□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 HK3P52790 923 aa9.49□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 OLR1P78380 273 aa9.49□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 NEK5Q6P3R8 708 aa9.49□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 CRTC1Q6UUV9 634 aa9.49□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 HACD2Q6Y1H2 254 aa9.49□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 IZUMO1Q8IYV9 350 aa9.49□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 TMEM145Q8NBT3 493 aa9.49□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 OR8J3Q8NGG0 315 aa9.49□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 TADA1Q96BN2 335 aa9.49□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 RHBDF1Q96CC6 855 aa9.49□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 SLC38A2Q96QD8 506 aa9.49□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 ACPTQ9BZG2 426 aa9.49□□□□□ -0.89
SYT6-202ENST00000607941 DOCK5Q9H7D0 1870 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms