RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599560.5

NUP62-216, Transcript of nucleoporin 62, human

TSL 2

Gene NUP62, Length 562 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NUP62-216	ENST00000599560	ARNT2	Q9HBZ2	717 aa		11.3	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	MRPS30	Q9NP92	439 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	PCYOX1	Q9UHG3	505 aa		11.3	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	TSR3	Q9UJK0	312 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	TRHDE	Q9UKU6	1024 aa		11.3	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	ABCA1	O95477	2261 aa		11.29	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	CLCA1	A8K7I4	914 aa		11.29	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560		G3V3Y1	287 aa		11.29	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	QSOX1	O00391	747 aa		11.29	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	RDH16	O75452	317 aa		11.29	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	NSA2	O95478	260 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	RPN2	P04844	631 aa		11.29	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	EPX	P11678	715 aa		11.29	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	ENDOU	P21128	410 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	MSN	P26038	577 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	CMPK1	P30085	196 aa		11.29	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	OR4D2	P58180	307 aa		11.29	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	PPIA	P62937	165 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	PTK6	Q13882	451 aa		11.29	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	POU6F1	Q14863	301 aa		11.29	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	C1orf185	Q5T7R7	199 aa		11.29	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	P3H2	Q8IVL5	708 aa		11.29	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	PLPP5	Q8NEB5	264 aa		11.29	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	OR5T3	Q8NGG3	340 aa		11.29	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	RNASE6	Q93091	150 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	RAD51AP1	Q96B01	352 aa		11.29	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	PEX11G	Q96HA9	241 aa		11.29	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	NAP1L5	Q96NT1	182 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	RAB11FIP5	Q9BXF6	653 aa		11.29	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	UVRAG	Q9P2Y5	699 aa		11.29	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	RAI1	Q7Z5J4	1906 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	DOCK7	Q96N67	2140 aa		11.29	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	ZNF860	A6NHJ4	632 aa		11.28	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	FIGNL2	A6NMB9	653 aa		11.28	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560		H0YIG0	161 aa		11.28	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	ARHGEF9	O43307	516 aa		11.28	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	VPS26A	O75436	327 aa		11.28	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	IGHG3	P01860	377 aa		11.28	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	CYC1	P08574	325 aa		11.28	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	BMP5	P22003	454 aa		11.28	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	PSMA3	P25788	255 aa		11.28	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	BCL6	P41182	706 aa		11.28	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	AVPR1B	P47901	424 aa		11.28	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	CCDC38	Q502W7	563 aa		11.28	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	EEF1AKMT2	Q5JPI9	291 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	ANKRD20A2	Q5SQ80	823 aa		11.28	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	ANKRD20A1	Q5TYW2	823 aa		11.28	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	ANKRD20A3	Q5VUR7	823 aa		11.28	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	LDB1	Q86U70	411 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	CYP4Z2P	Q8N1L4	340 aa		11.28	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	ARMC10	Q8N2F6	343 aa		11.28	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	PPFIBP2	Q8ND30	876 aa		11.28	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	NFAM1	Q8NET5	270 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	ASZ1	Q8WWH4	475 aa		11.28	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	P3H4	Q92791	437 aa		11.28	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	BDH2	Q9BUT1	245 aa		11.28	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	TTTY12	Q9BZ98	90 aa		11.28	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	ALKBH4	Q9NXW9	302 aa		11.28	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	KCMF1	Q9P0J7	381 aa		11.28	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	SPRR3	Q9UBC9	169 aa		11.28	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	SLC2A6	Q9UGQ3	507 aa		11.28	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	TAC3	Q9UHF0	121 aa		11.28	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560	ANK2	Q01484	3957 aa		11.27	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	MROH6	A6NGR9	719 aa		11.27	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	TUBAL3	A6NHL2	446 aa		11.27	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	MAGEB17	A8MXT2	336 aa		11.27	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	BCKDK	O14874	412 aa		11.27	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	PRKN	O60260	465 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	GLS	O94925	669 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	ERG	P11308	486 aa		11.27	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	MAGEA5	P43359	124 aa		11.27	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	ASCL1	P50553	236 aa		11.27	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	TSTA3	Q13630	321 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	FILIP1L	Q4L180	1135 aa		11.27	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	RIPPLY2	Q5TAB7	128 aa		11.27	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	ICE2	Q659A1	982 aa		11.27	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	KCTD11	Q693B1	232 aa		11.27	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	ZNF534	Q76KX8	674 aa		11.27	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	TRIL	Q7L0X0	811 aa		11.27	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	PCGF5	Q86SE9	256 aa		11.27	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	TNIP2	Q8NFZ5	429 aa		11.27	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	OR2M7	Q8NG81	312 aa		11.27	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	OR13J1	Q8NGT2	312 aa		11.27	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	ZCCHC10	Q8TBK6	192 aa		11.27	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	STYX	Q8WUJ0	223 aa		11.27	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	RERG	Q96A58	199 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		11.27	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	SARG	Q9BW04	601 aa		11.27	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	CARD6	Q9BX69	1037 aa		11.27	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	LIN28A	Q9H9Z2	209 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	ZNF223	Q9UK11	482 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	DUSP10	Q9Y6W6	482 aa		11.27	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	USF3	Q68DE3	2245 aa		11.27	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	NIN	Q8N4C6	2090 aa		11.26	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	hCG_1818297	A0A087WSY0	165 aa		11.26	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560		A0A1B0GVC2	190 aa		11.26	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	OR14I1	A6ND48	311 aa		11.26	□□□□□ -0.61
NUP62-216	ENST00000599560	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61

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