RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591471.5

HKR1-223, Transcript of HKR1, GLI-Kruppel zinc finger family member, human

TSL 2 BASIC

Gene HKR1, Length 3,472 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HKR1-223	ENST00000591471	LSAMP	Q13449	338 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	FZD2	Q14332	565 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	NR1D2	Q14995	579 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	SPANXN4	Q5MJ08	99 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	OGFOD3	Q6PK18	319 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	PRR23B	Q6ZRT6	265 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471		Q6ZSR6	202 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	TRIM46	Q7Z4K8	759 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	SLC22A18AS	Q8N1D0	253 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	PGBD3	Q8N328	593 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	FBXL6	Q8N531	539 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	TRIML2	Q8N7C3	387 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	OR9A1P	Q8NGU1	263 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	CLHC1	Q8NHS4	586 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	SKA2	Q8WVK7	121 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	ZNF583	Q96ND8	569 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	ZBTB18	Q99592	522 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	PRRX2	Q99811	253 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	CHID1	Q9BWS9	393 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	DPY30	Q9C005	99 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	KCNH6	Q9H252	994 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	TRIT1	Q9H3H1	467 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	ACTR8	Q9H981	624 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	POT1	Q9NUX5	634 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	C2orf42	Q9NWW7	574 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	SIRT5	Q9NXA8	310 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	ADGRE2	Q9UHX3	823 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	MAGEL2	Q9UJ55	1249 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	COLEC10	Q9Y6Z7	277 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	PCDH15	Q96QU1	1955 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	KRT87P	A6NCN2	255 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	PABPN1L	A6NDY0	278 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	MTX2	O75431	263 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	CLIC3	O95833	236 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	LDLR	P01130	860 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	HSD3B1	P14060	373 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	HSD3B2	P26439	372 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	MAP4	P27816	1152 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	CDH15	P55291	814 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	MAD2L1	Q13257	205 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	LAPTM5	Q13571	262 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	TEAD4	Q15561	434 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	MAPKAPK3	Q16644	382 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	ALG11	Q2TAA5	492 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	DNAJC14	Q6Y2X3	702 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	VRK3	Q8IV63	474 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	GTF2H4	Q92759	462 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	USP7	Q93009	1102 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	VPS50	Q96JG6	964 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	HAUS8	Q9BT25	410 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	VCX3A	Q9NNX9	186 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	ASIC5	Q9NY37	505 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	PCDHGA5	Q9Y5G8	931 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	POM121B	A6NF01	834 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	TMEM202	A6NGA9	273 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	OR2AG2	A6NM03	316 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471		H3BSA7	217 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	TLR4	O00206	839 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	SEC24D	O94855	1032 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	PDYN	P01213	254 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	FUCA1	P04066	466 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	AFF3	P51826	1226 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	ADRM1	Q16186	407 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	CLPP	Q16740	277 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	SLC36A3	Q495N2	470 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	CACHD1	Q5VU97	1274 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	TBPL2	Q6SJ96	375 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	NRROS	Q86YC3	692 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	RIMKLA	Q8IXN7	391 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	CFAP206	Q8IYR0	622 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	OR8J3	Q8NGG0	315 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	OR2L8	Q8NGY9	312 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	MAGEE2	Q8TD90	523 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	CYGB	Q8WWM9	190 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	TMIGD2	Q96BF3	282 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	PYCR2	Q96C36	320 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	FBXL20	Q96IG2	436 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	THUMPD3	Q9BV44	507 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	ACPT	Q9BZG2	426 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	CHRNA10	Q9GZZ6	450 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	RAB33B	Q9H082	229 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	IKZF5	Q9H5V7	419 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	PELI2	Q9HAT8	420 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	TM9SF3	Q9HD45	589 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	C1orf109	Q9NX04	203 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	NIPSNAP3A	Q9UFN0	247 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	OR1A2	Q9Y585	309 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	CDH23	Q9H251	3354 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	ARHGEF33	A8MVX0	844 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	CCNDBP1	O95273	360 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	KRT6A	P02538	564 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	KRT6B	P04259	564 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	PGR	P06401	933 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	ANXA6	P08133	673 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	SLC35G4	P0C7Q5	338 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HKR1-223	ENST00000591471	BCKDHA	P12694	445 aa		7.26	□□□□□ -1.25

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